RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416820.5

BMI1-202, Transcript of BMI1 proto-oncogene, polycomb ring finger, humanhuman

TSL 5

Gene BMI1, Length 406 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMI1-202ENST00000416820 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.03■■■■■ 6.4
BMI1-202ENST00000416820 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.27■■■■■ 5.48
BMI1-202ENST00000416820 ABCC9O60706 1549 aa48.58■■■■■ 5.37
BMI1-202ENST00000416820 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.56■■■■■ 5.04
BMI1-202ENST00000416820 NACADO15069 1562 aa46.39■■■■■ 5.02
BMI1-202ENST00000416820 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.01■■■■■ 4.96
BMI1-202ENST00000416820 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.93■■■■■ 4.94
BMI1-202ENST00000416820 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.74■■■■■ 4.91
BMI1-202ENST00000416820 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.65■■■■■ 4.9
BMI1-202ENST00000416820 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.57■■■■■ 4.89
BMI1-202ENST00000416820 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.24■■■■■ 4.83
BMI1-202ENST00000416820 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.22■■■■■ 4.83
BMI1-202ENST00000416820 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.14■■■■■ 4.82
BMI1-202ENST00000416820 SCRIBQ14160 1630 aa44.77■■■■■ 4.76
BMI1-202ENST00000416820 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.72■■■■■ 4.75
BMI1-202ENST00000416820 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.05■■■■■ 4.64
BMI1-202ENST00000416820 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.01■■■■■ 4.64
BMI1-202ENST00000416820 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.74■■■■■ 4.59
BMI1-202ENST00000416820 SMARCA4P51532 1647 aa42.85■■■■■ 4.45
BMI1-202ENST00000416820 NCAPD3P42695 1498 aa42.81■■■■■ 4.44
BMI1-202ENST00000416820 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.72■■■■■ 4.43
BMI1-202ENST00000416820 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.69■■■■■ 4.42
BMI1-202ENST00000416820 SMARCA2P51531 1590 aa42.65■■■■■ 4.42
BMI1-202ENST00000416820 HMGXB3Q12766 1538 aa42.58■■■■■ 4.41
BMI1-202ENST00000416820 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.5■■■■■ 4.39
BMI1-202ENST00000416820 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.39■■■■■ 4.38
BMI1-202ENST00000416820 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.3■■■■■ 4.36
BMI1-202ENST00000416820 WIZO95785 1651 aa41.92■■■■■ 4.3
BMI1-202ENST00000416820 NESP48681 1621 aa41.91■■■■■ 4.3
BMI1-202ENST00000416820 ERCC6Q03468 1493 aa41.87■■■■■ 4.29
BMI1-202ENST00000416820 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.79■■■■■ 4.28
BMI1-202ENST00000416820 CUX2O14529 1486 aa41.76■■■■■ 4.28
BMI1-202ENST00000416820 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.67■■■■■ 4.26
BMI1-202ENST00000416820 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.5■■■■■ 4.23
BMI1-202ENST00000416820 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.49■■■■■ 4.23
BMI1-202ENST00000416820 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.48■■■■■ 4.23
BMI1-202ENST00000416820 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.44■■■■■ 4.22
BMI1-202ENST00000416820 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.44■■■■■ 4.22
BMI1-202ENST00000416820 CFTRP13569 1480 aa41.15■■■■■ 4.18
BMI1-202ENST00000416820 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.09■■■■■ 4.17
BMI1-202ENST00000416820 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.07■■■■■ 4.16
BMI1-202ENST00000416820 WDR62O43379 1518 aa41.02■■■■■ 4.16
BMI1-202ENST00000416820 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.99■■■■■ 4.15
BMI1-202ENST00000416820 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.99■■■■■ 4.15
BMI1-202ENST00000416820 PRDM2Q13029 1718 aa40.93■■■■■ 4.14
BMI1-202ENST00000416820 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.91■■■■■ 4.14
BMI1-202ENST00000416820 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.66■■■■■ 4.1
