RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400376.2

TTYH3-202, Transcript of tweety family member 3, humanhuman

TSL 4

Gene TTYH3, Length 560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTYH3-202ENST00000400376 NISCHQ9Y2I1 1504 aa43.09■■■■■ 4.49
TTYH3-202ENST00000400376 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa38.12■■■■□ 3.69
TTYH3-202ENST00000400376 ABCC9O60706 1549 aa37.61■■■■□ 3.61
TTYH3-202ENST00000400376 DCAF8L2P0C7V8 631 aa36.24■■■■□ 3.39
TTYH3-202ENST00000400376 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa36.02■■■■□ 3.36
TTYH3-202ENST00000400376 NACADO15069 1562 aa36■■■■□ 3.35
TTYH3-202ENST00000400376 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP35.84■■■■□ 3.33
TTYH3-202ENST00000400376 MYO15BQ96JP2 1530 aa35.78■■■■□ 3.32
TTYH3-202ENST00000400376 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa35.6■■■■□ 3.29
TTYH3-202ENST00000400376 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP35.28■■■■□ 3.24
TTYH3-202ENST00000400376 UNC13AQ9UPW8 1703 aa35.03■■■■□ 3.2
TTYH3-202ENST00000400376 BICRAQ9NZM4 1560 aa34.97■■■■□ 3.19
TTYH3-202ENST00000400376 SCRIBQ14160 1630 aa34.89■■■■□ 3.18
TTYH3-202ENST00000400376 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.76■■■■□ 3.16
TTYH3-202ENST00000400376 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.55■■■■□ 3.12
TTYH3-202ENST00000400376 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP34.05■■■■□ 3.04
TTYH3-202ENST00000400376 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.92■■■■□ 3.02
TTYH3-202ENST00000400376 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.79■■■■□ 3
TTYH3-202ENST00000400376 SMARCA4P51532 1647 aa33.35■■■□□ 2.93
TTYH3-202ENST00000400376 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP33.34■■■□□ 2.93
TTYH3-202ENST00000400376 NCAPD3P42695 1498 aa33.32■■■□□ 2.92
TTYH3-202ENST00000400376 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa33.31■■■□□ 2.92
TTYH3-202ENST00000400376 MROH2BQ7Z745 1585 aa33.22■■■□□ 2.91
TTYH3-202ENST00000400376 SMARCA2P51531 1590 aa33.17■■■□□ 2.9
TTYH3-202ENST00000400376 PEG3Q9GZU2 1588 aa33.04■■■□□ 2.88
TTYH3-202ENST00000400376 HMGXB3Q12766 1538 aa33.02■■■□□ 2.88
TTYH3-202ENST00000400376 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP32.99■■■□□ 2.87
TTYH3-202ENST00000400376 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.89■■■□□ 2.86
TTYH3-202ENST00000400376 WIZO95785 1651 aa32.78■■■□□ 2.84
TTYH3-202ENST00000400376 NESP48681 1621 aa32.52■■■□□ 2.8
TTYH3-202ENST00000400376 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP32.44■■■□□ 2.78
TTYH3-202ENST00000400376 CADPSQ9ULU8 1353 aa32.39■■■□□ 2.78
TTYH3-202ENST00000400376 ERCC6Q03468 1493 aa32.38■■■□□ 2.77
TTYH3-202ENST00000400376 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa32.32■■■□□ 2.76
TTYH3-202ENST00000400376 PDS5BQ9NTI5 1447 aa32.23■■■□□ 2.75
TTYH3-202ENST00000400376 CCDC88BA6NC98 1476 aa32.17■■■□□ 2.74
TTYH3-202ENST00000400376 CFTRP13569 1480 aa32.13■■■□□ 2.73
TTYH3-202ENST00000400376 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.11■■■□□ 2.73
TTYH3-202ENST00000400376 CUX2O14529 1486 aa32.03■■■□□ 2.72
TTYH3-202ENST00000400376 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.94■■■□□ 2.7
TTYH3-202ENST00000400376 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.93■■■□□ 2.7
TTYH3-202ENST00000400376 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.89■■■□□ 2.7
TTYH3-202ENST00000400376 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.86■■■□□ 2.69
TTYH3-202ENST00000400376 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.84■■■□□ 2.69
TTYH3-202ENST00000400376 WDR62O43379 1518 aa31.7■■■□□ 2.66
TTYH3-202ENST00000400376 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP31.63■■■□□ 2.65
TTYH3-202ENST00000400376 PRDM2Q13029 1718 aa31.53■■■□□ 2.64
TTYH3-202ENST00000400376 TOPBP1Q92547 1522 aa31.41■■■□□ 2.62
TTYH3-202ENST00000400376 ABCC8Q09428 1581 aa31.39■■■□□ 2.62
