RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414804.5

HERC2P3-202, Transcript of hect domain and RLD 2 pseudogene 3, humanhuman

TSL 4

Gene HERC2P3, Length 522 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2P3-202ENST00000414804 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.19■■■■■ 6.75
HERC2P3-202ENST00000414804 ABCC9O60706 1549 aa52.16■■■■■ 5.94
HERC2P3-202ENST00000414804 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.53■■■■■ 5.84
HERC2P3-202ENST00000414804 DNAJC5BQ9UF47 199 aa49.5■■■■■ 5.51
HERC2P3-202ENST00000414804 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.41■■■■■ 5.5
HERC2P3-202ENST00000414804 NACADO15069 1562 aa48.94■■■■■ 5.43
HERC2P3-202ENST00000414804 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.7■■■■■ 5.39
HERC2P3-202ENST00000414804 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.54■■■■■ 5.36
HERC2P3-202ENST00000414804 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.12■■■■■ 5.29
HERC2P3-202ENST00000414804 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.09■■■■■ 5.29
HERC2P3-202ENST00000414804 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.89■■■■■ 5.26
HERC2P3-202ENST00000414804 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.33■■■■■ 5.17
HERC2P3-202ENST00000414804 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.23■■■■■ 5.15
HERC2P3-202ENST00000414804 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.22■■■■■ 5.15
HERC2P3-202ENST00000414804 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.09■■■■■ 5.13
HERC2P3-202ENST00000414804 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.06■■■■■ 5.12
HERC2P3-202ENST00000414804 SCRIBQ14160 1630 aa46.88■■■■■ 5.1
HERC2P3-202ENST00000414804 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.81■■■■■ 5.08
HERC2P3-202ENST00000414804 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa46.01■■■■■ 4.96
HERC2P3-202ENST00000414804 CUX2O14529 1486 aa45.26■■■■■ 4.84
HERC2P3-202ENST00000414804 NCAPD3P42695 1498 aa45.22■■■■■ 4.83
HERC2P3-202ENST00000414804 ERCC6Q03468 1493 aa45.15■■■■■ 4.82
HERC2P3-202ENST00000414804 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.95■■■■■ 4.79
HERC2P3-202ENST00000414804 SMARCA2P51531 1590 aa44.82■■■■■ 4.76
HERC2P3-202ENST00000414804 HMGXB3Q12766 1538 aa44.75■■■■■ 4.76
HERC2P3-202ENST00000414804 SMARCA4P51532 1647 aa44.69■■■■■ 4.74
HERC2P3-202ENST00000414804 NESP48681 1621 aa44.6■■■■■ 4.73
HERC2P3-202ENST00000414804 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.5■■■■■ 4.71
HERC2P3-202ENST00000414804 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.45■■■■■ 4.71
HERC2P3-202ENST00000414804 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.29■■■■■ 4.68
HERC2P3-202ENST00000414804 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.26■■■■■ 4.68
HERC2P3-202ENST00000414804 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.22■■■■■ 4.67
HERC2P3-202ENST00000414804 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.11■■■■■ 4.65
HERC2P3-202ENST00000414804 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.01■■■■■ 4.64
HERC2P3-202ENST00000414804 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.94■■■■■ 4.63
HERC2P3-202ENST00000414804 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.84■■■■■ 4.61
HERC2P3-202ENST00000414804 TRIM41Q8WV44 630 aa43.71■■■■■ 4.59
HERC2P3-202ENST00000414804 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.68■■■■■ 4.58
HERC2P3-202ENST00000414804 WDR62O43379 1518 aa43.54■■■■■ 4.56
HERC2P3-202ENST00000414804 WIZO95785 1651 aa43.43■■■■■ 4.54
HERC2P3-202ENST00000414804 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.39■■■■■ 4.54
HERC2P3-202ENST00000414804 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.29■■■■■ 4.52
HERC2P3-202ENST00000414804 OSCARQ8IYS5 282 aa43.23■■■■■ 4.51
HERC2P3-202ENST00000414804 CFTRP13569 1480 aa43.17■■■■■ 4.5
HERC2P3-202ENST00000414804 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.95■■■■■ 4.47
HERC2P3-202ENST00000414804 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.92■■■■■ 4.46
HERC2P3-202ENST00000414804 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.88■■■■■ 4.46
HERC2P3-202ENST00000414804 IFT140Q96RY7 1462 aa42.58■■■■■ 4.41
HERC2P3-202ENST00000414804 PRDM2Q13029 1718 aa42.55■■■■■ 4.4