BMI1-202ENST00000416820 TOPBP1Q92547 1522 aa40.31■■■■■ 4.04
BMI1-202ENST00000416820 ABCC8Q09428 1581 aa40.27■■■■■ 4.04
BMI1-202ENST00000416820 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.23■■■■■ 4.03
BMI1-202ENST00000416820 IFT140Q96RY7 1462 aa40.18■■■■■ 4.02
BMI1-202ENST00000416820 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.04■■■■■ 4
BMI1-202ENST00000416820 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.99■■■■□ 3.99
BMI1-202ENST00000416820 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.98■■■■□ 3.99
BMI1-202ENST00000416820 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.93■■■■□ 3.98
BMI1-202ENST00000416820 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.91■■■■□ 3.98
BMI1-202ENST00000416820 OSCARQ8IYS5 282 aa39.81■■■■□ 3.96
BMI1-202ENST00000416820 CUX1P39880 1505 aa39.8■■■■□ 3.96
BMI1-202ENST00000416820 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.72■■■■□ 3.95
BMI1-202ENST00000416820 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.71■■■■□ 3.95
BMI1-202ENST00000416820 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.71■■■■□ 3.95
BMI1-202ENST00000416820 SOGA1O94964 1423 aa39.69■■■■□ 3.94
BMI1-202ENST00000416820 WDR97A6NE52 1622 aa39.65■■■■□ 3.94
BMI1-202ENST00000416820 CHD1O14646 1710 aa39.54■■■■□ 3.92
BMI1-202ENST00000416820 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.51■■■■□ 3.92
BMI1-202ENST00000416820 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.37■■■■□ 3.89
BMI1-202ENST00000416820 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.36■■■■□ 3.89
BMI1-202ENST00000416820 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.36■■■■□ 3.89
BMI1-202ENST00000416820 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.36■■■■□ 3.89
BMI1-202ENST00000416820 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.35■■■■□ 3.89
BMI1-202ENST00000416820 TOP2BQ02880 1626 aa39.34■■■■□ 3.89
BMI1-202ENST00000416820 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.34■■■■□ 3.89
BMI1-202ENST00000416820 TRIM41Q8WV44 630 aa39.33■■■■□ 3.89
BMI1-202ENST00000416820 GRIN2BQ13224 1484 aa39.32■■■■□ 3.89
BMI1-202ENST00000416820 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.31■■■■□ 3.88
BMI1-202ENST00000416820 PBRM1Q86U86 1689 aa39.3■■■■□ 3.88
BMI1-202ENST00000416820 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.29■■■■□ 3.88
BMI1-202ENST00000416820 SYNJ1O43426 1573 aa39.27■■■■□ 3.88
BMI1-202ENST00000416820 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.27■■■■□ 3.88
BMI1-202ENST00000416820 ARHGEF11O15085 1522 aa39.26■■■■□ 3.88
BMI1-202ENST00000416820 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.24■■■■□ 3.87
BMI1-202ENST00000416820 FBLN2P98095 1184 aa39.2■■■■□ 3.87
BMI1-202ENST00000416820 SYNJ2O15056 1496 aa39.16■■■■□ 3.86
BMI1-202ENST00000416820 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.1■■■■□ 3.85
BMI1-202ENST00000416820 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.07■■■■□ 3.85
BMI1-202ENST00000416820 ADAMTS12P58397 1594 aa38.92■■■■□ 3.82
BMI1-202ENST00000416820 ARAP1Q96P48 1450 aa38.91■■■■□ 3.82
BMI1-202ENST00000416820 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.88■■■■□ 3.81
BMI1-202ENST00000416820 GRIN2AQ12879 1464 aa38.84■■■■□ 3.81
BMI1-202ENST00000416820 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.8■■■■□ 3.8
BMI1-202ENST00000416820 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.78■■■■□ 3.8
BMI1-202ENST00000416820 NUP160Q12769 1436 aa38.72■■■■□ 3.79
BMI1-202ENST00000416820 CEP170Q5SW79 1584 aa38.7■■■■□ 3.79
BMI1-202ENST00000416820 SHROOM2Q13796 1616 aa38.56■■■■□ 3.76
BMI1-202ENST00000416820 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.48■■■■□ 3.75
BMI1-202ENST00000416820 KIF27Q86VH2 1401 aa38.47■■■■□ 3.75
BMI1-202ENST00000416820 IGF1RP08069 1367 aa38.43■■■■□ 3.74
BMI1-202ENST00000416820 CUL7Q14999 1698 aa38.43■■■■□ 3.74
BMI1-202ENST00000416820 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.38■■■■□ 3.73
BMI1-202ENST00000416820 JPH4Q96JJ6 628 aa38.22■■■■□ 3.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 212.2 ms