RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417985.1

ACTBP1-201, Transcript of actin, beta pseudogene 1, humanhuman

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Gene ACTBP1, Length 1,113 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP1-201ENST00000417985 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.63■■■□□ 2.33
ACTBP1-201ENST00000417985 ABCC9O60706 1549 aa26.82■■□□□ 1.88
ACTBP1-201ENST00000417985 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.62■■□□□ 1.85
ACTBP1-201ENST00000417985 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.43■■□□□ 1.66
ACTBP1-201ENST00000417985 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.42■■□□□ 1.66
ACTBP1-201ENST00000417985 NACADO15069 1562 aa25.23■■□□□ 1.63
ACTBP1-201ENST00000417985 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24.98■■□□□ 1.59
ACTBP1-201ENST00000417985 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.96■■□□□ 1.59
ACTBP1-201ENST00000417985 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.86■■□□□ 1.57
ACTBP1-201ENST00000417985 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.86■■□□□ 1.57
ACTBP1-201ENST00000417985 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.78■■□□□ 1.56
ACTBP1-201ENST00000417985 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
ACTBP1-201ENST00000417985 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.47■■□□□ 1.51
ACTBP1-201ENST00000417985 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.37■■□□□ 1.49
ACTBP1-201ENST00000417985 SCRIBQ14160 1630 aa24.24■■□□□ 1.47
ACTBP1-201ENST00000417985 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.23■■□□□ 1.47
ACTBP1-201ENST00000417985 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.19■■□□□ 1.46
ACTBP1-201ENST00000417985 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
ACTBP1-201ENST00000417985 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.44■■□□□ 1.34
ACTBP1-201ENST00000417985 NCAPD3P42695 1498 aa23.35■■□□□ 1.33
ACTBP1-201ENST00000417985 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.24■■□□□ 1.31
ACTBP1-201ENST00000417985 CUX2O14529 1486 aa23.19■■□□□ 1.3
ACTBP1-201ENST00000417985 SMARCA4P51532 1647 aa23.13■■□□□ 1.29
ACTBP1-201ENST00000417985 HMGXB3Q12766 1538 aa23.12■■□□□ 1.29
ACTBP1-201ENST00000417985 ERCC6Q03468 1493 aa23.11■■□□□ 1.29
ACTBP1-201ENST00000417985 SMARCA2P51531 1590 aa23.1■■□□□ 1.29
ACTBP1-201ENST00000417985 NESP48681 1621 aa23.02■■□□□ 1.28
ACTBP1-201ENST00000417985 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
ACTBP1-201ENST00000417985 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.95■■□□□ 1.26
ACTBP1-201ENST00000417985 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
ACTBP1-201ENST00000417985 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.84■■□□□ 1.25
ACTBP1-201ENST00000417985 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
ACTBP1-201ENST00000417985 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.79■■□□□ 1.24
ACTBP1-201ENST00000417985 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.66■■□□□ 1.22
ACTBP1-201ENST00000417985 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.65■■□□□ 1.22
ACTBP1-201ENST00000417985 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.6■■□□□ 1.21
ACTBP1-201ENST00000417985 WIZO95785 1651 aa22.52■■□□□ 1.2
ACTBP1-201ENST00000417985 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.49■■□□□ 1.19
ACTBP1-201ENST00000417985 WDR62O43379 1518 aa22.47■■□□□ 1.19
ACTBP1-201ENST00000417985 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.34■■□□□ 1.17
ACTBP1-201ENST00000417985 CFTRP13569 1480 aa22.32■■□□□ 1.16
ACTBP1-201ENST00000417985 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.32■■□□□ 1.16
ACTBP1-201ENST00000417985 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
ACTBP1-201ENST00000417985 TRIM41Q8WV44 630 aa22.24■■□□□ 1.15
ACTBP1-201ENST00000417985 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
ACTBP1-201ENST00000417985 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
ACTBP1-201ENST00000417985 OSCARQ8IYS5 282 aa22.09■■□□□ 1.13
ACTBP1-201ENST00000417985 CCDC88BA6NC98 1476 aa22■■□□□ 1.11
