RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400864.3

AC245128.1-201, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene AC245128.1, Length 1,294 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC245128.1-201ENST00000400864 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.14■■■□□ 2.58
AC245128.1-201ENST00000400864 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.96■■■□□ 2.07
AC245128.1-201ENST00000400864 ABCC9O60706 1549 aa27.94■■■□□ 2.06
AC245128.1-201ENST00000400864 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.6■■□□□ 1.85
AC245128.1-201ENST00000400864 NACADO15069 1562 aa26.43■■□□□ 1.82
AC245128.1-201ENST00000400864 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.28■■□□□ 1.8
AC245128.1-201ENST00000400864 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.16■■□□□ 1.78
AC245128.1-201ENST00000400864 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.11■■□□□ 1.77
AC245128.1-201ENST00000400864 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.02■■□□□ 1.76
AC245128.1-201ENST00000400864 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.99■■□□□ 1.75
AC245128.1-201ENST00000400864 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.88■■□□□ 1.73
AC245128.1-201ENST00000400864 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
AC245128.1-201ENST00000400864 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.76■■□□□ 1.71
AC245128.1-201ENST00000400864 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.53■■□□□ 1.68
AC245128.1-201ENST00000400864 SCRIBQ14160 1630 aa25.43■■□□□ 1.66
AC245128.1-201ENST00000400864 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.26■■□□□ 1.63
AC245128.1-201ENST00000400864 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
AC245128.1-201ENST00000400864 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.19■■□□□ 1.62
AC245128.1-201ENST00000400864 NCAPD3P42695 1498 aa24.42■■□□□ 1.5
AC245128.1-201ENST00000400864 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.33■■□□□ 1.49
AC245128.1-201ENST00000400864 SMARCA4P51532 1647 aa24.29■■□□□ 1.48
AC245128.1-201ENST00000400864 SMARCA2P51531 1590 aa24.25■■□□□ 1.47
AC245128.1-201ENST00000400864 HMGXB3Q12766 1538 aa24.24■■□□□ 1.47
AC245128.1-201ENST00000400864 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
AC245128.1-201ENST00000400864 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.13■■□□□ 1.45
AC245128.1-201ENST00000400864 CUX2O14529 1486 aa24.13■■□□□ 1.45
AC245128.1-201ENST00000400864 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.1■■□□□ 1.45
AC245128.1-201ENST00000400864 ERCC6Q03468 1493 aa24.09■■□□□ 1.45
AC245128.1-201ENST00000400864 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
AC245128.1-201ENST00000400864 NESP48681 1621 aa24.01■■□□□ 1.43
AC245128.1-201ENST00000400864 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.99■■□□□ 1.43
AC245128.1-201ENST00000400864 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.85■■□□□ 1.41
AC245128.1-201ENST00000400864 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.81■■□□□ 1.4
AC245128.1-201ENST00000400864 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.7■■□□□ 1.38
AC245128.1-201ENST00000400864 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.69■■□□□ 1.38
AC245128.1-201ENST00000400864 WIZO95785 1651 aa23.68■■□□□ 1.38
AC245128.1-201ENST00000400864 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.65■■□□□ 1.38
AC245128.1-201ENST00000400864 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.5■■□□□ 1.35
AC245128.1-201ENST00000400864 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
AC245128.1-201ENST00000400864 WDR62O43379 1518 aa23.47■■□□□ 1.35
AC245128.1-201ENST00000400864 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
AC245128.1-201ENST00000400864 CFTRP13569 1480 aa23.4■■□□□ 1.34
AC245128.1-201ENST00000400864 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.39■■□□□ 1.34
AC245128.1-201ENST00000400864 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.37■■□□□ 1.33
AC245128.1-201ENST00000400864 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
AC245128.1-201ENST00000400864 PRDM2Q13029 1718 aa23.13■■□□□ 1.29
AC245128.1-201ENST00000400864 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.13■■□□□ 1.29
