RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420443.1

ARSEP1-201, Transcript of arylsulfatase E pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene ARSEP1, Length 635 nt, Biotype transcribed unprocessed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARSEP1-201ENST00000420443 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.17■■■■□ 3.86
ARSEP1-201ENST00000420443 ABCC9O60706 1549 aa35.74■■■■□ 3.31
ARSEP1-201ENST00000420443 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa35.24■■■■□ 3.23
ARSEP1-201ENST00000420443 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34■■■■□ 3.03
ARSEP1-201ENST00000420443 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.79■■■■□ 3
ARSEP1-201ENST00000420443 NACADO15069 1562 aa33.48■■■□□ 2.95
ARSEP1-201ENST00000420443 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP33.24■■■□□ 2.91
ARSEP1-201ENST00000420443 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.21■■■□□ 2.91
ARSEP1-201ENST00000420443 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.92■■■□□ 2.86
ARSEP1-201ENST00000420443 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.92■■■□□ 2.86
ARSEP1-201ENST00000420443 BICRAQ9NZM4 1560 aa32.87■■■□□ 2.85
ARSEP1-201ENST00000420443 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.4■■■□□ 2.78
ARSEP1-201ENST00000420443 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.38■■■□□ 2.77
ARSEP1-201ENST00000420443 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.34■■■□□ 2.77
ARSEP1-201ENST00000420443 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.26■■■□□ 2.75
ARSEP1-201ENST00000420443 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.23■■■□□ 2.75
ARSEP1-201ENST00000420443 SCRIBQ14160 1630 aa32.11■■■□□ 2.73
ARSEP1-201ENST00000420443 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.08■■■□□ 2.73
ARSEP1-201ENST00000420443 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa31.51■■■□□ 2.63
ARSEP1-201ENST00000420443 CUX2O14529 1486 aa30.99■■■□□ 2.55
ARSEP1-201ENST00000420443 NCAPD3P42695 1498 aa30.97■■■□□ 2.55
ARSEP1-201ENST00000420443 ERCC6Q03468 1493 aa30.87■■■□□ 2.53
ARSEP1-201ENST00000420443 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.81■■■□□ 2.52
ARSEP1-201ENST00000420443 HMGXB3Q12766 1538 aa30.66■■■□□ 2.5
ARSEP1-201ENST00000420443 SMARCA2P51531 1590 aa30.65■■■□□ 2.5
ARSEP1-201ENST00000420443 SMARCA4P51532 1647 aa30.6■■■□□ 2.49
ARSEP1-201ENST00000420443 NESP48681 1621 aa30.59■■■□□ 2.49
ARSEP1-201ENST00000420443 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.44■■■□□ 2.46
ARSEP1-201ENST00000420443 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.4■■■□□ 2.46
ARSEP1-201ENST00000420443 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.34■■■□□ 2.45
ARSEP1-201ENST00000420443 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.33■■■□□ 2.45
ARSEP1-201ENST00000420443 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.27■■■□□ 2.44
ARSEP1-201ENST00000420443 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.18■■■□□ 2.42
ARSEP1-201ENST00000420443 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.15■■■□□ 2.42
ARSEP1-201ENST00000420443 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.07■■■□□ 2.41
ARSEP1-201ENST00000420443 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.02■■■□□ 2.4
ARSEP1-201ENST00000420443 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.92■■■□□ 2.38
ARSEP1-201ENST00000420443 TRIM41Q8WV44 630 aa29.89■■■□□ 2.38
ARSEP1-201ENST00000420443 WDR62O43379 1518 aa29.85■■■□□ 2.37
ARSEP1-201ENST00000420443 WIZO95785 1651 aa29.72■■■□□ 2.35
ARSEP1-201ENST00000420443 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.69■■■□□ 2.34
ARSEP1-201ENST00000420443 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.64■■■□□ 2.34
ARSEP1-201ENST00000420443 CFTRP13569 1480 aa29.58■■■□□ 2.33
ARSEP1-201ENST00000420443 OSCARQ8IYS5 282 aa29.52■■■□□ 2.32
ARSEP1-201ENST00000420443 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
ARSEP1-201ENST00000420443 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.43■■■□□ 2.3
ARSEP1-201ENST00000420443 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.36■■■□□ 2.29
