RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411888.5

EIF4G3-206, Transcript of eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 3, humanhuman

TSL 5

Gene EIF4G3, Length 1,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4G3-206ENST00000411888 NISCHQ9Y2I1 1504 aa66.02■■■■■ 8.16
EIF4G3-206ENST00000411888 ABCC9O60706 1549 aa59.72■■■■■ 7.15
EIF4G3-206ENST00000411888 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa59.45■■■■■ 7.11
EIF4G3-206ENST00000411888 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa56.75■■■■■ 6.67
EIF4G3-206ENST00000411888 DNAJC5BQ9UF47 199 aa56.4■■■■■ 6.62
EIF4G3-206ENST00000411888 NACADO15069 1562 aa56.29■■■■■ 6.6
EIF4G3-206ENST00000411888 DCAF8L2P0C7V8 631 aa55.81■■■■■ 6.52
EIF4G3-206ENST00000411888 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP55.53■■■■■ 6.48
EIF4G3-206ENST00000411888 UNC13AQ9UPW8 1703 aa55.5■■■■■ 6.48
EIF4G3-206ENST00000411888 MYO15BQ96JP2 1530 aa55.43■■■■■ 6.46
EIF4G3-206ENST00000411888 BICRAQ9NZM4 1560 aa55.11■■■■■ 6.41
EIF4G3-206ENST00000411888 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP54.61■■■■■ 6.33
EIF4G3-206ENST00000411888 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa54.56■■■■■ 6.32
EIF4G3-206ENST00000411888 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa54.36■■■■■ 6.29
EIF4G3-206ENST00000411888 SCRIBQ14160 1630 aa54.05■■■■■ 6.24
EIF4G3-206ENST00000411888 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa53.98■■■■■ 6.23
EIF4G3-206ENST00000411888 CECR2Q9BXF3 1484 aa53.87■■■■■ 6.21
EIF4G3-206ENST00000411888 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP53.77■■■■■ 6.2
EIF4G3-206ENST00000411888 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa52.12■■■■■ 5.93
EIF4G3-206ENST00000411888 NCAPD3P42695 1498 aa51.97■■■■■ 5.91
EIF4G3-206ENST00000411888 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa51.73■■■■■ 5.87
EIF4G3-206ENST00000411888 CUX2O14529 1486 aa51.7■■■■■ 5.87
EIF4G3-206ENST00000411888 ERCC6Q03468 1493 aa51.6■■■■■ 5.85
EIF4G3-206ENST00000411888 SMARCA4P51532 1647 aa51.58■■■■■ 5.85
EIF4G3-206ENST00000411888 SMARCA2P51531 1590 aa51.57■■■■■ 5.85
EIF4G3-206ENST00000411888 HMGXB3Q12766 1538 aa51.54■■■■■ 5.84
EIF4G3-206ENST00000411888 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP51.28■■■■■ 5.8
EIF4G3-206ENST00000411888 NESP48681 1621 aa51.2■■■■■ 5.79
EIF4G3-206ENST00000411888 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP51.18■■■■■ 5.78
EIF4G3-206ENST00000411888 PEG3Q9GZU2 1588 aa51.12■■■■■ 5.77
EIF4G3-206ENST00000411888 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa50.85■■■■■ 5.73
EIF4G3-206ENST00000411888 MROH2BQ7Z745 1585 aa50.85■■■■■ 5.73
EIF4G3-206ENST00000411888 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP50.8■■■■■ 5.72
EIF4G3-206ENST00000411888 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa50.57■■■■■ 5.69
EIF4G3-206ENST00000411888 PDS5BQ9NTI5 1447 aa50.56■■■■■ 5.68
EIF4G3-206ENST00000411888 CADPSQ9ULU8 1353 aa50.35■■■■■ 5.65
EIF4G3-206ENST00000411888 WIZO95785 1651 aa50.22■■■■■ 5.63
EIF4G3-206ENST00000411888 MRC2Q9UBG0 1479 aa50.12■■■■■ 5.61
EIF4G3-206ENST00000411888 WDR62O43379 1518 aa50.03■■■■■ 5.6
EIF4G3-206ENST00000411888 CEP164Q9UPV0 1460 aa49.84■■■■■ 5.57
EIF4G3-206ENST00000411888 FANCD2Q9BXW9 1451 aa49.75■■■■■ 5.55
EIF4G3-206ENST00000411888 CFTRP13569 1480 aa49.7■■■■■ 5.55
EIF4G3-206ENST00000411888 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP49.66■■■■■ 5.54
EIF4G3-206ENST00000411888 TRIM41Q8WV44 630 aa49.57■■■■■ 5.53
EIF4G3-206ENST00000411888 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP49.56■■■■■ 5.52
EIF4G3-206ENST00000411888 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP49.37■■■■■ 5.49
EIF4G3-206ENST00000411888 OSCARQ8IYS5 282 aa49.28■■■■■ 5.48
EIF4G3-206ENST00000411888 PRDM2Q13029 1718 aa49.22■■■■■ 5.47
EIF4G3-206ENST00000411888 CCDC88BA6NC98 1476 aa49.01■■■■■ 5.44