AC245128.1-201ENST00000400864 TRIM41Q8WV44 630 aa22.98■■□□□ 1.27
AC245128.1-201ENST00000400864 OSCARQ8IYS5 282 aa22.97■■□□□ 1.27
AC245128.1-201ENST00000400864 TOPBP1Q92547 1522 aa22.94■■□□□ 1.26
AC245128.1-201ENST00000400864 IFT140Q96RY7 1462 aa22.94■■□□□ 1.26
AC245128.1-201ENST00000400864 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
AC245128.1-201ENST00000400864 ABCC8Q09428 1581 aa22.88■■□□□ 1.25
AC245128.1-201ENST00000400864 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.85■■□□□ 1.25
AC245128.1-201ENST00000400864 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
AC245128.1-201ENST00000400864 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
AC245128.1-201ENST00000400864 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
AC245128.1-201ENST00000400864 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.71■■□□□ 1.23
AC245128.1-201ENST00000400864 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.71■■□□□ 1.23
AC245128.1-201ENST00000400864 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.71■■□□□ 1.23
AC245128.1-201ENST00000400864 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.69■■□□□ 1.22
AC245128.1-201ENST00000400864 ARHGEF11O15085 1522 aa22.64■■□□□ 1.21
AC245128.1-201ENST00000400864 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.61■■□□□ 1.21
AC245128.1-201ENST00000400864 CHD1O14646 1710 aa22.6■■□□□ 1.21
AC245128.1-201ENST00000400864 SOGA1O94964 1423 aa22.57■■□□□ 1.2
AC245128.1-201ENST00000400864 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.54■■□□□ 1.2
AC245128.1-201ENST00000400864 CUX1P39880 1505 aa22.54■■□□□ 1.2
AC245128.1-201ENST00000400864 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
AC245128.1-201ENST00000400864 WDR97A6NE52 1622 aa22.53■■□□□ 1.2
AC245128.1-201ENST00000400864 FBLN2P98095 1184 aa22.47■■□□□ 1.19
AC245128.1-201ENST00000400864 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.45■■□□□ 1.18
AC245128.1-201ENST00000400864 ARAP1Q96P48 1450 aa22.42■■□□□ 1.18
AC245128.1-201ENST00000400864 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.42■■□□□ 1.18
AC245128.1-201ENST00000400864 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
AC245128.1-201ENST00000400864 GRIN2BQ13224 1484 aa22.4■■□□□ 1.18
AC245128.1-201ENST00000400864 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.39■■□□□ 1.17
AC245128.1-201ENST00000400864 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
AC245128.1-201ENST00000400864 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
AC245128.1-201ENST00000400864 SYNJ2O15056 1496 aa22.33■■□□□ 1.16
AC245128.1-201ENST00000400864 SYNJ1O43426 1573 aa22.32■■□□□ 1.16
AC245128.1-201ENST00000400864 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.31■■□□□ 1.16
AC245128.1-201ENST00000400864 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.31■■□□□ 1.16
AC245128.1-201ENST00000400864 PBRM1Q86U86 1689 aa22.3■■□□□ 1.16
AC245128.1-201ENST00000400864 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.28■■□□□ 1.16
AC245128.1-201ENST00000400864 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.18■■□□□ 1.14
AC245128.1-201ENST00000400864 TOP2BQ02880 1626 aa22.17■■□□□ 1.14
AC245128.1-201ENST00000400864 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.17■■□□□ 1.14
AC245128.1-201ENST00000400864 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
AC245128.1-201ENST00000400864 GRIN2AQ12879 1464 aa22.11■■□□□ 1.13
AC245128.1-201ENST00000400864 ADAMTS12P58397 1594 aa22.11■■□□□ 1.13
AC245128.1-201ENST00000400864 NUP160Q12769 1436 aa22.06■■□□□ 1.12
AC245128.1-201ENST00000400864 CEP170Q5SW79 1584 aa22.04■■□□□ 1.12
AC245128.1-201ENST00000400864 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.03■■□□□ 1.12
AC245128.1-201ENST00000400864 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.02■■□□□ 1.12
AC245128.1-201ENST00000400864 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.02■■□□□ 1.12
AC245128.1-201ENST00000400864 SHROOM2Q13796 1616 aa21.98■■□□□ 1.11
AC245128.1-201ENST00000400864 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
AC245128.1-201ENST00000400864 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.8■■□□□ 1.08
AC245128.1-201ENST00000400864 JPH4Q96JJ6 628 aa21.79■■□□□ 1.08
AC245128.1-201ENST00000400864 IGF1RP08069 1367 aa21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.1 ms