RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421201.1

PRKCE-203, Transcript of protein kinase C epsilon, humanhuman

TSL 4

Gene PRKCE, Length 939 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCE-203ENST00000421201 NISCHQ9Y2I1 1504 aa44.34■■■■■ 4.69
PRKCE-203ENST00000421201 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa39.72■■■■□ 3.95
PRKCE-203ENST00000421201 ABCC9O60706 1549 aa39.63■■■■□ 3.93
PRKCE-203ENST00000421201 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa37.76■■■■□ 3.63
PRKCE-203ENST00000421201 NACADO15069 1562 aa37.52■■■■□ 3.6
PRKCE-203ENST00000421201 DCAF8L2P0C7V8 631 aa37.4■■■■□ 3.58
PRKCE-203ENST00000421201 DNAJC5BQ9UF47 199 aa37.04■■■■□ 3.52
PRKCE-203ENST00000421201 MYO15BQ96JP2 1530 aa37.03■■■■□ 3.52
PRKCE-203ENST00000421201 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP36.92■■■■□ 3.5
PRKCE-203ENST00000421201 UNC13AQ9UPW8 1703 aa36.89■■■■□ 3.5
PRKCE-203ENST00000421201 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP36.79■■■■□ 3.48
PRKCE-203ENST00000421201 BICRAQ9NZM4 1560 aa36.66■■■■□ 3.46
PRKCE-203ENST00000421201 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa36.61■■■■□ 3.45
PRKCE-203ENST00000421201 SCRIBQ14160 1630 aa36.25■■■■□ 3.39
PRKCE-203ENST00000421201 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa36.16■■■■□ 3.38
PRKCE-203ENST00000421201 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa35.79■■■■□ 3.32
PRKCE-203ENST00000421201 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP35.75■■■■□ 3.31
PRKCE-203ENST00000421201 CECR2Q9BXF3 1484 aa35.67■■■■□ 3.3
PRKCE-203ENST00000421201 NCAPD3P42695 1498 aa34.64■■■■□ 3.14
PRKCE-203ENST00000421201 SMARCA4P51532 1647 aa34.57■■■■□ 3.12
PRKCE-203ENST00000421201 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa34.57■■■■□ 3.12
PRKCE-203ENST00000421201 SMARCA2P51531 1590 aa34.47■■■■□ 3.11
PRKCE-203ENST00000421201 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP34.41■■■■□ 3.1
PRKCE-203ENST00000421201 HMGXB3Q12766 1538 aa34.4■■■■□ 3.1
PRKCE-203ENST00000421201 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP34.25■■■■□ 3.07
PRKCE-203ENST00000421201 ERCC6Q03468 1493 aa34.21■■■■□ 3.07
PRKCE-203ENST00000421201 PEG3Q9GZU2 1588 aa34.21■■■■□ 3.07
PRKCE-203ENST00000421201 MROH2BQ7Z745 1585 aa34.19■■■■□ 3.06
PRKCE-203ENST00000421201 NESP48681 1621 aa34.08■■■■□ 3.05
PRKCE-203ENST00000421201 CUX2O14529 1486 aa34.07■■■■□ 3.05
PRKCE-203ENST00000421201 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa33.9■■■■□ 3.02
PRKCE-203ENST00000421201 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33.84■■■■□ 3.01
PRKCE-203ENST00000421201 WIZO95785 1651 aa33.78■■■■□ 3
PRKCE-203ENST00000421201 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP33.7■■■□□ 2.99
PRKCE-203ENST00000421201 PDS5BQ9NTI5 1447 aa33.65■■■□□ 2.98
PRKCE-203ENST00000421201 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa33.63■■■□□ 2.97
PRKCE-203ENST00000421201 CADPSQ9ULU8 1353 aa33.6■■■□□ 2.97
PRKCE-203ENST00000421201 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP33.52■■■□□ 2.96
PRKCE-203ENST00000421201 MRC2Q9UBG0 1479 aa33.37■■■□□ 2.93
PRKCE-203ENST00000421201 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP33.36■■■□□ 2.93
PRKCE-203ENST00000421201 WDR62O43379 1518 aa33.27■■■□□ 2.92
PRKCE-203ENST00000421201 CEP164Q9UPV0 1460 aa33.26■■■□□ 2.92
PRKCE-203ENST00000421201 CFTRP13569 1480 aa33.25■■■□□ 2.91
PRKCE-203ENST00000421201 FANCD2Q9BXW9 1451 aa33.24■■■□□ 2.91
PRKCE-203ENST00000421201 CCDC88BA6NC98 1476 aa32.98■■■□□ 2.87
PRKCE-203ENST00000421201 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP32.95■■■□□ 2.87
PRKCE-203ENST00000421201 PRDM2Q13029 1718 aa32.91■■■□□ 2.86
PRKCE-203ENST00000421201 TOPBP1Q92547 1522 aa32.61■■■□□ 2.81
PRKCE-203ENST00000421201 IFT140Q96RY7 1462 aa32.58■■■□□ 2.81