ACTBP1-201ENST00000417985 PRDM2Q13029 1718 aa21.99■■□□□ 1.11
ACTBP1-201ENST00000417985 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
ACTBP1-201ENST00000417985 IFT140Q96RY7 1462 aa21.91■■□□□ 1.1
ACTBP1-201ENST00000417985 TOPBP1Q92547 1522 aa21.9■■□□□ 1.1
ACTBP1-201ENST00000417985 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa21.84■■□□□ 1.09
ACTBP1-201ENST00000417985 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa21.84■■□□□ 1.09
ACTBP1-201ENST00000417985 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa21.84■■□□□ 1.09
ACTBP1-201ENST00000417985 ABCC8Q09428 1581 aa21.79■■□□□ 1.08
ACTBP1-201ENST00000417985 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.78■■□□□ 1.08
ACTBP1-201ENST00000417985 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
ACTBP1-201ENST00000417985 ARHGEF11O15085 1522 aa21.76■■□□□ 1.07
ACTBP1-201ENST00000417985 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
ACTBP1-201ENST00000417985 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.71■■□□□ 1.07
ACTBP1-201ENST00000417985 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
ACTBP1-201ENST00000417985 CHD1O14646 1710 aa21.62■■□□□ 1.05
ACTBP1-201ENST00000417985 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.59■■□□□ 1.05
ACTBP1-201ENST00000417985 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.58■■□□□ 1.05
ACTBP1-201ENST00000417985 ARAP1Q96P48 1450 aa21.56■■□□□ 1.04
ACTBP1-201ENST00000417985 SOGA1O94964 1423 aa21.54■■□□□ 1.04
ACTBP1-201ENST00000417985 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
ACTBP1-201ENST00000417985 FBLN2P98095 1184 aa21.51■■□□□ 1.03
ACTBP1-201ENST00000417985 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.49■■□□□ 1.03
ACTBP1-201ENST00000417985 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.46■■□□□ 1.03
ACTBP1-201ENST00000417985 CUX1P39880 1505 aa21.46■■□□□ 1.03
ACTBP1-201ENST00000417985 WDR97A6NE52 1622 aa21.45■■□□□ 1.02
ACTBP1-201ENST00000417985 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.43■■□□□ 1.02
ACTBP1-201ENST00000417985 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
ACTBP1-201ENST00000417985 GRIN2BQ13224 1484 aa21.37■■□□□ 1.01
ACTBP1-201ENST00000417985 TRHP20396 242 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
ACTBP1-201ENST00000417985 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
ACTBP1-201ENST00000417985 SYNJ1O43426 1573 aa21.33■■□□□ 1.01
ACTBP1-201ENST00000417985 SYNJ2O15056 1496 aa21.32■■□□□ 1
ACTBP1-201ENST00000417985 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.26■□□□□ 0.99
ACTBP1-201ENST00000417985 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.24■□□□□ 0.99
ACTBP1-201ENST00000417985 PBRM1Q86U86 1689 aa21.24■□□□□ 0.99
ACTBP1-201ENST00000417985 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.22■□□□□ 0.99
ACTBP1-201ENST00000417985 GRIN2AQ12879 1464 aa21.11■□□□□ 0.97
ACTBP1-201ENST00000417985 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.1■□□□□ 0.97
ACTBP1-201ENST00000417985 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.09■□□□□ 0.97
ACTBP1-201ENST00000417985 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
ACTBP1-201ENST00000417985 NUP160Q12769 1436 aa21.08■□□□□ 0.97
ACTBP1-201ENST00000417985 ADAMTS12P58397 1594 aa21.07■□□□□ 0.96
ACTBP1-201ENST00000417985 CEP170Q5SW79 1584 aa21.06■□□□□ 0.96
ACTBP1-201ENST00000417985 TOP2BQ02880 1626 aa21.04■□□□□ 0.96
ACTBP1-201ENST00000417985 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.04■□□□□ 0.96
ACTBP1-201ENST00000417985 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.99■□□□□ 0.95
ACTBP1-201ENST00000417985 SHROOM2Q13796 1616 aa20.99■□□□□ 0.95
ACTBP1-201ENST00000417985 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.95■□□□□ 0.94
ACTBP1-201ENST00000417985 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
ACTBP1-201ENST00000417985 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
ACTBP1-201ENST00000417985 JPH4Q96JJ6 628 aa20.82■□□□□ 0.92
ACTBP1-201ENST00000417985 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa20.78■□□□□ 0.92
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