RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421938.2

PRMT5-205, Transcript of protein arginine methyltransferase 5, humanhuman

TSL 3

Gene PRMT5, Length 565 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRMT5-205ENST00000421938 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.98■■■■■ 6.55
PRMT5-205ENST00000421938 ABCC9O60706 1549 aa50.41■■■■■ 5.66
PRMT5-205ENST00000421938 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.17■■■■■ 5.62
PRMT5-205ENST00000421938 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.83■■■■■ 5.25
PRMT5-205ENST00000421938 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.5■■■■■ 5.19
PRMT5-205ENST00000421938 NACADO15069 1562 aa47.49■■■■■ 5.19
PRMT5-205ENST00000421938 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.45■■■■■ 5.19
PRMT5-205ENST00000421938 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.01■■■■■ 5.12
PRMT5-205ENST00000421938 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.85■■■■■ 5.09
PRMT5-205ENST00000421938 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.76■■■■■ 5.08
PRMT5-205ENST00000421938 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.53■■■■■ 5.04
PRMT5-205ENST00000421938 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.35■■■■■ 5.01
PRMT5-205ENST00000421938 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.16■■■■■ 4.98
PRMT5-205ENST00000421938 SCRIBQ14160 1630 aa45.83■■■■■ 4.93
PRMT5-205ENST00000421938 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.7■■■■■ 4.91
PRMT5-205ENST00000421938 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.49■■■■■ 4.87
PRMT5-205ENST00000421938 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.38■■■■■ 4.86
PRMT5-205ENST00000421938 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.35■■■■■ 4.85
PRMT5-205ENST00000421938 NCAPD3P42695 1498 aa43.89■■■■■ 4.62
PRMT5-205ENST00000421938 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.77■■■■■ 4.6
PRMT5-205ENST00000421938 SMARCA4P51532 1647 aa43.67■■■■■ 4.58
PRMT5-205ENST00000421938 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.57■■■■■ 4.57
PRMT5-205ENST00000421938 SMARCA2P51531 1590 aa43.56■■■■■ 4.56
PRMT5-205ENST00000421938 HMGXB3Q12766 1538 aa43.48■■■■■ 4.55
PRMT5-205ENST00000421938 ERCC6Q03468 1493 aa43.46■■■■■ 4.55
PRMT5-205ENST00000421938 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.41■■■■■ 4.54
PRMT5-205ENST00000421938 CUX2O14529 1486 aa43.37■■■■■ 4.53
PRMT5-205ENST00000421938 NESP48681 1621 aa43.31■■■■■ 4.52
PRMT5-205ENST00000421938 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.3■■■■■ 4.52
PRMT5-205ENST00000421938 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.2■■■■■ 4.51
PRMT5-205ENST00000421938 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.19■■■■■ 4.5
PRMT5-205ENST00000421938 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.86■■■■■ 4.45
PRMT5-205ENST00000421938 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.78■■■■■ 4.44
PRMT5-205ENST00000421938 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.69■■■■■ 4.42
PRMT5-205ENST00000421938 WIZO95785 1651 aa42.67■■■■■ 4.42
PRMT5-205ENST00000421938 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.64■■■■■ 4.42
PRMT5-205ENST00000421938 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.57■■■■■ 4.41
PRMT5-205ENST00000421938 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.29■■■■■ 4.36
PRMT5-205ENST00000421938 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.26■■■■■ 4.36
PRMT5-205ENST00000421938 WDR62O43379 1518 aa42.17■■■■■ 4.34
PRMT5-205ENST00000421938 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.1■■■■■ 4.33
PRMT5-205ENST00000421938 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.08■■■■■ 4.33
PRMT5-205ENST00000421938 CFTRP13569 1480 aa42.05■■■■■ 4.32
PRMT5-205ENST00000421938 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.05■■■■■ 4.32
PRMT5-205ENST00000421938 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.77■■■■■ 4.28
PRMT5-205ENST00000421938 TRIM41Q8WV44 630 aa41.67■■■■■ 4.26
PRMT5-205ENST00000421938 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.66■■■■■ 4.26
PRMT5-205ENST00000421938 PRDM2Q13029 1718 aa41.57■■■■■ 4.25