ARSEP1-201ENST00000420443 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.15■■■□□ 2.26
ARSEP1-201ENST00000420443 IFT140Q96RY7 1462 aa29.13■■■□□ 2.25
ARSEP1-201ENST00000420443 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.12■■■□□ 2.25
ARSEP1-201ENST00000420443 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.12■■■□□ 2.25
ARSEP1-201ENST00000420443 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.12■■■□□ 2.25
ARSEP1-201ENST00000420443 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.07■■■□□ 2.24
ARSEP1-201ENST00000420443 PRDM2Q13029 1718 aa29.04■■■□□ 2.24
ARSEP1-201ENST00000420443 ARHGEF11O15085 1522 aa29.03■■■□□ 2.24
ARSEP1-201ENST00000420443 TOPBP1Q92547 1522 aa29.03■■■□□ 2.24
ARSEP1-201ENST00000420443 ABCC8Q09428 1581 aa28.92■■■□□ 2.22
ARSEP1-201ENST00000420443 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
ARSEP1-201ENST00000420443 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.86■■■□□ 2.21
ARSEP1-201ENST00000420443 CYB5RLQ6IPT4 315 aa28.85■■■□□ 2.21
ARSEP1-201ENST00000420443 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.83■■■□□ 2.21
ARSEP1-201ENST00000420443 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
ARSEP1-201ENST00000420443 ARAP1Q96P48 1450 aa28.73■■■□□ 2.19
ARSEP1-201ENST00000420443 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.72■■■□□ 2.19
ARSEP1-201ENST00000420443 CHD1O14646 1710 aa28.7■■■□□ 2.19
ARSEP1-201ENST00000420443 FBLN2P98095 1184 aa28.69■■■□□ 2.18
ARSEP1-201ENST00000420443 TRHP20396 242 aaPredicted RBP28.63■■■□□ 2.17
ARSEP1-201ENST00000420443 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.62■■■□□ 2.17
ARSEP1-201ENST00000420443 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
ARSEP1-201ENST00000420443 SOGA1O94964 1423 aa28.57■■■□□ 2.16
ARSEP1-201ENST00000420443 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.51■■■□□ 2.15
ARSEP1-201ENST00000420443 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.48■■■□□ 2.15
ARSEP1-201ENST00000420443 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.46■■■□□ 2.15
ARSEP1-201ENST00000420443 WDR97A6NE52 1622 aa28.44■■■□□ 2.14
ARSEP1-201ENST00000420443 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
ARSEP1-201ENST00000420443 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
ARSEP1-201ENST00000420443 CUX1P39880 1505 aa28.38■■■□□ 2.13
ARSEP1-201ENST00000420443 GRIN2BQ13224 1484 aa28.37■■■□□ 2.13
ARSEP1-201ENST00000420443 SYNJ1O43426 1573 aa28.37■■■□□ 2.13
ARSEP1-201ENST00000420443 SYNJ2O15056 1496 aa28.33■■■□□ 2.13
ARSEP1-201ENST00000420443 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.21■■■□□ 2.11
ARSEP1-201ENST00000420443 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.13■■■□□ 2.09
ARSEP1-201ENST00000420443 PBRM1Q86U86 1689 aa28.1■■■□□ 2.09
ARSEP1-201ENST00000420443 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
ARSEP1-201ENST00000420443 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.08■■■□□ 2.09
ARSEP1-201ENST00000420443 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28■■■□□ 2.07
ARSEP1-201ENST00000420443 GRIN2AQ12879 1464 aa28■■■□□ 2.07
ARSEP1-201ENST00000420443 NUP160Q12769 1436 aa27.96■■■□□ 2.07
ARSEP1-201ENST00000420443 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.92■■■□□ 2.06
ARSEP1-201ENST00000420443 ADAMTS12P58397 1594 aa27.91■■■□□ 2.06
ARSEP1-201ENST00000420443 CEP170Q5SW79 1584 aa27.91■■■□□ 2.06
ARSEP1-201ENST00000420443 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.84■■■□□ 2.05
ARSEP1-201ENST00000420443 SHROOM2Q13796 1616 aa27.82■■■□□ 2.04
ARSEP1-201ENST00000420443 TOP2BQ02880 1626 aa27.77■■■□□ 2.04
ARSEP1-201ENST00000420443 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.75■■■□□ 2.03
ARSEP1-201ENST00000420443 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.74■■■□□ 2.03
ARSEP1-201ENST00000420443 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.74■■■□□ 2.03
ARSEP1-201ENST00000420443 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP27.7■■■□□ 2.03
ARSEP1-201ENST00000420443 JPH4Q96JJ6 628 aa27.66■■■□□ 2.02
ARSEP1-201ENST00000420443 KIF13AQ9H1H9 1805 aa27.6■■■□□ 2.01
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