RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415107.5

ATG4B-207, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4B, Length 356 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-207ENST00000415107 NISCHQ9Y2I1 1504 aa28.75■■■□□ 2.19
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ATG4B-207ENST00000415107 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
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ATG4B-207ENST00000415107 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa23.84■■□□□ 1.41
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ATG4B-207ENST00000415107 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.28■■□□□ 1.16
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ATG4B-207ENST00000415107 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.11■■□□□ 1.13
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ATG4B-207ENST00000415107 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.1■□□□□ 0.97
ATG4B-207ENST00000415107 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.07■□□□□ 0.96
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ATG4B-207ENST00000415107 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa20.4■□□□□ 0.86
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ATG4B-207ENST00000415107 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.27■□□□□ 0.84
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ATG4B-207ENST00000415107 KIF27Q86VH2 1401 aa20.26■□□□□ 0.83
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ATG4B-207ENST00000415107 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa19.83■□□□□ 0.77
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