RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411000.1

RNU6-172P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 172, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-172P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-172P-201ENST00000411000 POTEDQ86YR6 584 aa6.1□□□□□ -1.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 CHIC1Q5VXU3 224 aa5.51□□□□□ -1.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 MSH5O43196 834 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 FOXD1Q16676 465 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-172P-201ENST00000411000 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 POTEHQ6S545 545 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP4.38□□□□□ -1.71
RNU6-172P-201ENST00000411000 PLSCR2Q9NRY7 297 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-172P-201ENST00000411000 RNF39Q9H2S5 420 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-172P-201ENST00000411000 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 DMRT2Q9Y5R5 561 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-172P-201ENST00000411000 PPP6R1Q9UPN7 881 aa3.92□□□□□ -1.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 ADRA2BP18089 450 aa3.86□□□□□ -1.79
RNU6-172P-201ENST00000411000 DCAF8L1A6NGE4 600 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 LHX8Q68G74 356 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-172P-201ENST00000411000 CHRDL2Q6WN34 429 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-172P-201ENST00000411000 DNAJC5BQ9UF47 199 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-172P-201ENST00000411000 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
RNU6-172P-201ENST00000411000 DSG3P32926 999 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 PCDH10Q9P2E7 1040 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 POTEMA6NI47 508 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 HAX1O00165 279 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
RNU6-172P-201ENST00000411000 PLPPR3Q6T4P5 718 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-172P-201ENST00000411000 POTEGQ6S5H5 508 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-172P-201ENST00000411000 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
RNU6-172P-201ENST00000411000 PIP4P2Q8N4L2 257 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-172P-201ENST00000411000 EVX2Q03828 476 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 CAPN15O75808 1086 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP3.33□□□□□ -1.88
RNU6-172P-201ENST00000411000 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
RNU6-172P-201ENST00000411000 GABBR2O75899 941 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-172P-201ENST00000411000 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
RNU6-172P-201ENST00000411000 OTUD5Q96G74 571 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP3.26□□□□□ -1.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 POTEIP0CG38 1075 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 ABCB7O75027 752 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 AKT1S1Q96B36 256 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-172P-201ENST00000411000 C19orf67A6NJJ6 358 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-172P-201ENST00000411000 MMRN1Q13201 1228 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-172P-201ENST00000411000 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP3.18□□□□□ -1.9
RNU6-172P-201ENST00000411000 CDAN1Q8IWY9 1227 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-172P-201ENST00000411000 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP3.17□□□□□ -1.9
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
RNU6-172P-201ENST00000411000 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-172P-201ENST00000411000 PITPNM1O00562 1244 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-172P-201ENST00000411000 TRHP20396 242 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-172P-201ENST00000411000 SPNS2Q8IVW8 549 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-172P-201ENST00000411000 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-172P-201ENST00000411000 POTEB2H3BUK9 544 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-172P-201ENST00000411000 CLCN6P51797 869 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 DCBLD2Q96PD2 775 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 APLP2Q06481 763 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 MAMSTRQ6ZN01 415 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-172P-201ENST00000411000 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-172P-201ENST00000411000 POTEJP0CG39 1038 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-172P-201ENST00000411000 SCUBE2Q9NQ36 999 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-172P-201ENST00000411000 CD44P16070 742 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-172P-201ENST00000411000 LOC100996750A0A140TA64 210 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-172P-201ENST00000411000 POLA2Q14181 598 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-172P-201ENST00000411000 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-172P-201ENST00000411000 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP2.86□□□□□ -1.95
RNU6-172P-201ENST00000411000 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
RNU6-172P-201ENST00000411000 ST18O60284 1047 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-172P-201ENST00000411000 METRNQ9UJH8 293 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
RNU6-172P-201ENST00000411000 OSCARQ8IYS5 282 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP2.82□□□□□ -1.96
RNU6-172P-201ENST00000411000 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP2.81□□□□□ -1.96
RNU6-172P-201ENST00000411000 C7P10643 843 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-172P-201ENST00000411000 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC39A7Q92504 469 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-172P-201ENST00000411000 CHADLQ6NUI6 762 aa2.8□□□□□ -1.96
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
RNU6-172P-201ENST00000411000 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
RNU6-172P-201ENST00000411000 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-172P-201ENST00000411000 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-172P-201ENST00000411000 CLEC11AQ9Y240 323 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-172P-201ENST00000411000 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-172P-201ENST00000411000 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-172P-201ENST00000411000 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZRANB1Q9UGI0 708 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-172P-201ENST00000411000 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP2.7□□□□□ -1.98
RNU6-172P-201ENST00000411000 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
RNU6-172P-201ENST00000411000 MARVELD3Q96A59 401 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-172P-201ENST00000411000 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP2.67□□□□□ -1.98
RNU6-172P-201ENST00000411000 MYT1LQ9UL68 1186 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLAIN1Q8ND83 568 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-172P-201ENST00000411000 POTEFA5A3E0 1075 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-172P-201ENST00000411000 HS3ST6Q96QI5 342 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-172P-201ENST00000411000 SPDYE2BA6NHP3 402 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC4A2P04920 1241 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-172P-201ENST00000411000 PRR29P0C7W0 189 aa2.64□□□□□ -1.99
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