RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418308.5

PCBP1-AS1-212, PCBP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PCBP1-AS1, Length 863 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.44■■□□□ 1.18
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP19.71■□□□□ 0.75
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.61
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 NISCHQ9Y2I1 1504 aa18.84■□□□□ 0.61
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 PLPPR3Q6T4P5 718 aa18.62■□□□□ 0.57
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 FOXD1Q16676 465 aa17.33■□□□□ 0.36
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 ADRA2BP18089 450 aa17.24■□□□□ 0.35
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 PPP6R1Q9UPN7 881 aa17.16■□□□□ 0.34
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa16.8■□□□□ 0.28
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 KCNA4P22459 653 aa16.78■□□□□ 0.28
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 ABCC9O60706 1549 aa16.56■□□□□ 0.24
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 EHMT2Q96KQ7 1210 aa16.49■□□□□ 0.23
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa16.44■□□□□ 0.22
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 NPM3O75607 178 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 DCAF8L2P0C7V8 631 aa15.92■□□□□ 0.14
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 CSRNP3Q8WYN3 585 aa15.92■□□□□ 0.14
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa15.87■□□□□ 0.13
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 MSH5O43196 834 aa15.86■□□□□ 0.13
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa15.81■□□□□ 0.12
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 NACADO15069 1562 aa15.72■□□□□ 0.11
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 UNC13AQ9UPW8 1703 aa15.65■□□□□ 0.1
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 SCRIBQ14160 1630 aa15.49■□□□□ 0.07
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 MYO15BQ96JP2 1530 aa15.48■□□□□ 0.07
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP15.46■□□□□ 0.07
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa15.45■□□□□ 0.06
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 DNAJC5BQ9UF47 199 aa15.4■□□□□ 0.06
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 ZBTB22O15209 634 aa15.36■□□□□ 0.05
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 BICRAQ9NZM4 1560 aa15.36■□□□□ 0.05
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 FOXD4L1Q9NU39 408 aa15.33■□□□□ 0.04
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 DMRT2Q9Y5R5 561 aa15.13■□□□□ 0.01
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa15.11■□□□□ 0.01
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa14.95□□□□□ -0.02
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 SLC4A2P04920 1241 aa14.82□□□□□ -0.04
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 CECR2Q9BXF3 1484 aa14.8□□□□□ -0.04
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 ATXN8OSP0DMR3 200 aa14.79□□□□□ -0.04
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 POTEDQ86YR6 584 aa14.71□□□□□ -0.05
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 SMARCA4P51532 1647 aa14.7□□□□□ -0.06
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 MROH2BQ7Z745 1585 aa14.59□□□□□ -0.07
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa14.54□□□□□ -0.08
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 WIZO95785 1651 aa14.53□□□□□ -0.08
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 DCAF8L1A6NGE4 600 aa14.53□□□□□ -0.08
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 SMARCA2P51531 1590 aa14.52□□□□□ -0.08
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP14.48□□□□□ -0.093e-8■■□□□ 13.5
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 HMGXB3Q12766 1538 aa14.45□□□□□ -0.1
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 NCAPD3P42695 1498 aa14.44□□□□□ -0.1
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP14.44□□□□□ -0.1
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 FKBP8Q14318 412 aa14.42□□□□□ -0.1
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 PEG3Q9GZU2 1588 aa14.42□□□□□ -0.1
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP14.39□□□□□ -0.11
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP14.33□□□□□ -0.11
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 NESP48681 1621 aa14.33□□□□□ -0.12
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP14.28□□□□□ -0.12
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP14.25□□□□□ -0.13
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 ERCC6Q03468 1493 aa14.25□□□□□ -0.13
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa14.24□□□□□ -0.13
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 APLP2Q06481 763 aa14.2□□□□□ -0.14
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP14.19□□□□□ -0.14
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP14.18□□□□□ -0.14
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa14.17□□□□□ -0.14
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP14.13□□□□□ -0.15
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 SLC24A1O60721 1099 aa14.13□□□□□ -0.15
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 PRDM2Q13029 1718 aa14.1□□□□□ -0.15
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP14.09□□□□□ -0.15
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 CCDC88BA6NC98 1476 aa14.07□□□□□ -0.16
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 CADPSQ9ULU8 1353 aa14.07□□□□□ -0.16
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 PDS5BQ9NTI5 1447 aa14.02□□□□□ -0.16
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP14.02□□□□□ -0.17
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 FANCD2Q9BXW9 1451 aa13.99□□□□□ -0.17
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 CEP164Q9UPV0 1460 aa13.99□□□□□ -0.17
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 CUX2O14529 1486 aa13.98□□□□□ -0.17
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 CFTRP13569 1480 aa13.98□□□□□ -0.17
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 MRC2Q9UBG0 1479 aa13.96□□□□□ -0.17
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 WDR62O43379 1518 aa13.9□□□□□ -0.18
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP13.88□□□□□ -0.19
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 FBXO3Q9UK99 471 aa13.86□□□□□ -0.19
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 SPDYE4A6NLX3 237 aa13.78□□□□□ -0.2
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 FBLN2P98095 1184 aa13.78□□□□□ -0.2
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 TOPBP1Q92547 1522 aa13.78□□□□□ -0.2
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 DNMBPQ6XZF7 1577 aa13.76□□□□□ -0.21
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 ABCC8Q09428 1581 aa13.71□□□□□ -0.22
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 CUX1P39880 1505 aa13.69□□□□□ -0.22
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 TRHP20396 242 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP13.68□□□□□ -0.22
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
PCBP1-AS1-212ENST00000418308 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.8 ms