RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424720.6

GALNT9-204, Transcript of polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 9, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene GALNT9, Length 1,693 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALNT9-204ENST00000424720 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.82■■■■■ 6.85
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GALNT9-204ENST00000424720 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.71■■■■■ 5.23
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GALNT9-204ENST00000424720 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.71■■■■■ 4.75
GALNT9-204ENST00000424720 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.62■■■■■ 4.73
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GALNT9-204ENST00000424720 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.32■■■■■ 4.68
GALNT9-204ENST00000424720 SMARCA2P51531 1590 aa44.27■■■■■ 4.68
GALNT9-204ENST00000424720 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.21■■■■■ 4.67
GALNT9-204ENST00000424720 WIZO95785 1651 aa44.19■■■■■ 4.66
GALNT9-204ENST00000424720 NCAPD3P42695 1498 aa44.15■■■■■ 4.66
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GALNT9-204ENST00000424720 NESP48681 1621 aa43■■■■■ 4.47
GALNT9-204ENST00000424720 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.94■■■■■ 4.47
GALNT9-204ENST00000424720 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.88■■■■■ 4.46
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GALNT9-204ENST00000424720 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.6■■■■■ 4.41
GALNT9-204ENST00000424720 ERCC6Q03468 1493 aa42.56■■■■■ 4.4
GALNT9-204ENST00000424720 PRDM2Q13029 1718 aa42.52■■■■■ 4.4
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GALNT9-204ENST00000424720 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.47■■■■■ 4.39
GALNT9-204ENST00000424720 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.34■■■■■ 4.37
GALNT9-204ENST00000424720 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.12■■■■■ 4.33
GALNT9-204ENST00000424720 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.12■■■■■ 4.33
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GALNT9-204ENST00000424720 WDR62O43379 1518 aa41.94■■■■■ 4.3
GALNT9-204ENST00000424720 ABCC8Q09428 1581 aa41.91■■■■■ 4.3
GALNT9-204ENST00000424720 TOPBP1Q92547 1522 aa41.86■■■■■ 4.29
GALNT9-204ENST00000424720 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.85■■■■■ 4.29
GALNT9-204ENST00000424720 CUX1P39880 1505 aa41.81■■■■■ 4.28
GALNT9-204ENST00000424720 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.79■■■■■ 4.28
GALNT9-204ENST00000424720 CUX2O14529 1486 aa41.76■■■■■ 4.27
GALNT9-204ENST00000424720 SYNJ1O43426 1573 aa41.67■■■■■ 4.26
GALNT9-204ENST00000424720 TOP2BQ02880 1626 aa41.6■■■■■ 4.25
GALNT9-204ENST00000424720 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.57■■■■■ 4.25
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GALNT9-204ENST00000424720 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.55■■■■■ 4.24
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GALNT9-204ENST00000424720 IFT140Q96RY7 1462 aa41.4■■■■■ 4.22
GALNT9-204ENST00000424720 TRIM41Q8WV44 630 aa41.34■■■■■ 4.21
GALNT9-204ENST00000424720 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.33■■■■■ 4.21
GALNT9-204ENST00000424720 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.26■■■■■ 4.2
GALNT9-204ENST00000424720 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.23■■■■■ 4.19
GALNT9-204ENST00000424720 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.15■■■■■ 4.18
GALNT9-204ENST00000424720 WDR97A6NE52 1622 aa41.14■■■■■ 4.18
GALNT9-204ENST00000424720 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.14■■■■■ 4.18
GALNT9-204ENST00000424720 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.09■■■■■ 4.17
GALNT9-204ENST00000424720 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.06■■■■■ 4.16
GALNT9-204ENST00000424720 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.94■■■■■ 4.14
GALNT9-204ENST00000424720 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.93■■■■■ 4.14
GALNT9-204ENST00000424720 KIF27Q86VH2 1401 aa40.86■■■■■ 4.13
GALNT9-204ENST00000424720 GRIN2BQ13224 1484 aa40.81■■■■■ 4.12
GALNT9-204ENST00000424720 PBRM1Q86U86 1689 aa40.8■■■■■ 4.12
GALNT9-204ENST00000424720 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.77■■■■■ 4.12
GALNT9-204ENST00000424720 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.7■■■■■ 4.11
GALNT9-204ENST00000424720 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.66■■■■■ 4.1
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GALNT9-204ENST00000424720 FBLN2P98095 1184 aa40.53■■■■■ 4.08
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GALNT9-204ENST00000424720 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.47■■■■■ 4.07
GALNT9-204ENST00000424720 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.46■■■■■ 4.07
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GALNT9-204ENST00000424720 OSCARQ8IYS5 282 aa40.24■■■■■ 4.03
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GALNT9-204ENST00000424720 EHMT2Q96KQ7 1210 aa40.06■■■■■ 4
GALNT9-204ENST00000424720 NUP160Q12769 1436 aa40.06■■■■■ 4
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GALNT9-204ENST00000424720 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.95■■■■□ 3.99
GALNT9-204ENST00000424720 GOLGA3Q08378 1498 aa39.88■■■■□ 3.97
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