RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419288.1

GPC5-AS1-201, GPC5 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene GPC5-AS1, Length 393 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC5-AS1-201ENST00000419288 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP13.67□□□□□ -0.22
GPC5-AS1-201ENST00000419288 POTEDQ86YR6 584 aa13.15□□□□□ -0.3
GPC5-AS1-201ENST00000419288 CHIC1Q5VXU3 224 aa12.86□□□□□ -0.35
GPC5-AS1-201ENST00000419288 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
GPC5-AS1-201ENST00000419288 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
GPC5-AS1-201ENST00000419288 FOXD1Q16676 465 aa11.27□□□□□ -0.61
GPC5-AS1-201ENST00000419288 MSH5O43196 834 aa11.14□□□□□ -0.63
GPC5-AS1-201ENST00000419288 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
GPC5-AS1-201ENST00000419288 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
GPC5-AS1-201ENST00000419288 POTEHQ6S545 545 aa10.06□□□□□ -0.8
GPC5-AS1-201ENST00000419288 PPP6R1Q9UPN7 881 aa9.45□□□□□ -0.9
GPC5-AS1-201ENST00000419288 ADRA2BP18089 450 aa9.37□□□□□ -0.91
GPC5-AS1-201ENST00000419288 RNF39Q9H2S5 420 aa9.33□□□□□ -0.92
GPC5-AS1-201ENST00000419288 DMRT2Q9Y5R5 561 aa9.23□□□□□ -0.93
GPC5-AS1-201ENST00000419288 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
GPC5-AS1-201ENST00000419288 DCAF8L1A6NGE4 600 aa9.03□□□□□ -0.96
GPC5-AS1-201ENST00000419288 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
GPC5-AS1-201ENST00000419288 PLSCR2Q9NRY7 297 aa8.95□□□□□ -0.98
GPC5-AS1-201ENST00000419288 NISCHQ9Y2I1 1504 aa8.93□□□□□ -0.98
GPC5-AS1-201ENST00000419288 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
GPC5-AS1-201ENST00000419288 PLPPR3Q6T4P5 718 aa8.77□□□□□ -1.01
GPC5-AS1-201ENST00000419288 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
GPC5-AS1-201ENST00000419288 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
GPC5-AS1-201ENST00000419288 CHRDL2Q6WN34 429 aa8.34□□□□□ -1.07
GPC5-AS1-201ENST00000419288 DNAJC5BQ9UF47 199 aa8.34□□□□□ -1.07
GPC5-AS1-201ENST00000419288 DSG3P32926 999 aa8.27□□□□□ -1.09
GPC5-AS1-201ENST00000419288 LHX8Q68G74 356 aa8.24□□□□□ -1.09
GPC5-AS1-201ENST00000419288 HAX1O00165 279 aa8.12□□□□□ -1.11
GPC5-AS1-201ENST00000419288 CAPN15O75808 1086 aa8.07□□□□□ -1.12
GPC5-AS1-201ENST00000419288 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP8.04□□□□□ -1.12
GPC5-AS1-201ENST00000419288 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
GPC5-AS1-201ENST00000419288 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa7.99□□□□□ -1.13
GPC5-AS1-201ENST00000419288 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
GPC5-AS1-201ENST00000419288 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
GPC5-AS1-201ENST00000419288 POTEMA6NI47 508 aa7.84□□□□□ -1.15
GPC5-AS1-201ENST00000419288 PIP4P2Q8N4L2 257 aa7.82□□□□□ -1.16
GPC5-AS1-201ENST00000419288 EVX2Q03828 476 aa7.8□□□□□ -1.16
GPC5-AS1-201ENST00000419288 PCDH10Q9P2E7 1040 aa7.8□□□□□ -1.16
GPC5-AS1-201ENST00000419288 ABCC9O60706 1549 aa7.78□□□□□ -1.16
GPC5-AS1-201ENST00000419288 POTEGQ6S5H5 508 aa7.76□□□□□ -1.17
GPC5-AS1-201ENST00000419288 ABCB7O75027 752 aa7.73□□□□□ -1.17
GPC5-AS1-201ENST00000419288 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa7.68□□□□□ -1.18
GPC5-AS1-201ENST00000419288 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
GPC5-AS1-201ENST00000419288 GABBR2O75899 941 aa7.61□□□□□ -1.19
GPC5-AS1-201ENST00000419288 TRHP20396 242 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
GPC5-AS1-201ENST00000419288 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa7.55□□□□□ -1.2
GPC5-AS1-201ENST00000419288 NACADO15069 1562 aa7.54□□□□□ -1.2
GPC5-AS1-201ENST00000419288 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP7.54□□□□□ -1.2
GPC5-AS1-201ENST00000419288 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
