RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426608.5

PTGS1-204, Transcript of prostaglandin-endoperoxide synthase 1, humanhuman

TSL 5

Gene PTGS1, Length 468 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1-204ENST00000426608 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.15■■■□□ 2.74
PTGS1-204ENST00000426608 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.49■■■□□ 2.15
PTGS1-204ENST00000426608 ABCC9O60706 1549 aa27.58■■■□□ 2.01
PTGS1-204ENST00000426608 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
PTGS1-204ENST00000426608 NACADO15069 1562 aa26.72■■□□□ 1.87
PTGS1-204ENST00000426608 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.72■■□□□ 1.87
PTGS1-204ENST00000426608 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.67■■□□□ 1.86
PTGS1-204ENST00000426608 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.65■■□□□ 1.86
PTGS1-204ENST00000426608 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.53■■□□□ 1.84
PTGS1-204ENST00000426608 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.11■■□□□ 1.77
PTGS1-204ENST00000426608 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.95■■□□□ 1.75
PTGS1-204ENST00000426608 SCRIBQ14160 1630 aa25.92■■□□□ 1.74
PTGS1-204ENST00000426608 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.79■■□□□ 1.72
PTGS1-204ENST00000426608 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.67■■□□□ 1.7
PTGS1-204ENST00000426608 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.23■■□□□ 1.63
PTGS1-204ENST00000426608 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
PTGS1-204ENST00000426608 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.02■■□□□ 1.6
PTGS1-204ENST00000426608 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.01■■□□□ 1.59
PTGS1-204ENST00000426608 SMARCA4P51532 1647 aa24.88■■□□□ 1.57
PTGS1-204ENST00000426608 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
PTGS1-204ENST00000426608 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.78■■□□□ 1.56
PTGS1-204ENST00000426608 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.71■■□□□ 1.55
PTGS1-204ENST00000426608 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.71■■□□□ 1.55
PTGS1-204ENST00000426608 NCAPD3P42695 1498 aa24.7■■□□□ 1.54
PTGS1-204ENST00000426608 SMARCA2P51531 1590 aa24.65■■□□□ 1.54
PTGS1-204ENST00000426608 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
PTGS1-204ENST00000426608 HMGXB3Q12766 1538 aa24.57■■□□□ 1.52
PTGS1-204ENST00000426608 WIZO95785 1651 aa24.49■■□□□ 1.51
PTGS1-204ENST00000426608 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
PTGS1-204ENST00000426608 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
PTGS1-204ENST00000426608 NESP48681 1621 aa23.98■■□□□ 1.43
PTGS1-204ENST00000426608 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.97■■□□□ 1.43
PTGS1-204ENST00000426608 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.95■■□□□ 1.43
PTGS1-204ENST00000426608 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.93■■□□□ 1.42
PTGS1-204ENST00000426608 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
PTGS1-204ENST00000426608 CFTRP13569 1480 aa23.87■■□□□ 1.41
PTGS1-204ENST00000426608 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.74■■□□□ 1.39
PTGS1-204ENST00000426608 ERCC6Q03468 1493 aa23.68■■□□□ 1.38
PTGS1-204ENST00000426608 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.68■■□□□ 1.38
PTGS1-204ENST00000426608 PRDM2Q13029 1718 aa23.67■■□□□ 1.38
PTGS1-204ENST00000426608 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.63■■□□□ 1.37
PTGS1-204ENST00000426608 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
PTGS1-204ENST00000426608 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.56■■□□□ 1.36
PTGS1-204ENST00000426608 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.51■■□□□ 1.35
PTGS1-204ENST00000426608 CUX2O14529 1486 aa23.48■■□□□ 1.35
PTGS1-204ENST00000426608 WDR62O43379 1518 aa23.48■■□□□ 1.35
PTGS1-204ENST00000426608 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
