RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392178.8

TBCB-202, Transcript of tubulin folding cofactor B, humanhuman

TSL 2

Gene TBCB, Length 791 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCB-202ENST00000392178 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.27■■■■■ 6.92
TBCB-202ENST00000392178 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.24■■■■■ 5.95
TBCB-202ENST00000392178 ABCC9O60706 1549 aa51.85■■■■■ 5.89
TBCB-202ENST00000392178 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.57■■■■■ 5.53
TBCB-202ENST00000392178 NACADO15069 1562 aa49.31■■■■■ 5.48
TBCB-202ENST00000392178 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.02■■■■■ 5.44
TBCB-202ENST00000392178 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.75■■■■■ 5.39
TBCB-202ENST00000392178 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.48■■■■■ 5.35
TBCB-202ENST00000392178 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.4■■■■■ 5.34
TBCB-202ENST00000392178 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.32■■■■■ 5.33
TBCB-202ENST00000392178 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.3■■■■■ 5.32
TBCB-202ENST00000392178 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.2■■■■■ 5.31
TBCB-202ENST00000392178 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.07■■■■■ 5.29
TBCB-202ENST00000392178 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.53■■■■■ 5.2
TBCB-202ENST00000392178 SCRIBQ14160 1630 aa47.5■■■■■ 5.19
TBCB-202ENST00000392178 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.91■■■■■ 5.1
TBCB-202ENST00000392178 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.87■■■■■ 5.09
TBCB-202ENST00000392178 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.71■■■■■ 5.07
TBCB-202ENST00000392178 NCAPD3P42695 1498 aa45.49■■■■■ 4.87
TBCB-202ENST00000392178 SMARCA4P51532 1647 aa45.4■■■■■ 4.86
TBCB-202ENST00000392178 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.36■■■■■ 4.85
TBCB-202ENST00000392178 SMARCA2P51531 1590 aa45.29■■■■■ 4.84
TBCB-202ENST00000392178 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.23■■■■■ 4.83
TBCB-202ENST00000392178 HMGXB3Q12766 1538 aa45.18■■■■■ 4.82
TBCB-202ENST00000392178 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.99■■■■■ 4.79
TBCB-202ENST00000392178 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.93■■■■■ 4.78
TBCB-202ENST00000392178 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.86■■■■■ 4.77
TBCB-202ENST00000392178 ERCC6Q03468 1493 aa44.78■■■■■ 4.76
TBCB-202ENST00000392178 CUX2O14529 1486 aa44.66■■■■■ 4.74
TBCB-202ENST00000392178 NESP48681 1621 aa44.61■■■■■ 4.73
TBCB-202ENST00000392178 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.45■■■■■ 4.71
TBCB-202ENST00000392178 WIZO95785 1651 aa44.35■■■■■ 4.69
TBCB-202ENST00000392178 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.34■■■■■ 4.69
TBCB-202ENST00000392178 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.17■■■■■ 4.66
TBCB-202ENST00000392178 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.15■■■■■ 4.66
TBCB-202ENST00000392178 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.12■■■■■ 4.65
TBCB-202ENST00000392178 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.11■■■■■ 4.65
TBCB-202ENST00000392178 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.03■■■■■ 4.64
TBCB-202ENST00000392178 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.83■■■■■ 4.61
TBCB-202ENST00000392178 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.74■■■■■ 4.59
TBCB-202ENST00000392178 CFTRP13569 1480 aa43.66■■■■■ 4.58
TBCB-202ENST00000392178 WDR62O43379 1518 aa43.63■■■■■ 4.57
TBCB-202ENST00000392178 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.62■■■■■ 4.57
TBCB-202ENST00000392178 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.58■■■■■ 4.57
TBCB-202ENST00000392178 PRDM2Q13029 1718 aa43.35■■■■■ 4.53
TBCB-202ENST00000392178 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.32■■■■■ 4.52
TBCB-202ENST00000392178 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.19■■■■■ 4.5