TTYH3-202ENST00000400376 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa31.32■■■□□ 2.6
TTYH3-202ENST00000400376 DNMBPQ6XZF7 1577 aa31.3■■■□□ 2.6
TTYH3-202ENST00000400376 IFT140Q96RY7 1462 aa31.24■■■□□ 2.59
TTYH3-202ENST00000400376 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP31.14■■■□□ 2.58
TTYH3-202ENST00000400376 CUX1P39880 1505 aa31.14■■■□□ 2.58
TTYH3-202ENST00000400376 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP31.14■■■□□ 2.57
TTYH3-202ENST00000400376 SOGA1O94964 1423 aa31.1■■■□□ 2.57
TTYH3-202ENST00000400376 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa31.08■■■□□ 2.57
TTYH3-202ENST00000400376 FGD5Q6ZNL6 1462 aa31.06■■■□□ 2.56
TTYH3-202ENST00000400376 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP31.01■■■□□ 2.55
TTYH3-202ENST00000400376 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP31■■■□□ 2.552e-7■■■□□ 18.8
TTYH3-202ENST00000400376 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.97■■■□□ 2.55
TTYH3-202ENST00000400376 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.97■■■□□ 2.55
TTYH3-202ENST00000400376 OSCARQ8IYS5 282 aa30.88■■■□□ 2.53
TTYH3-202ENST00000400376 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.85■■■□□ 2.53
TTYH3-202ENST00000400376 TOP2BQ02880 1626 aa30.8■■■□□ 2.52
TTYH3-202ENST00000400376 SYNJ1O43426 1573 aa30.8■■■□□ 2.52
TTYH3-202ENST00000400376 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.75■■■□□ 2.51
TTYH3-202ENST00000400376 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.73■■■□□ 2.51
TTYH3-202ENST00000400376 FBLN2P98095 1184 aa30.7■■■□□ 2.51
TTYH3-202ENST00000400376 WDR97A6NE52 1622 aa30.69■■■□□ 2.5
TTYH3-202ENST00000400376 GRIN2BQ13224 1484 aa30.68■■■□□ 2.5
TTYH3-202ENST00000400376 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.68■■■□□ 2.5
TTYH3-202ENST00000400376 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.63■■■□□ 2.49
TTYH3-202ENST00000400376 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP30.6■■■□□ 2.49
TTYH3-202ENST00000400376 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP30.56■■■□□ 2.48
TTYH3-202ENST00000400376 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa30.53■■■□□ 2.48
TTYH3-202ENST00000400376 SYNJ2O15056 1496 aa30.47■■■□□ 2.47
TTYH3-202ENST00000400376 CHD1O14646 1710 aa30.41■■■□□ 2.46
TTYH3-202ENST00000400376 PBRM1Q86U86 1689 aa30.39■■■□□ 2.45
TTYH3-202ENST00000400376 ERICH3Q5RHP9 1530 aa30.34■■■□□ 2.45
TTYH3-202ENST00000400376 FHAD1B1AJZ9 1412 aa30.34■■■□□ 2.45
TTYH3-202ENST00000400376 KIF27Q86VH2 1401 aa30.33■■■□□ 2.45
TTYH3-202ENST00000400376 IGF1RP08069 1367 aa30.32■■■□□ 2.44
TTYH3-202ENST00000400376 TRIM41Q8WV44 630 aa30.32■■■□□ 2.44
TTYH3-202ENST00000400376 GRIN2AQ12879 1464 aa30.25■■■□□ 2.43
TTYH3-202ENST00000400376 ADAMTS12P58397 1594 aa30.25■■■□□ 2.43
TTYH3-202ENST00000400376 ARHGEF11O15085 1522 aa30.21■■■□□ 2.43
TTYH3-202ENST00000400376 CLASP1Q7Z460 1538 aa30.2■■■□□ 2.42
TTYH3-202ENST00000400376 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa30.16■■■□□ 2.42
TTYH3-202ENST00000400376 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa30.16■■■□□ 2.42
TTYH3-202ENST00000400376 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.16■■■□□ 2.42
TTYH3-202ENST00000400376 NUP160Q12769 1436 aa30.15■■■□□ 2.42
TTYH3-202ENST00000400376 CYB5RLQ6IPT4 315 aa30.12■■■□□ 2.41
TTYH3-202ENST00000400376 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa30.1■■■□□ 2.41
TTYH3-202ENST00000400376 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa30.09■■■□□ 2.41
TTYH3-202ENST00000400376 CEP170Q5SW79 1584 aa30.07■■■□□ 2.4
TTYH3-202ENST00000400376 ARAP1Q96P48 1450 aa29.99■■■□□ 2.39
TTYH3-202ENST00000400376 JPH4Q96JJ6 628 aa29.98■■■□□ 2.39
TTYH3-202ENST00000400376 CUL7Q14999 1698 aa29.95■■■□□ 2.39
TTYH3-202ENST00000400376 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.95■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.7 ms