PRMT5-205ENST00000421938 OSCARQ8IYS5 282 aa41.48■■■■■ 4.23
PRMT5-205ENST00000421938 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.3■■■■■ 4.2
PRMT5-205ENST00000421938 TOPBP1Q92547 1522 aa41.28■■■■■ 4.2
PRMT5-205ENST00000421938 IFT140Q96RY7 1462 aa41.27■■■■■ 4.2
PRMT5-205ENST00000421938 ABCC8Q09428 1581 aa41.11■■■■■ 4.17
PRMT5-205ENST00000421938 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.08■■■■■ 4.17
PRMT5-205ENST00000421938 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.97■■■■■ 4.15
PRMT5-205ENST00000421938 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.93■■■■■ 4.145e-6■■■□□ 17
PRMT5-205ENST00000421938 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.93■■■■■ 4.14
PRMT5-205ENST00000421938 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.93■■■■■ 4.14
PRMT5-205ENST00000421938 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.93■■■■■ 4.14
PRMT5-205ENST00000421938 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.91■■■■■ 4.14
PRMT5-205ENST00000421938 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.85■■■■■ 4.13
PRMT5-205ENST00000421938 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.77■■■■■ 4.12
PRMT5-205ENST00000421938 ARHGEF11O15085 1522 aa40.77■■■■■ 4.12
PRMT5-205ENST00000421938 CHD1O14646 1710 aa40.73■■■■■ 4.11
PRMT5-205ENST00000421938 SOGA1O94964 1423 aa40.7■■■■■ 4.11
PRMT5-205ENST00000421938 FBLN2P98095 1184 aa40.69■■■■■ 4.1
PRMT5-205ENST00000421938 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.67■■■■■ 4.1
PRMT5-205ENST00000421938 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.59■■■■■ 4.09
PRMT5-205ENST00000421938 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.58■■■■■ 4.09
PRMT5-205ENST00000421938 CUX1P39880 1505 aa40.56■■■■■ 4.08
PRMT5-205ENST00000421938 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.45■■■■■ 4.07
PRMT5-205ENST00000421938 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.44■■■■■ 4.06
PRMT5-205ENST00000421938 ARAP1Q96P48 1450 aa40.39■■■■■ 4.06
PRMT5-205ENST00000421938 WDR97A6NE52 1622 aa40.36■■■■■ 4.05
PRMT5-205ENST00000421938 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.34■■■■■ 4.05
PRMT5-205ENST00000421938 GRIN2BQ13224 1484 aa40.3■■■■■ 4.04
PRMT5-205ENST00000421938 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.27■■■■■ 4.04
PRMT5-205ENST00000421938 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.23■■■■■ 4.03
PRMT5-205ENST00000421938 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.17■■■■■ 4.02
PRMT5-205ENST00000421938 SYNJ1O43426 1573 aa40.17■■■■■ 4.02
PRMT5-205ENST00000421938 SYNJ2O15056 1496 aa40.16■■■■■ 4.02
PRMT5-205ENST00000421938 PBRM1Q86U86 1689 aa40.13■■■■■ 4.01
PRMT5-205ENST00000421938 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.13■■■■■ 4.01
PRMT5-205ENST00000421938 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.11■■■■■ 4.01
PRMT5-205ENST00000421938 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.03■■■■■ 4
PRMT5-205ENST00000421938 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.92■■■■□ 3.98
PRMT5-205ENST00000421938 TOP2BQ02880 1626 aa39.83■■■■□ 3.97
PRMT5-205ENST00000421938 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.83■■■■□ 3.97
PRMT5-205ENST00000421938 GRIN2AQ12879 1464 aa39.78■■■■□ 3.96
PRMT5-205ENST00000421938 ADAMTS12P58397 1594 aa39.73■■■■□ 3.95
PRMT5-205ENST00000421938 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.7■■■■□ 3.95
PRMT5-205ENST00000421938 CEP170Q5SW79 1584 aa39.67■■■■□ 3.94
PRMT5-205ENST00000421938 NUP160Q12769 1436 aa39.65■■■■□ 3.94
PRMT5-205ENST00000421938 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.65■■■■□ 3.94
PRMT5-205ENST00000421938 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.56■■■■□ 3.92
PRMT5-205ENST00000421938 SHROOM2Q13796 1616 aa39.47■■■■□ 3.91
PRMT5-205ENST00000421938 JPH4Q96JJ6 628 aa39.35■■■■□ 3.89
PRMT5-205ENST00000421938 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP39.32■■■■□ 3.89
PRMT5-205ENST00000421938 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.16■■■■□ 3.86
PRMT5-205ENST00000421938 IGF1RP08069 1367 aa39.16■■■■□ 3.86
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