TBCB-202ENST00000392178 ABCC8Q09428 1581 aa42.81■■■■■ 4.44
TBCB-202ENST00000392178 TOPBP1Q92547 1522 aa42.8■■■■■ 4.44
TBCB-202ENST00000392178 IFT140Q96RY7 1462 aa42.75■■■■■ 4.43
TBCB-202ENST00000392178 OSCARQ8IYS5 282 aa42.68■■■■■ 4.42
TBCB-202ENST00000392178 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.68■■■■■ 4.42
TBCB-202ENST00000392178 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.6■■■■■ 4.41
TBCB-202ENST00000392178 TRIM41Q8WV44 630 aa42.42■■■■■ 4.38
TBCB-202ENST00000392178 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.41■■■■■ 4.38
TBCB-202ENST00000392178 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.4■■■■■ 4.38
TBCB-202ENST00000392178 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.36■■■■■ 4.37
TBCB-202ENST00000392178 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.26■■■■■ 4.363e-6■■□□□ 14.3
TBCB-202ENST00000392178 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.25■■■■■ 4.35
TBCB-202ENST00000392178 SOGA1O94964 1423 aa42.2■■■■■ 4.35
TBCB-202ENST00000392178 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.17■■■■■ 4.34
TBCB-202ENST00000392178 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.13■■■■■ 4.34
TBCB-202ENST00000392178 CUX1P39880 1505 aa42.13■■■■■ 4.33
TBCB-202ENST00000392178 CHD1O14646 1710 aa42.09■■■■■ 4.33
TBCB-202ENST00000392178 WDR97A6NE52 1622 aa42.07■■■■■ 4.33
TBCB-202ENST00000392178 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.06■■■■■ 4.32
TBCB-202ENST00000392178 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.06■■■■■ 4.32
TBCB-202ENST00000392178 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.06■■■■■ 4.32
TBCB-202ENST00000392178 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.04■■■■■ 4.32
TBCB-202ENST00000392178 ARHGEF11O15085 1522 aa41.94■■■■■ 4.3
TBCB-202ENST00000392178 FBLN2P98095 1184 aa41.93■■■■■ 4.3
TBCB-202ENST00000392178 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.84■■■■■ 4.29
TBCB-202ENST00000392178 GRIN2BQ13224 1484 aa41.81■■■■■ 4.28
TBCB-202ENST00000392178 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.8■■■■■ 4.28
TBCB-202ENST00000392178 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.72■■■■■ 4.27
TBCB-202ENST00000392178 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.71■■■■■ 4.27
TBCB-202ENST00000392178 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.69■■■■■ 4.26
TBCB-202ENST00000392178 PBRM1Q86U86 1689 aa41.68■■■■■ 4.26
TBCB-202ENST00000392178 SYNJ2O15056 1496 aa41.64■■■■■ 4.26
TBCB-202ENST00000392178 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.62■■■■■ 4.25
TBCB-202ENST00000392178 SYNJ1O43426 1573 aa41.62■■■■■ 4.25
TBCB-202ENST00000392178 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.61■■■■■ 4.25
TBCB-202ENST00000392178 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.59■■■■■ 4.25
TBCB-202ENST00000392178 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.59■■■■■ 4.25
TBCB-202ENST00000392178 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.58■■■■■ 4.25
TBCB-202ENST00000392178 TOP2BQ02880 1626 aa41.58■■■■■ 4.25
TBCB-202ENST00000392178 ARAP1Q96P48 1450 aa41.53■■■■■ 4.24
TBCB-202ENST00000392178 ADAMTS12P58397 1594 aa41.26■■■■■ 4.2
TBCB-202ENST00000392178 GRIN2AQ12879 1464 aa41.26■■■■■ 4.2
TBCB-202ENST00000392178 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.21■■■■■ 4.19
TBCB-202ENST00000392178 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.18■■■■■ 4.18
TBCB-202ENST00000392178 NUP160Q12769 1436 aa41.11■■■■■ 4.17
TBCB-202ENST00000392178 CEP170Q5SW79 1584 aa41.08■■■■■ 4.17
TBCB-202ENST00000392178 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.06■■■■■ 4.16
TBCB-202ENST00000392178 SHROOM2Q13796 1616 aa40.93■■■■■ 4.14
TBCB-202ENST00000392178 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.9■■■■■ 4.14
TBCB-202ENST00000392178 KIF27Q86VH2 1401 aa40.77■■■■■ 4.12
TBCB-202ENST00000392178 JPH4Q96JJ6 628 aa40.73■■■■■ 4.11
TBCB-202ENST00000392178 IGF1RP08069 1367 aa40.71■■■■■ 4.11
TBCB-202ENST00000392178 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.68■■■■■ 4.1
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