RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426182.2

NME2P1-201, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 2 pseudogene 1, humanhuman

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Gene NME2P1, Length 414 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME2P1-201ENST00000426182 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.43■■■■□ 3.9
NME2P1-201ENST00000426182 ABCC9O60706 1549 aa35.69■■■■□ 3.3
NME2P1-201ENST00000426182 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa35.34■■■■□ 3.25
NME2P1-201ENST00000426182 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.86■■■■□ 3.01
NME2P1-201ENST00000426182 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.83■■■■□ 3.01
NME2P1-201ENST00000426182 NACADO15069 1562 aa33.59■■■□□ 2.97
NME2P1-201ENST00000426182 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.46■■■□□ 2.95
NME2P1-201ENST00000426182 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP33.3■■■□□ 2.92
NME2P1-201ENST00000426182 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.1■■■□□ 2.89
NME2P1-201ENST00000426182 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.91■■■□□ 2.86
NME2P1-201ENST00000426182 BICRAQ9NZM4 1560 aa32.87■■■□□ 2.85
NME2P1-201ENST00000426182 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.59■■■□□ 2.81
NME2P1-201ENST00000426182 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.56■■■□□ 2.8
NME2P1-201ENST00000426182 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.43■■■□□ 2.78
NME2P1-201ENST00000426182 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.21■■■□□ 2.75
NME2P1-201ENST00000426182 SCRIBQ14160 1630 aa32.2■■■□□ 2.75
NME2P1-201ENST00000426182 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.19■■■□□ 2.74
NME2P1-201ENST00000426182 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.08■■■□□ 2.73
NME2P1-201ENST00000426182 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa31.28■■■□□ 2.6
NME2P1-201ENST00000426182 NCAPD3P42695 1498 aa31.09■■■□□ 2.57
NME2P1-201ENST00000426182 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.93■■■□□ 2.54
NME2P1-201ENST00000426182 CUX2O14529 1486 aa30.89■■■□□ 2.53
NME2P1-201ENST00000426182 ERCC6Q03468 1493 aa30.82■■■□□ 2.53
NME2P1-201ENST00000426182 SMARCA2P51531 1590 aa30.76■■■□□ 2.52
NME2P1-201ENST00000426182 SMARCA4P51532 1647 aa30.73■■■□□ 2.51
NME2P1-201ENST00000426182 HMGXB3Q12766 1538 aa30.73■■■□□ 2.51
NME2P1-201ENST00000426182 NESP48681 1621 aa30.6■■■□□ 2.49
NME2P1-201ENST00000426182 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.58■■■□□ 2.49
NME2P1-201ENST00000426182 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.56■■■□□ 2.48
NME2P1-201ENST00000426182 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.48■■■□□ 2.47
NME2P1-201ENST00000426182 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.36■■■□□ 2.45
NME2P1-201ENST00000426182 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.31■■■□□ 2.44
NME2P1-201ENST00000426182 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.25■■■□□ 2.43
NME2P1-201ENST00000426182 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.24■■■□□ 2.43
NME2P1-201ENST00000426182 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.15■■■□□ 2.42
NME2P1-201ENST00000426182 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.04■■■□□ 2.4
NME2P1-201ENST00000426182 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.93■■■□□ 2.38
NME2P1-201ENST00000426182 WIZO95785 1651 aa29.91■■■□□ 2.38
NME2P1-201ENST00000426182 WDR62O43379 1518 aa29.85■■■□□ 2.37
NME2P1-201ENST00000426182 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.75■■■□□ 2.35
NME2P1-201ENST00000426182 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.73■■■□□ 2.35
NME2P1-201ENST00000426182 CFTRP13569 1480 aa29.72■■■□□ 2.35
NME2P1-201ENST00000426182 TRIM41Q8WV44 630 aa29.71■■■□□ 2.35
NME2P1-201ENST00000426182 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.71■■■□□ 2.35
NME2P1-201ENST00000426182 OSCARQ8IYS5 282 aa29.55■■■□□ 2.32
NME2P1-201ENST00000426182 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
NME2P1-201ENST00000426182 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