EIF4G3-206ENST00000411888 IFT140Q96RY7 1462 aa48.88■■■■■ 5.42
EIF4G3-206ENST00000411888 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP48.81■■■■■ 5.4
EIF4G3-206ENST00000411888 TOPBP1Q92547 1522 aa48.78■■■■■ 5.4
EIF4G3-206ENST00000411888 ABCC8Q09428 1581 aa48.7■■■■■ 5.39
EIF4G3-206ENST00000411888 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa48.65■■■■■ 5.38
EIF4G3-206ENST00000411888 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa48.65■■■■■ 5.38
EIF4G3-206ENST00000411888 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa48.65■■■■■ 5.38
EIF4G3-206ENST00000411888 DNMBPQ6XZF7 1577 aa48.57■■■■■ 5.37
EIF4G3-206ENST00000411888 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP48.53■■■■■ 5.36
EIF4G3-206ENST00000411888 ARHGEF11O15085 1522 aa48.45■■■■■ 5.35
EIF4G3-206ENST00000411888 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP48.4■■■■■ 5.34
EIF4G3-206ENST00000411888 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP48.33■■■■■ 5.332e-8■■■□□ 16.9
EIF4G3-206ENST00000411888 CHD1O14646 1710 aa48.27■■■■■ 5.32
EIF4G3-206ENST00000411888 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP48.24■■■■■ 5.31
EIF4G3-206ENST00000411888 CYB5RLQ6IPT4 315 aa48.11■■■■■ 5.29
EIF4G3-206ENST00000411888 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa48.06■■■■■ 5.28
EIF4G3-206ENST00000411888 FBLN2P98095 1184 aa48.05■■■■■ 5.28
EIF4G3-206ENST00000411888 SOGA1O94964 1423 aa48.04■■■■■ 5.28
EIF4G3-206ENST00000411888 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP47.96■■■■■ 5.27
EIF4G3-206ENST00000411888 ARAP1Q96P48 1450 aa47.94■■■■■ 5.26
EIF4G3-206ENST00000411888 WDR97A6NE52 1622 aa47.92■■■■■ 5.26
EIF4G3-206ENST00000411888 FGD5Q6ZNL6 1462 aa47.88■■■■■ 5.26
EIF4G3-206ENST00000411888 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa47.81■■■■■ 5.24
EIF4G3-206ENST00000411888 CUX1P39880 1505 aa47.79■■■■■ 5.24
EIF4G3-206ENST00000411888 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP47.72■■■■■ 5.23
EIF4G3-206ENST00000411888 CLASP1Q7Z460 1538 aa47.71■■■■■ 5.23
EIF4G3-206ENST00000411888 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP47.68■■■■■ 5.22
EIF4G3-206ENST00000411888 TRHP20396 242 aaPredicted RBP47.67■■■■■ 5.22
EIF4G3-206ENST00000411888 GRIN2BQ13224 1484 aa47.66■■■■■ 5.22
EIF4G3-206ENST00000411888 SYNJ1O43426 1573 aa47.64■■■■■ 5.22
EIF4G3-206ENST00000411888 SYNJ2O15056 1496 aa47.55■■■■■ 5.2
EIF4G3-206ENST00000411888 PBRM1Q86U86 1689 aa47.46■■■■■ 5.19
EIF4G3-206ENST00000411888 GAPVD1Q14C86 1478 aa47.44■■■■■ 5.18
EIF4G3-206ENST00000411888 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa47.35■■■■■ 5.17
EIF4G3-206ENST00000411888 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa47.31■■■■■ 5.16
EIF4G3-206ENST00000411888 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP47.1■■■■■ 5.13
EIF4G3-206ENST00000411888 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP47.07■■■■■ 5.13
EIF4G3-206ENST00000411888 GRIN2AQ12879 1464 aa47.04■■■■■ 5.12
EIF4G3-206ENST00000411888 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa46.97■■■■■ 5.11
EIF4G3-206ENST00000411888 ADAMTS12P58397 1594 aa46.96■■■■■ 5.11
EIF4G3-206ENST00000411888 TOP2BQ02880 1626 aa46.94■■■■■ 5.11
EIF4G3-206ENST00000411888 NUP160Q12769 1436 aa46.92■■■■■ 5.1
EIF4G3-206ENST00000411888 ERCC6L2Q5T890 1561 aa46.9■■■■■ 5.1
EIF4G3-206ENST00000411888 CEP170Q5SW79 1584 aa46.89■■■■■ 5.1
EIF4G3-206ENST00000411888 FHAD1B1AJZ9 1412 aa46.83■■■■■ 5.09
EIF4G3-206ENST00000411888 SHROOM2Q13796 1616 aa46.78■■■■■ 5.08
EIF4G3-206ENST00000411888 ERICH3Q5RHP9 1530 aa46.76■■■■■ 5.08
EIF4G3-206ENST00000411888 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP46.57■■■■■ 5.05
EIF4G3-206ENST00000411888 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP46.46■■■■■ 5.03
EIF4G3-206ENST00000411888 JPH4Q96JJ6 628 aa46.45■■■■■ 5.03
EIF4G3-206ENST00000411888 KIF13AQ9H1H9 1805 aa46.36■■■■■ 5.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.1 ms