RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426119.5

SLC5A6-206, Transcript of solute carrier family 5 member 6, humanhuman

TSL 3

Gene SLC5A6, Length 676 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A6-206ENST00000426119 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.39■■■■■ 7.1
SLC5A6-206ENST00000426119 ABCC9O60706 1549 aa53.34■■■■■ 6.13
SLC5A6-206ENST00000426119 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53.21■■■■■ 6.11
SLC5A6-206ENST00000426119 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.64■■■■■ 5.7
SLC5A6-206ENST00000426119 NACADO15069 1562 aa50.26■■■■■ 5.64
SLC5A6-206ENST00000426119 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.16■■■■■ 5.62
SLC5A6-206ENST00000426119 DNAJC5BQ9UF47 199 aa49.96■■■■■ 5.59
SLC5A6-206ENST00000426119 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.66■■■■■ 5.54
SLC5A6-206ENST00000426119 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.58■■■■■ 5.53
SLC5A6-206ENST00000426119 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.51■■■■■ 5.52
SLC5A6-206ENST00000426119 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.27■■■■■ 5.48
SLC5A6-206ENST00000426119 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.26■■■■■ 5.48
SLC5A6-206ENST00000426119 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.94■■■■■ 5.43
SLC5A6-206ENST00000426119 SCRIBQ14160 1630 aa48.69■■■■■ 5.38
SLC5A6-206ENST00000426119 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.4■■■■■ 5.34
SLC5A6-206ENST00000426119 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa48.12■■■■■ 5.29
SLC5A6-206ENST00000426119 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP48.02■■■■■ 5.28
SLC5A6-206ENST00000426119 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.97■■■■■ 5.27
SLC5A6-206ENST00000426119 NCAPD3P42695 1498 aa46.41■■■■■ 5.02
SLC5A6-206ENST00000426119 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.36■■■■■ 5.01
SLC5A6-206ENST00000426119 SMARCA4P51532 1647 aa46.35■■■■■ 5.01
SLC5A6-206ENST00000426119 SMARCA2P51531 1590 aa46.17■■■■■ 4.98
SLC5A6-206ENST00000426119 HMGXB3Q12766 1538 aa46.11■■■■■ 4.97
SLC5A6-206ENST00000426119 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.06■■■■■ 4.96
SLC5A6-206ENST00000426119 ERCC6Q03468 1493 aa45.99■■■■■ 4.95
SLC5A6-206ENST00000426119 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.93■■■■■ 4.94
SLC5A6-206ENST00000426119 NESP48681 1621 aa45.86■■■■■ 4.93
SLC5A6-206ENST00000426119 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.84■■■■■ 4.93
SLC5A6-206ENST00000426119 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.81■■■■■ 4.92
SLC5A6-206ENST00000426119 CUX2O14529 1486 aa45.79■■■■■ 4.92
SLC5A6-206ENST00000426119 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.68■■■■■ 4.9
SLC5A6-206ENST00000426119 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.37■■■■■ 4.85
SLC5A6-206ENST00000426119 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.33■■■■■ 4.85
SLC5A6-206ENST00000426119 WIZO95785 1651 aa45.31■■■■■ 4.84
SLC5A6-206ENST00000426119 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.23■■■■■ 4.83
SLC5A6-206ENST00000426119 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.09■■■■■ 4.81
SLC5A6-206ENST00000426119 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.03■■■■■ 4.8
SLC5A6-206ENST00000426119 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.86■■■■■ 4.77
SLC5A6-206ENST00000426119 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.78■■■■■ 4.76
SLC5A6-206ENST00000426119 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.69■■■■■ 4.74
SLC5A6-206ENST00000426119 WDR62O43379 1518 aa44.66■■■■■ 4.74
SLC5A6-206ENST00000426119 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.62■■■■■ 4.73
SLC5A6-206ENST00000426119 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.59■■■■■ 4.73
SLC5A6-206ENST00000426119 CFTRP13569 1480 aa44.54■■■■■ 4.72
SLC5A6-206ENST00000426119 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.27■■■■■ 4.68
SLC5A6-206ENST00000426119 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.18■■■■■ 4.66
SLC5A6-206ENST00000426119 PRDM2Q13029 1718 aa44.1■■■■■ 4.65
SLC5A6-206ENST00000426119 TRIM41Q8WV44 630 aa43.88■■■■■ 4.62
