RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000406423.5

ANKRD54-202, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene ANKRD54, Length 954 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-202ENST00000406423 NISCHQ9Y2I1 1504 aa42.71■■■■■ 4.43
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ANKRD54-202ENST00000406423 DNAJC5BQ9UF47 199 aa37.62■■■■□ 3.61
ANKRD54-202ENST00000406423 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa37.02■■■■□ 3.52
ANKRD54-202ENST00000406423 NACADO15069 1562 aa36.62■■■■□ 3.45
ANKRD54-202ENST00000406423 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP36.47■■■■□ 3.43
ANKRD54-202ENST00000406423 UNC13AQ9UPW8 1703 aa36.33■■■■□ 3.41
ANKRD54-202ENST00000406423 DCAF8L2P0C7V8 631 aa36.17■■■■□ 3.38
ANKRD54-202ENST00000406423 BICRAQ9NZM4 1560 aa36.15■■■■□ 3.38
ANKRD54-202ENST00000406423 MYO15BQ96JP2 1530 aa35.93■■■■□ 3.34
ANKRD54-202ENST00000406423 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa35.46■■■■□ 3.27
ANKRD54-202ENST00000406423 CECR2Q9BXF3 1484 aa35.44■■■■□ 3.26
ANKRD54-202ENST00000406423 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa35.41■■■■□ 3.26
ANKRD54-202ENST00000406423 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP35.27■■■■□ 3.24
ANKRD54-202ENST00000406423 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa35.22■■■■□ 3.23
ANKRD54-202ENST00000406423 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP35.22■■■■□ 3.23
ANKRD54-202ENST00000406423 SCRIBQ14160 1630 aa35.12■■■■□ 3.21
ANKRD54-202ENST00000406423 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa34.92■■■■□ 3.18
ANKRD54-202ENST00000406423 CUX2O14529 1486 aa34.09■■■■□ 3.05
ANKRD54-202ENST00000406423 NCAPD3P42695 1498 aa33.88■■■■□ 3.01
ANKRD54-202ENST00000406423 ERCC6Q03468 1493 aa33.85■■■■□ 3.01
ANKRD54-202ENST00000406423 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa33.69■■■□□ 2.98
ANKRD54-202ENST00000406423 NESP48681 1621 aa33.61■■■□□ 2.97
ANKRD54-202ENST00000406423 HMGXB3Q12766 1538 aa33.53■■■□□ 2.96
ANKRD54-202ENST00000406423 SMARCA2P51531 1590 aa33.46■■■□□ 2.95
ANKRD54-202ENST00000406423 SMARCA4P51532 1647 aa33.46■■■□□ 2.95
ANKRD54-202ENST00000406423 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP33.4■■■□□ 2.94
ANKRD54-202ENST00000406423 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP33.24■■■□□ 2.91
ANKRD54-202ENST00000406423 PEG3Q9GZU2 1588 aa33.17■■■□□ 2.9
ANKRD54-202ENST00000406423 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33.17■■■□□ 2.9
ANKRD54-202ENST00000406423 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP33.13■■■□□ 2.89
ANKRD54-202ENST00000406423 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa33.11■■■□□ 2.89
ANKRD54-202ENST00000406423 TRIM41Q8WV44 630 aa33■■■□□ 2.87
ANKRD54-202ENST00000406423 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.95■■■□□ 2.86
ANKRD54-202ENST00000406423 PDS5BQ9NTI5 1447 aa32.94■■■□□ 2.86
ANKRD54-202ENST00000406423 CADPSQ9ULU8 1353 aa32.78■■■□□ 2.84
ANKRD54-202ENST00000406423 MRC2Q9UBG0 1479 aa32.76■■■□□ 2.84
ANKRD54-202ENST00000406423 WDR62O43379 1518 aa32.76■■■□□ 2.83
ANKRD54-202ENST00000406423 WIZO95785 1651 aa32.5■■■□□ 2.79
ANKRD54-202ENST00000406423 CEP164Q9UPV0 1460 aa32.46■■■□□ 2.79
ANKRD54-202ENST00000406423 FANCD2Q9BXW9 1451 aa32.41■■■□□ 2.78
ANKRD54-202ENST00000406423 OSCARQ8IYS5 282 aa32.37■■■□□ 2.77
ANKRD54-202ENST00000406423 CFTRP13569 1480 aa32.29■■■□□ 2.76
ANKRD54-202ENST00000406423 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP32.26■■■□□ 2.75
ANKRD54-202ENST00000406423 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa32.14■■■□□ 2.74
ANKRD54-202ENST00000406423 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa32.14■■■□□ 2.74
ANKRD54-202ENST00000406423 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa32.14■■■□□ 2.74
ANKRD54-202ENST00000406423 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.99■■■□□ 2.71