NME2P1-201ENST00000426182 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.29■■■□□ 2.28
NME2P1-201ENST00000426182 IFT140Q96RY7 1462 aa29.21■■■□□ 2.27
NME2P1-201ENST00000426182 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.18■■■□□ 2.26
NME2P1-201ENST00000426182 PRDM2Q13029 1718 aa29.12■■■□□ 2.25
NME2P1-201ENST00000426182 TOPBP1Q92547 1522 aa29.12■■■□□ 2.25
NME2P1-201ENST00000426182 ABCC8Q09428 1581 aa29.08■■■□□ 2.25
NME2P1-201ENST00000426182 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa28.99■■■□□ 2.23
NME2P1-201ENST00000426182 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa28.99■■■□□ 2.23
NME2P1-201ENST00000426182 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa28.99■■■□□ 2.23
NME2P1-201ENST00000426182 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.95■■■□□ 2.22
NME2P1-201ENST00000426182 ARHGEF11O15085 1522 aa28.94■■■□□ 2.22
NME2P1-201ENST00000426182 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.92■■■□□ 2.22
NME2P1-201ENST00000426182 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
NME2P1-201ENST00000426182 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
NME2P1-201ENST00000426182 CYB5RLQ6IPT4 315 aa28.85■■■□□ 2.21
NME2P1-201ENST00000426182 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.82■■■□□ 2.2
NME2P1-201ENST00000426182 FBLN2P98095 1184 aa28.78■■■□□ 2.2
NME2P1-201ENST00000426182 SOGA1O94964 1423 aa28.74■■■□□ 2.19
NME2P1-201ENST00000426182 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.73■■■□□ 2.19
NME2P1-201ENST00000426182 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
NME2P1-201ENST00000426182 CHD1O14646 1710 aa28.66■■■□□ 2.18
NME2P1-201ENST00000426182 ARAP1Q96P48 1450 aa28.65■■■□□ 2.18
NME2P1-201ENST00000426182 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.59■■■□□ 2.17
NME2P1-201ENST00000426182 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
NME2P1-201ENST00000426182 TRHP20396 242 aaPredicted RBP28.56■■■□□ 2.16
NME2P1-201ENST00000426182 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.55■■■□□ 2.16
NME2P1-201ENST00000426182 WDR97A6NE52 1622 aa28.53■■■□□ 2.16
NME2P1-201ENST00000426182 CUX1P39880 1505 aa28.53■■■□□ 2.16
NME2P1-201ENST00000426182 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.49■■■□□ 2.15
NME2P1-201ENST00000426182 GRIN2BQ13224 1484 aa28.48■■■□□ 2.15
NME2P1-201ENST00000426182 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.46■■■□□ 2.15
NME2P1-201ENST00000426182 SYNJ2O15056 1496 aa28.4■■■□□ 2.14
NME2P1-201ENST00000426182 SYNJ1O43426 1573 aa28.39■■■□□ 2.14
NME2P1-201ENST00000426182 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.35■■■□□ 2.13
NME2P1-201ENST00000426182 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.28■■■□□ 2.12
NME2P1-201ENST00000426182 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
NME2P1-201ENST00000426182 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.17■■■□□ 2.1
NME2P1-201ENST00000426182 PBRM1Q86U86 1689 aa28.16■■■□□ 2.1
NME2P1-201ENST00000426182 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.15■■■□□ 2.1
NME2P1-201ENST00000426182 GRIN2AQ12879 1464 aa28.08■■■□□ 2.09
NME2P1-201ENST00000426182 NUP160Q12769 1436 aa28.05■■■□□ 2.08
NME2P1-201ENST00000426182 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28■■■□□ 2.07
NME2P1-201ENST00000426182 ERCC6L2Q5T890 1561 aa27.99■■■□□ 2.07
NME2P1-201ENST00000426182 TOP2BQ02880 1626 aa27.97■■■□□ 2.07
NME2P1-201ENST00000426182 ADAMTS12P58397 1594 aa27.97■■■□□ 2.07
NME2P1-201ENST00000426182 CEP170Q5SW79 1584 aa27.95■■■□□ 2.07
NME2P1-201ENST00000426182 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.92■■■□□ 2.06
NME2P1-201ENST00000426182 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP27.91■■■□□ 2.06
NME2P1-201ENST00000426182 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.9■■■□□ 2.06
NME2P1-201ENST00000426182 SHROOM2Q13796 1616 aa27.85■■■□□ 2.05
NME2P1-201ENST00000426182 JPH4Q96JJ6 628 aa27.85■■■□□ 2.05
NME2P1-201ENST00000426182 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP27.8■■■□□ 2.04
NME2P1-201ENST00000426182 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP27.61■■■□□ 2.01
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