HERC2P3-202ENST00000414804 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.51■■■■■ 4.4
HERC2P3-202ENST00000414804 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.51■■■■■ 4.4
HERC2P3-202ENST00000414804 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.51■■■■■ 4.4
HERC2P3-202ENST00000414804 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.48■■■■■ 4.39
HERC2P3-202ENST00000414804 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.44■■■■■ 4.38
HERC2P3-202ENST00000414804 TOPBP1Q92547 1522 aa42.38■■■■■ 4.37
HERC2P3-202ENST00000414804 ABCC8Q09428 1581 aa42.37■■■■■ 4.37
HERC2P3-202ENST00000414804 ARHGEF11O15085 1522 aa42.35■■■■■ 4.37
HERC2P3-202ENST00000414804 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.21■■■■■ 4.35
HERC2P3-202ENST00000414804 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.18■■■■■ 4.34
HERC2P3-202ENST00000414804 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.15■■■■■ 4.34
HERC2P3-202ENST00000414804 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.08■■■■■ 4.33
HERC2P3-202ENST00000414804 FBLN2P98095 1184 aa42.04■■■■■ 4.32
HERC2P3-202ENST00000414804 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.99■■■■■ 4.31
HERC2P3-202ENST00000414804 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.98■■■■■ 4.31
HERC2P3-202ENST00000414804 CHD1O14646 1710 aa41.96■■■■■ 4.31
HERC2P3-202ENST00000414804 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.9■■■■■ 4.3
HERC2P3-202ENST00000414804 ARAP1Q96P48 1450 aa41.87■■■■■ 4.29
HERC2P3-202ENST00000414804 SOGA1O94964 1423 aa41.79■■■■■ 4.28
HERC2P3-202ENST00000414804 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.76■■■■■ 4.28
HERC2P3-202ENST00000414804 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.76■■■■■ 4.28
HERC2P3-202ENST00000414804 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.66■■■■■ 4.26
HERC2P3-202ENST00000414804 WDR97A6NE52 1622 aa41.6■■■■■ 4.25
HERC2P3-202ENST00000414804 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.6■■■■■ 4.25
HERC2P3-202ENST00000414804 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.54■■■■■ 4.24
HERC2P3-202ENST00000414804 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.52■■■■■ 4.24
HERC2P3-202ENST00000414804 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.51■■■■■ 4.24
HERC2P3-202ENST00000414804 SYNJ1O43426 1573 aa41.5■■■■■ 4.23
HERC2P3-202ENST00000414804 GRIN2BQ13224 1484 aa41.47■■■■■ 4.23
HERC2P3-202ENST00000414804 SYNJ2O15056 1496 aa41.39■■■■■ 4.22
HERC2P3-202ENST00000414804 CUX1P39880 1505 aa41.39■■■■■ 4.22
HERC2P3-202ENST00000414804 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP41.25■■■■■ 4.19
HERC2P3-202ENST00000414804 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.23■■■■■ 4.19
HERC2P3-202ENST00000414804 PBRM1Q86U86 1689 aa41.12■■■■■ 4.17
HERC2P3-202ENST00000414804 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.08■■■■■ 4.17
HERC2P3-202ENST00000414804 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.98■■■■■ 4.15
HERC2P3-202ENST00000414804 GRIN2AQ12879 1464 aa40.9■■■■■ 4.14
HERC2P3-202ENST00000414804 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.86■■■■■ 4.13
HERC2P3-202ENST00000414804 NUP160Q12769 1436 aa40.78■■■■■ 4.12
HERC2P3-202ENST00000414804 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.78■■■■■ 4.12
HERC2P3-202ENST00000414804 CEP170Q5SW79 1584 aa40.74■■■■■ 4.11
HERC2P3-202ENST00000414804 ADAMTS12P58397 1594 aa40.71■■■■■ 4.11
HERC2P3-202ENST00000414804 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.71■■■■■ 4.11
HERC2P3-202ENST00000414804 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.68■■■■■ 4.1
HERC2P3-202ENST00000414804 SHROOM2Q13796 1616 aa40.6■■■■■ 4.09
HERC2P3-202ENST00000414804 TOP2BQ02880 1626 aa40.58■■■■■ 4.09
HERC2P3-202ENST00000414804 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.56■■■■■ 4.08
HERC2P3-202ENST00000414804 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.54■■■■■ 4.08
HERC2P3-202ENST00000414804 JPH4Q96JJ6 628 aa40.49■■■■■ 4.07
HERC2P3-202ENST00000414804 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.49■■■■■ 4.07
HERC2P3-202ENST00000414804 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP40.38■■■■■ 4.05
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