GPC5-AS1-201ENST00000419288 MYO15BQ96JP2 1530 aa7.52□□□□□ -1.2
GPC5-AS1-201ENST00000419288 AKT1S1Q96B36 256 aa7.5□□□□□ -1.21
GPC5-AS1-201ENST00000419288 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa7.49□□□□□ -1.21
GPC5-AS1-201ENST00000419288 DCAF8L2P0C7V8 631 aa7.45□□□□□ -1.22
GPC5-AS1-201ENST00000419288 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa7.45□□□□□ -1.22
GPC5-AS1-201ENST00000419288 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
GPC5-AS1-201ENST00000419288 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
GPC5-AS1-201ENST00000419288 APLP2Q06481 763 aa7.4□□□□□ -1.22
GPC5-AS1-201ENST00000419288 OTUD5Q96G74 571 aa7.39□□□□□ -1.23
GPC5-AS1-201ENST00000419288 POTEIP0CG38 1075 aa7.38□□□□□ -1.23
GPC5-AS1-201ENST00000419288 C19orf67A6NJJ6 358 aa7.35□□□□□ -1.23
GPC5-AS1-201ENST00000419288 PITPNM1O00562 1244 aa7.34□□□□□ -1.23
GPC5-AS1-201ENST00000419288 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa7.33□□□□□ -1.24
GPC5-AS1-201ENST00000419288 UNC13AQ9UPW8 1703 aa7.24□□□□□ -1.25
GPC5-AS1-201ENST00000419288 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP7.24□□□□□ -1.25
GPC5-AS1-201ENST00000419288 BICRAQ9NZM4 1560 aa7.23□□□□□ -1.25
GPC5-AS1-201ENST00000419288 SCRIBQ14160 1630 aa7.2□□□□□ -1.26
GPC5-AS1-201ENST00000419288 DCBLD2Q96PD2 775 aa7.18□□□□□ -1.26
GPC5-AS1-201ENST00000419288 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
GPC5-AS1-201ENST00000419288 CDAN1Q8IWY9 1227 aa7.16□□□□□ -1.26
GPC5-AS1-201ENST00000419288 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
GPC5-AS1-201ENST00000419288 MMRN1Q13201 1228 aa7.13□□□□□ -1.27
GPC5-AS1-201ENST00000419288 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
GPC5-AS1-201ENST00000419288 POTEB2H3BUK9 544 aa7.11□□□□□ -1.27
GPC5-AS1-201ENST00000419288 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
GPC5-AS1-201ENST00000419288 CLCN6P51797 869 aa7.06□□□□□ -1.28
GPC5-AS1-201ENST00000419288 POLA2Q14181 598 aa7.06□□□□□ -1.28
GPC5-AS1-201ENST00000419288 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa7.05□□□□□ -1.28
GPC5-AS1-201ENST00000419288 CECR2Q9BXF3 1484 aa7.04□□□□□ -1.28
GPC5-AS1-201ENST00000419288 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
GPC5-AS1-201ENST00000419288 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
GPC5-AS1-201ENST00000419288 SPNS2Q8IVW8 549 aa6.99□□□□□ -1.29
GPC5-AS1-201ENST00000419288 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
GPC5-AS1-201ENST00000419288 SMARCA2P51531 1590 aa6.95□□□□□ -1.3
GPC5-AS1-201ENST00000419288 NCAPD3P42695 1498 aa6.94□□□□□ -1.3
GPC5-AS1-201ENST00000419288 KCNA4P22459 653 aa6.93□□□□□ -1.3
GPC5-AS1-201ENST00000419288 SMARCA4P51532 1647 aa6.92□□□□□ -1.3
GPC5-AS1-201ENST00000419288 HMGXB3Q12766 1538 aa6.91□□□□□ -1.3
GPC5-AS1-201ENST00000419288 MAMSTRQ6ZN01 415 aa6.91□□□□□ -1.3
GPC5-AS1-201ENST00000419288 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa6.91□□□□□ -1.3
GPC5-AS1-201ENST00000419288 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
GPC5-AS1-201ENST00000419288 PEG3Q9GZU2 1588 aa6.9□□□□□ -1.31
GPC5-AS1-201ENST00000419288 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
GPC5-AS1-201ENST00000419288 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
GPC5-AS1-201ENST00000419288 OSCARQ8IYS5 282 aa6.87□□□□□ -1.31
GPC5-AS1-201ENST00000419288 CD44P16070 742 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
GPC5-AS1-201ENST00000419288 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
GPC5-AS1-201ENST00000419288 MROH2BQ7Z745 1585 aa6.83□□□□□ -1.32
GPC5-AS1-201ENST00000419288 NPM3O75607 178 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
GPC5-AS1-201ENST00000419288 CLEC11AQ9Y240 323 aa6.82□□□□□ -1.32
GPC5-AS1-201ENST00000419288 SCUBE2Q9NQ36 999 aa6.79□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.5 ms