PRKCE-203ENST00000421201 OSCARQ8IYS5 282 aa32.54■■■□□ 2.8
PRKCE-203ENST00000421201 ABCC8Q09428 1581 aa32.53■■■□□ 2.8
PRKCE-203ENST00000421201 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP32.53■■■□□ 2.8
PRKCE-203ENST00000421201 TRIM41Q8WV44 630 aa32.52■■■□□ 2.8
PRKCE-203ENST00000421201 DNMBPQ6XZF7 1577 aa32.51■■■□□ 2.79
PRKCE-203ENST00000421201 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP32.36■■■□□ 2.77
PRKCE-203ENST00000421201 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP32.3■■■□□ 2.76
PRKCE-203ENST00000421201 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP32.29■■■□□ 2.76
PRKCE-203ENST00000421201 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP32.24■■■□□ 2.75
PRKCE-203ENST00000421201 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa32.18■■■□□ 2.74
PRKCE-203ENST00000421201 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.16■■■□□ 2.74
PRKCE-203ENST00000421201 SOGA1O94964 1423 aa32.15■■■□□ 2.74
PRKCE-203ENST00000421201 FGD5Q6ZNL6 1462 aa32.12■■■□□ 2.73
PRKCE-203ENST00000421201 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa32.11■■■□□ 2.73
PRKCE-203ENST00000421201 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa32.11■■■□□ 2.73
PRKCE-203ENST00000421201 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa32.11■■■□□ 2.73
PRKCE-203ENST00000421201 CUX1P39880 1505 aa32.11■■■□□ 2.73
PRKCE-203ENST00000421201 CHD1O14646 1710 aa32.09■■■□□ 2.73
PRKCE-203ENST00000421201 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP32.07■■■□□ 2.73
PRKCE-203ENST00000421201 ARHGEF11O15085 1522 aa32.04■■■□□ 2.72
PRKCE-203ENST00000421201 FBLN2P98095 1184 aa32.02■■■□□ 2.72
PRKCE-203ENST00000421201 WDR97A6NE52 1622 aa31.97■■■□□ 2.71
PRKCE-203ENST00000421201 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa31.94■■■□□ 2.7
PRKCE-203ENST00000421201 GRIN2BQ13224 1484 aa31.85■■■□□ 2.69
PRKCE-203ENST00000421201 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP31.84■■■□□ 2.69
PRKCE-203ENST00000421201 CYB5RLQ6IPT4 315 aa31.8■■■□□ 2.68
PRKCE-203ENST00000421201 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP31.79■■■□□ 2.68
PRKCE-203ENST00000421201 GAPVD1Q14C86 1478 aa31.77■■■□□ 2.68
PRKCE-203ENST00000421201 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa31.75■■■□□ 2.67
PRKCE-203ENST00000421201 PBRM1Q86U86 1689 aa31.74■■■□□ 2.67
PRKCE-203ENST00000421201 ARAP1Q96P48 1450 aa31.74■■■□□ 2.67
PRKCE-203ENST00000421201 SYNJ2O15056 1496 aa31.73■■■□□ 2.67
PRKCE-203ENST00000421201 CLASP1Q7Z460 1538 aa31.72■■■□□ 2.67
PRKCE-203ENST00000421201 SYNJ1O43426 1573 aa31.72■■■□□ 2.67
PRKCE-203ENST00000421201 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa31.69■■■□□ 2.66
PRKCE-203ENST00000421201 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP31.66■■■□□ 2.66
PRKCE-203ENST00000421201 TOP2BQ02880 1626 aa31.62■■■□□ 2.65
PRKCE-203ENST00000421201 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa31.61■■■□□ 2.65
PRKCE-203ENST00000421201 ADAMTS12P58397 1594 aa31.46■■■□□ 2.63
PRKCE-203ENST00000421201 GRIN2AQ12879 1464 aa31.45■■■□□ 2.62
PRKCE-203ENST00000421201 TRHP20396 242 aaPredicted RBP31.41■■■□□ 2.62
PRKCE-203ENST00000421201 FHAD1B1AJZ9 1412 aa31.36■■■□□ 2.61
PRKCE-203ENST00000421201 ERICH3Q5RHP9 1530 aa31.35■■■□□ 2.61
PRKCE-203ENST00000421201 CEP170Q5SW79 1584 aa31.34■■■□□ 2.61
PRKCE-203ENST00000421201 NUP160Q12769 1436 aa31.33■■■□□ 2.61
PRKCE-203ENST00000421201 ERCC6L2Q5T890 1561 aa31.26■■■□□ 2.59
PRKCE-203ENST00000421201 SHROOM2Q13796 1616 aa31.16■■■□□ 2.58
PRKCE-203ENST00000421201 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP31.03■■■□□ 2.56
PRKCE-203ENST00000421201 KIF27Q86VH2 1401 aa31.02■■■□□ 2.56
PRKCE-203ENST00000421201 JPH4Q96JJ6 628 aa31.01■■■□□ 2.55
PRKCE-203ENST00000421201 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa31.01■■■□□ 2.55
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