SLC5A6-206ENST00000426119 TOPBP1Q92547 1522 aa43.76■■■■■ 4.6
SLC5A6-206ENST00000426119 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.74■■■■■ 4.59
SLC5A6-206ENST00000426119 IFT140Q96RY7 1462 aa43.69■■■■■ 4.58
SLC5A6-206ENST00000426119 OSCARQ8IYS5 282 aa43.66■■■■■ 4.58
SLC5A6-206ENST00000426119 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.58■■■■■ 4.57
SLC5A6-206ENST00000426119 ABCC8Q09428 1581 aa43.49■■■■■ 4.55
SLC5A6-206ENST00000426119 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.48■■■■■ 4.55
SLC5A6-206ENST00000426119 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.36■■■■■ 4.53
SLC5A6-206ENST00000426119 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.33■■■■■ 4.53
SLC5A6-206ENST00000426119 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.32■■■■■ 4.523e-6■■■■□ 19.7
SLC5A6-206ENST00000426119 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa43.25■■■■■ 4.51
SLC5A6-206ENST00000426119 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43.25■■■■■ 4.51
SLC5A6-206ENST00000426119 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.25■■■■■ 4.51
SLC5A6-206ENST00000426119 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.22■■■■■ 4.51
SLC5A6-206ENST00000426119 CHD1O14646 1710 aa43.14■■■■■ 4.5
SLC5A6-206ENST00000426119 ARHGEF11O15085 1522 aa43.11■■■■■ 4.49
SLC5A6-206ENST00000426119 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.08■■■■■ 4.49
SLC5A6-206ENST00000426119 CUX1P39880 1505 aa43.07■■■■■ 4.49
SLC5A6-206ENST00000426119 SOGA1O94964 1423 aa43.07■■■■■ 4.49
SLC5A6-206ENST00000426119 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.05■■■■■ 4.48
SLC5A6-206ENST00000426119 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43■■■■■ 4.47
SLC5A6-206ENST00000426119 FBLN2P98095 1184 aa43■■■■■ 4.47
SLC5A6-206ENST00000426119 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.89■■■■■ 4.46
SLC5A6-206ENST00000426119 WDR97A6NE52 1622 aa42.78■■■■■ 4.44
SLC5A6-206ENST00000426119 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.75■■■■■ 4.43
SLC5A6-206ENST00000426119 ARAP1Q96P48 1450 aa42.72■■■■■ 4.43
SLC5A6-206ENST00000426119 GRIN2BQ13224 1484 aa42.69■■■■■ 4.42
SLC5A6-206ENST00000426119 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.67■■■■■ 4.42
SLC5A6-206ENST00000426119 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.61■■■■■ 4.41
SLC5A6-206ENST00000426119 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.61■■■■■ 4.41
SLC5A6-206ENST00000426119 PBRM1Q86U86 1689 aa42.6■■■■■ 4.41
SLC5A6-206ENST00000426119 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.56■■■■■ 4.4
SLC5A6-206ENST00000426119 SYNJ2O15056 1496 aa42.55■■■■■ 4.4
SLC5A6-206ENST00000426119 SYNJ1O43426 1573 aa42.54■■■■■ 4.4
SLC5A6-206ENST00000426119 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.52■■■■■ 4.4
SLC5A6-206ENST00000426119 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.51■■■■■ 4.4
SLC5A6-206ENST00000426119 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.34■■■■■ 4.37
SLC5A6-206ENST00000426119 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.34■■■■■ 4.37
SLC5A6-206ENST00000426119 TOP2BQ02880 1626 aa42.32■■■■■ 4.37
SLC5A6-206ENST00000426119 TRHP20396 242 aaPredicted RBP42.26■■■■■ 4.36
SLC5A6-206ENST00000426119 ADAMTS12P58397 1594 aa42.22■■■■■ 4.35
SLC5A6-206ENST00000426119 GRIN2AQ12879 1464 aa42.17■■■■■ 4.34
SLC5A6-206ENST00000426119 CEP170Q5SW79 1584 aa42.09■■■■■ 4.33
SLC5A6-206ENST00000426119 ERCC6L2Q5T890 1561 aa42.06■■■■■ 4.32
SLC5A6-206ENST00000426119 NUP160Q12769 1436 aa42.02■■■■■ 4.32
SLC5A6-206ENST00000426119 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.01■■■■■ 4.32
SLC5A6-206ENST00000426119 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.96■■■■■ 4.31
SLC5A6-206ENST00000426119 SHROOM2Q13796 1616 aa41.82■■■■■ 4.29
SLC5A6-206ENST00000426119 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP41.63■■■■■ 4.26
SLC5A6-206ENST00000426119 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.62■■■■■ 4.25
SLC5A6-206ENST00000426119 JPH4Q96JJ6 628 aa41.53■■■■■ 4.24
SLC5A6-206ENST00000426119 IGF1RP08069 1367 aa41.47■■■■■ 4.23
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