RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425081.2

PITPNA-AS1-201, PITPNA antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PITPNA-AS1, Length 542 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 NISCHQ9Y2I1 1504 aa43.24■■■■■ 4.51
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 ABCC9O60706 1549 aa38.9■■■■□ 3.82
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa38.8■■■■□ 3.8
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa36.97■■■■□ 3.51
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 NACADO15069 1562 aa36.7■■■■□ 3.46
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 DCAF8L2P0C7V8 631 aa36.59■■■■□ 3.45
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 DNAJC5BQ9UF47 199 aa36.49■■■■□ 3.43
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP36.22■■■■□ 3.39
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 MYO15BQ96JP2 1530 aa36.14■■■■□ 3.38
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 UNC13AQ9UPW8 1703 aa36.12■■■■□ 3.37
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 BICRAQ9NZM4 1560 aa35.89■■■■□ 3.34
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP35.84■■■■□ 3.33
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa35.68■■■■□ 3.3
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 SCRIBQ14160 1630 aa35.43■■■■□ 3.26
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa35.37■■■■□ 3.25
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa35.11■■■■□ 3.21
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 CECR2Q9BXF3 1484 aa35.03■■■■□ 3.2
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP35.02■■■■□ 3.2
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 NCAPD3P42695 1498 aa33.87■■■■□ 3.01
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa33.79■■■■□ 3
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 SMARCA4P51532 1647 aa33.75■■■□□ 2.99
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 SMARCA2P51531 1590 aa33.69■■■□□ 2.98
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 HMGXB3Q12766 1538 aa33.63■■■□□ 2.97
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 ERCC6Q03468 1493 aa33.6■■■□□ 2.97
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP33.57■■■□□ 2.96
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa33.51■■■□□ 2.95
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 CUX2O14529 1486 aa33.5■■■□□ 2.95
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP33.48■■■□□ 2.95
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 NESP48681 1621 aa33.4■■■□□ 2.94
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 PEG3Q9GZU2 1588 aa33.38■■■□□ 2.93
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 MROH2BQ7Z745 1585 aa33.34■■■□□ 2.93
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33.12■■■□□ 2.89
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP33.04■■■□□ 2.88
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa32.95■■■□□ 2.87
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 WIZO95785 1651 aa32.94■■■□□ 2.86
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 PDS5BQ9NTI5 1447 aa32.94■■■□□ 2.86
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 CADPSQ9ULU8 1353 aa32.86■■■□□ 2.85
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 MRC2Q9UBG0 1479 aa32.67■■■□□ 2.82
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.63■■■□□ 2.81
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 WDR62O43379 1518 aa32.58■■■□□ 2.81
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 CEP164Q9UPV0 1460 aa32.55■■■□□ 2.8
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP32.51■■■□□ 2.8
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 FANCD2Q9BXW9 1451 aa32.51■■■□□ 2.79
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 CFTRP13569 1480 aa32.48■■■□□ 2.79
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP32.25■■■□□ 2.75
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 CCDC88BA6NC98 1476 aa32.16■■■□□ 2.74
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 PRDM2Q13029 1718 aa32.13■■■□□ 2.73
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 TRIM41Q8WV44 630 aa32.1■■■□□ 2.73
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 OSCARQ8IYS5 282 aa31.97■■■□□ 2.71
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 TOPBP1Q92547 1522 aa31.89■■■□□ 2.7
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 IFT140Q96RY7 1462 aa31.88■■■□□ 2.69
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP31.86■■■□□ 2.69
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 ABCC8Q09428 1581 aa31.78■■■□□ 2.68
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 DNMBPQ6XZF7 1577 aa31.76■■■□□ 2.67
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP31.68■■■□□ 2.66
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP31.59■■■□□ 2.65
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP31.57■■■□□ 2.64
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa31.57■■■□□ 2.64
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa31.57■■■□□ 2.64
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa31.57■■■□□ 2.64
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP31.56■■■□□ 2.64
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 ARHGEF11O15085 1522 aa31.47■■■□□ 2.63
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa31.46■■■□□ 2.63
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 CHD1O14646 1710 aa31.44■■■□□ 2.62
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 SOGA1O94964 1423 aa31.41■■■□□ 2.62
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 FBLN2P98095 1184 aa31.4■■■□□ 2.62
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP31.38■■■□□ 2.61
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 FGD5Q6ZNL6 1462 aa31.37■■■□□ 2.61
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 CUX1P39880 1505 aa31.34■■■□□ 2.61
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 CYB5RLQ6IPT4 315 aa31.26■■■□□ 2.59
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa31.26■■■□□ 2.59
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 WDR97A6NE52 1622 aa31.24■■■□□ 2.59
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.23■■■□□ 2.59
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 ARAP1Q96P48 1450 aa31.16■■■□□ 2.58
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 GRIN2BQ13224 1484 aa31.14■■■□□ 2.58
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP31.14■■■□□ 2.57
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP31.13■■■□□ 2.57
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 CLASP1Q7Z460 1538 aa31.07■■■□□ 2.56
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 SYNJ1O43426 1573 aa31.05■■■□□ 2.56
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 SYNJ2O15056 1496 aa31.04■■■□□ 2.56
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 GAPVD1Q14C86 1478 aa31.04■■■□□ 2.56
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 PBRM1Q86U86 1689 aa31.02■■■□□ 2.56
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.98■■■□□ 2.55
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa30.95■■■□□ 2.55
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 TRHP20396 242 aaPredicted RBP30.94■■■□□ 2.54
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.87■■■□□ 2.53
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 TOP2BQ02880 1626 aa30.8■■■□□ 2.52
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.8■■■□□ 2.52
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 GRIN2AQ12879 1464 aa30.75■■■□□ 2.51
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 ADAMTS12P58397 1594 aa30.73■■■□□ 2.51
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 CEP170Q5SW79 1584 aa30.64■■■□□ 2.5
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 FHAD1B1AJZ9 1412 aa30.64■■■□□ 2.49
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 NUP160Q12769 1436 aa30.64■■■□□ 2.49
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 ERCC6L2Q5T890 1561 aa30.61■■■□□ 2.49
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 ERICH3Q5RHP9 1530 aa30.6■■■□□ 2.49
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 SHROOM2Q13796 1616 aa30.48■■■□□ 2.47
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP30.36■■■□□ 2.45
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 JPH4Q96JJ6 628 aa30.33■■■□□ 2.45
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa30.3■■■□□ 2.44
PITPNA-AS1-201ENST00000425081 KIF27Q86VH2 1401 aa30.22■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 102.2 ms