PTGS1-204ENST00000426608 TOPBP1Q92547 1522 aa23.3■■□□□ 1.32
PTGS1-204ENST00000426608 ABCC8Q09428 1581 aa23.29■■□□□ 1.32
PTGS1-204ENST00000426608 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.29■■□□□ 1.32
PTGS1-204ENST00000426608 CUX1P39880 1505 aa23.23■■□□□ 1.31
PTGS1-204ENST00000426608 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
PTGS1-204ENST00000426608 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.1■■□□□ 1.29
PTGS1-204ENST00000426608 IFT140Q96RY7 1462 aa23.09■■□□□ 1.29
PTGS1-204ENST00000426608 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.08■■□□□ 1.29
PTGS1-204ENST00000426608 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.08■■□□□ 1.29
PTGS1-204ENST00000426608 SYNJ1O43426 1573 aa23.08■■□□□ 1.29
PTGS1-204ENST00000426608 TOP2BQ02880 1626 aa23.08■■□□□ 1.28
PTGS1-204ENST00000426608 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.28
PTGS1-204ENST00000426608 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23■■□□□ 1.27
PTGS1-204ENST00000426608 SOGA1O94964 1423 aa22.99■■□□□ 1.27
PTGS1-204ENST00000426608 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
PTGS1-204ENST00000426608 WDR97A6NE52 1622 aa22.93■■□□□ 1.26
PTGS1-204ENST00000426608 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.9■■□□□ 1.26
PTGS1-204ENST00000426608 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
PTGS1-204ENST00000426608 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.85■■□□□ 1.25
PTGS1-204ENST00000426608 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
PTGS1-204ENST00000426608 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.8■■□□□ 1.24
PTGS1-204ENST00000426608 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.73■■□□□ 1.23
PTGS1-204ENST00000426608 GRIN2BQ13224 1484 aa22.71■■□□□ 1.23
PTGS1-204ENST00000426608 PBRM1Q86U86 1689 aa22.67■■□□□ 1.22
PTGS1-204ENST00000426608 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
PTGS1-204ENST00000426608 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.64■■□□□ 1.21
PTGS1-204ENST00000426608 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.62■■□□□ 1.21
PTGS1-204ENST00000426608 TRIM41Q8WV44 630 aa22.61■■□□□ 1.21
PTGS1-204ENST00000426608 KIF27Q86VH2 1401 aa22.58■■□□□ 1.21
PTGS1-204ENST00000426608 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.57■■□□□ 1.2
PTGS1-204ENST00000426608 SYNJ2O15056 1496 aa22.55■■□□□ 1.2
PTGS1-204ENST00000426608 IGF1RP08069 1367 aa22.54■■□□□ 1.2
PTGS1-204ENST00000426608 ADAMTS12P58397 1594 aa22.54■■□□□ 1.2
PTGS1-204ENST00000426608 CHD1O14646 1710 aa22.54■■□□□ 1.2
PTGS1-204ENST00000426608 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa22.52■■□□□ 1.2
PTGS1-204ENST00000426608 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.51■■□□□ 1.19
PTGS1-204ENST00000426608 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.49■■□□□ 1.19
PTGS1-204ENST00000426608 OSCARQ8IYS5 282 aa22.48■■□□□ 1.19
PTGS1-204ENST00000426608 GRIN2AQ12879 1464 aa22.43■■□□□ 1.18
PTGS1-204ENST00000426608 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
PTGS1-204ENST00000426608 CUL7Q14999 1698 aa22.42■■□□□ 1.18
PTGS1-204ENST00000426608 FBLN2P98095 1184 aa22.39■■□□□ 1.17
PTGS1-204ENST00000426608 NUP160Q12769 1436 aa22.38■■□□□ 1.17
PTGS1-204ENST00000426608 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.37■■□□□ 1.17
PTGS1-204ENST00000426608 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.36■■□□□ 1.17
PTGS1-204ENST00000426608 CEP170Q5SW79 1584 aa22.33■■□□□ 1.17
PTGS1-204ENST00000426608 EEA1Q15075 1411 aa22.31■■□□□ 1.16
PTGS1-204ENST00000426608 PRXQ9BXM0 1461 aa22.29■■□□□ 1.16
PTGS1-204ENST00000426608 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.24■■□□□ 1.15
PTGS1-204ENST00000426608 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.23■■□□□ 1.15
PTGS1-204ENST00000426608 SHROOM2Q13796 1616 aa22.2■■□□□ 1.14
PTGS1-204ENST00000426608 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.17■■□□□ 1.14
PTGS1-204ENST00000426608 ARHGEF11O15085 1522 aa22.16■■□□□ 1.14
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