ANKRD54-202ENST00000406423 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.99■■■□□ 2.71
ANKRD54-202ENST00000406423 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP31.98■■■□□ 2.71
ANKRD54-202ENST00000406423 ARHGEF11O15085 1522 aa31.95■■■□□ 2.71
ANKRD54-202ENST00000406423 PRDM2Q13029 1718 aa31.86■■■□□ 2.69
ANKRD54-202ENST00000406423 IFT140Q96RY7 1462 aa31.85■■■□□ 2.69
ANKRD54-202ENST00000406423 TOPBP1Q92547 1522 aa31.74■■■□□ 2.67
ANKRD54-202ENST00000406423 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP31.71■■■□□ 2.67
ANKRD54-202ENST00000406423 CYB5RLQ6IPT4 315 aa31.7■■■□□ 2.67
ANKRD54-202ENST00000406423 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.67■■■□□ 2.66
ANKRD54-202ENST00000406423 ARAP1Q96P48 1450 aa31.63■■■□□ 2.65
ANKRD54-202ENST00000406423 CHD1O14646 1710 aa31.6■■■□□ 2.65
ANKRD54-202ENST00000406423 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP31.56■■■□□ 2.64
ANKRD54-202ENST00000406423 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP31.56■■■□□ 2.64
ANKRD54-202ENST00000406423 DNMBPQ6XZF7 1577 aa31.53■■■□□ 2.64
ANKRD54-202ENST00000406423 ABCC8Q09428 1581 aa31.51■■■□□ 2.63
ANKRD54-202ENST00000406423 TRHP20396 242 aaPredicted RBP31.48■■■□□ 2.63
ANKRD54-202ENST00000406423 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP31.39■■■□□ 2.62
ANKRD54-202ENST00000406423 FBLN2P98095 1184 aa31.34■■■□□ 2.61
ANKRD54-202ENST00000406423 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa31.3■■■□□ 2.6
ANKRD54-202ENST00000406423 CLASP1Q7Z460 1538 aa31.27■■■□□ 2.6
ANKRD54-202ENST00000406423 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP31.23■■■□□ 2.59
ANKRD54-202ENST00000406423 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa31.2■■■□□ 2.58
ANKRD54-202ENST00000406423 SOGA1O94964 1423 aa31.16■■■□□ 2.58
ANKRD54-202ENST00000406423 WDR97A6NE52 1622 aa31.07■■■□□ 2.56
ANKRD54-202ENST00000406423 FGD5Q6ZNL6 1462 aa31.07■■■□□ 2.56
ANKRD54-202ENST00000406423 SYNJ1O43426 1573 aa31.06■■■□□ 2.56
ANKRD54-202ENST00000406423 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP31.04■■■□□ 2.56
ANKRD54-202ENST00000406423 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP31.01■■■□□ 2.55
ANKRD54-202ENST00000406423 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP30.99■■■□□ 2.55
ANKRD54-202ENST00000406423 CUX1P39880 1505 aa30.98■■■□□ 2.55
ANKRD54-202ENST00000406423 SYNJ2O15056 1496 aa30.96■■■□□ 2.55
ANKRD54-202ENST00000406423 GRIN2BQ13224 1484 aa30.96■■■□□ 2.55
ANKRD54-202ENST00000406423 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.91■■■□□ 2.54
ANKRD54-202ENST00000406423 PBRM1Q86U86 1689 aa30.83■■■□□ 2.53
ANKRD54-202ENST00000406423 ERCC6L2Q5T890 1561 aa30.79■■■□□ 2.52
ANKRD54-202ENST00000406423 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa30.73■■■□□ 2.51
ANKRD54-202ENST00000406423 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.68■■■□□ 2.5
ANKRD54-202ENST00000406423 GRIN2AQ12879 1464 aa30.6■■■□□ 2.49
ANKRD54-202ENST00000406423 CEP170Q5SW79 1584 aa30.58■■■□□ 2.49
ANKRD54-202ENST00000406423 NUP160Q12769 1436 aa30.57■■■□□ 2.48
ANKRD54-202ENST00000406423 SHROOM2Q13796 1616 aa30.52■■■□□ 2.48
ANKRD54-202ENST00000406423 ADAMTS12P58397 1594 aa30.52■■■□□ 2.48
ANKRD54-202ENST00000406423 KIF13AQ9H1H9 1805 aa30.51■■■□□ 2.47
ANKRD54-202ENST00000406423 FHAD1B1AJZ9 1412 aa30.35■■■□□ 2.45
ANKRD54-202ENST00000406423 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.34■■■□□ 2.45
ANKRD54-202ENST00000406423 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP30.27■■■□□ 2.44
ANKRD54-202ENST00000406423 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.26■■■□□ 2.44
ANKRD54-202ENST00000406423 TOP2BQ02880 1626 aa30.25■■■□□ 2.43
ANKRD54-202ENST00000406423 ERICH3Q5RHP9 1530 aa30.24■■■□□ 2.43
ANKRD54-202ENST00000406423 ABCC10Q5T3U5 1492 aa30.22■■■□□ 2.43
ANKRD54-202ENST00000406423 JPH4Q96JJ6 628 aa30.18■■■□□ 2.42
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