RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418189.5

HDAC11-209, Transcript of histone deacetylase 11, humanhuman

TSL 5

Gene HDAC11, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11-209ENST00000418189 NISCHQ9Y2I1 1504 aa61.7■■■■■ 7.47
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HDAC11-209ENST00000418189 SMARCA2P51531 1590 aa48.02■■■■■ 5.28
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HDAC11-209ENST00000418189 CADPSQ9ULU8 1353 aa46.76■■■■■ 5.08
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HDAC11-209ENST00000418189 CFTRP13569 1480 aa46.28■■■■■ 5
HDAC11-209ENST00000418189 FANCD2Q9BXW9 1451 aa46.24■■■■■ 4.99
HDAC11-209ENST00000418189 PRDM2Q13029 1718 aa45.94■■■■■ 4.94
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HDAC11-209ENST00000418189 TOPBP1Q92547 1522 aa45.39■■■■■ 4.86
HDAC11-209ENST00000418189 IFT140Q96RY7 1462 aa45.36■■■■■ 4.85
HDAC11-209ENST00000418189 ABCC8Q09428 1581 aa45.33■■■■■ 4.85
HDAC11-209ENST00000418189 OSCARQ8IYS5 282 aa45.29■■■■■ 4.84
HDAC11-209ENST00000418189 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.27■■■■■ 4.84
HDAC11-209ENST00000418189 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP45.24■■■■■ 4.83
HDAC11-209ENST00000418189 TRIM41Q8WV44 630 aa45.19■■■■■ 4.82
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HDAC11-209ENST00000418189 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.72■■■■■ 4.75
HDAC11-209ENST00000418189 CHD1O14646 1710 aa44.71■■■■■ 4.75
HDAC11-209ENST00000418189 SOGA1O94964 1423 aa44.69■■■■■ 4.75
HDAC11-209ENST00000418189 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.66■■■■■ 4.74
HDAC11-209ENST00000418189 CUX1P39880 1505 aa44.65■■■■■ 4.74
HDAC11-209ENST00000418189 ARHGEF11O15085 1522 aa44.63■■■■■ 4.73
HDAC11-209ENST00000418189 WDR97A6NE52 1622 aa44.62■■■■■ 4.73
HDAC11-209ENST00000418189 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.56■■■■■ 4.72
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HDAC11-209ENST00000418189 FBLN2P98095 1184 aa44.45■■■■■ 4.71
HDAC11-209ENST00000418189 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.41■■■■■ 4.7
HDAC11-209ENST00000418189 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP44.34■■■■■ 4.69
HDAC11-209ENST00000418189 GRIN2BQ13224 1484 aa44.34■■■■■ 4.69
HDAC11-209ENST00000418189 PBRM1Q86U86 1689 aa44.22■■■■■ 4.67
HDAC11-209ENST00000418189 CLASP1Q7Z460 1538 aa44.19■■■■■ 4.67
HDAC11-209ENST00000418189 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa44.19■■■■■ 4.67
HDAC11-209ENST00000418189 CYB5RLQ6IPT4 315 aa44.19■■■■■ 4.66
HDAC11-209ENST00000418189 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP44.19■■■■■ 4.66
HDAC11-209ENST00000418189 ARAP1Q96P48 1450 aa44.19■■■■■ 4.66
HDAC11-209ENST00000418189 SYNJ1O43426 1573 aa44.18■■■■■ 4.66
HDAC11-209ENST00000418189 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.18■■■■■ 4.66
HDAC11-209ENST00000418189 SYNJ2O15056 1496 aa44.17■■■■■ 4.66
HDAC11-209ENST00000418189 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.14■■■■■ 4.66
HDAC11-209ENST00000418189 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.04■■■■■ 4.64
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HDAC11-209ENST00000418189 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP44■■■■■ 4.63
HDAC11-209ENST00000418189 ADAMTS12P58397 1594 aa43.8■■■■■ 4.6
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HDAC11-209ENST00000418189 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.64■■■■■ 4.58
HDAC11-209ENST00000418189 NUP160Q12769 1436 aa43.63■■■■■ 4.57
HDAC11-209ENST00000418189 CEP170Q5SW79 1584 aa43.6■■■■■ 4.57
HDAC11-209ENST00000418189 ERCC6L2Q5T890 1561 aa43.47■■■■■ 4.55
HDAC11-209ENST00000418189 SHROOM2Q13796 1616 aa43.45■■■■■ 4.55
HDAC11-209ENST00000418189 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.17■■■■■ 4.5
HDAC11-209ENST00000418189 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP43.14■■■■■ 4.5
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HDAC11-209ENST00000418189 JPH4Q96JJ6 628 aa43.1■■■■■ 4.49
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