RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000381551.8

PDGFB-202, Transcript of platelet derived growth factor subunit B, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDGFB, Length 1,125 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFB-202ENST00000381551 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.8■■■■□ 3.48
PDGFB-202ENST00000381551 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa32.44■■■□□ 2.78
PDGFB-202ENST00000381551 ABCC9O60706 1549 aa31.44■■■□□ 2.62
PDGFB-202ENST00000381551 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.7■■■□□ 2.5
PDGFB-202ENST00000381551 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.67■■■□□ 2.5
PDGFB-202ENST00000381551 NACADO15069 1562 aa30.47■■■□□ 2.47
PDGFB-202ENST00000381551 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa30.44■■■□□ 2.46
PDGFB-202ENST00000381551 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.42■■■□□ 2.46
PDGFB-202ENST00000381551 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.39■■■□□ 2.46
PDGFB-202ENST00000381551 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.68■■■□□ 2.34
PDGFB-202ENST00000381551 SCRIBQ14160 1630 aa29.66■■■□□ 2.34
PDGFB-202ENST00000381551 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.53■■■□□ 2.32
PDGFB-202ENST00000381551 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.48■■■□□ 2.31
PDGFB-202ENST00000381551 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.33■■■□□ 2.29
PDGFB-202ENST00000381551 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
PDGFB-202ENST00000381551 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.65■■■□□ 2.18
PDGFB-202ENST00000381551 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.62■■■□□ 2.17
PDGFB-202ENST00000381551 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
PDGFB-202ENST00000381551 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.44■■■□□ 2.14
PDGFB-202ENST00000381551 SMARCA4P51532 1647 aa28.42■■■□□ 2.14
PDGFB-202ENST00000381551 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.37■■■□□ 2.13
PDGFB-202ENST00000381551 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
PDGFB-202ENST00000381551 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.21■■■□□ 2.11
PDGFB-202ENST00000381551 NCAPD3P42695 1498 aa28.16■■■□□ 2.1
PDGFB-202ENST00000381551 SMARCA2P51531 1590 aa28.16■■■□□ 2.1
PDGFB-202ENST00000381551 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.16■■■□□ 2.1
PDGFB-202ENST00000381551 WIZO95785 1651 aa28.06■■■□□ 2.08
PDGFB-202ENST00000381551 HMGXB3Q12766 1538 aa27.98■■■□□ 2.07
PDGFB-202ENST00000381551 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
PDGFB-202ENST00000381551 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
PDGFB-202ENST00000381551 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
PDGFB-202ENST00000381551 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.51■■□□□ 1.99
PDGFB-202ENST00000381551 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.37■■□□□ 1.97
PDGFB-202ENST00000381551 NESP48681 1621 aa27.34■■□□□ 1.97
PDGFB-202ENST00000381551 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.29■■□□□ 1.96
PDGFB-202ENST00000381551 CFTRP13569 1480 aa27.27■■□□□ 1.96
PDGFB-202ENST00000381551 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.14■■□□□ 1.93
PDGFB-202ENST00000381551 ERCC6Q03468 1493 aa27.04■■□□□ 1.92
PDGFB-202ENST00000381551 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.01■■□□□ 1.91
PDGFB-202ENST00000381551 PRDM2Q13029 1718 aa26.98■■□□□ 1.91
PDGFB-202ENST00000381551 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.96■■□□□ 1.91
PDGFB-202ENST00000381551 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.91■■□□□ 1.9
PDGFB-202ENST00000381551 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa26.86■■□□□ 1.89
PDGFB-202ENST00000381551 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.8■■□□□ 1.88
PDGFB-202ENST00000381551 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
PDGFB-202ENST00000381551 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
PDGFB-202ENST00000381551 WDR62O43379 1518 aa26.69■■□□□ 1.86
PDGFB-202ENST00000381551 ABCC8Q09428 1581 aa26.66■■□□□ 1.86
PDGFB-202ENST00000381551 TOPBP1Q92547 1522 aa26.62■■□□□ 1.85
PDGFB-202ENST00000381551 CUX2O14529 1486 aa26.61■■□□□ 1.85
PDGFB-202ENST00000381551 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.59■■□□□ 1.85
PDGFB-202ENST00000381551 CUX1P39880 1505 aa26.57■■□□□ 1.84
PDGFB-202ENST00000381551 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.56■■□□□ 1.84
PDGFB-202ENST00000381551 SYNJ1O43426 1573 aa26.45■■□□□ 1.82
PDGFB-202ENST00000381551 TOP2BQ02880 1626 aa26.43■■□□□ 1.82
PDGFB-202ENST00000381551 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
PDGFB-202ENST00000381551 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.42■■□□□ 1.82
PDGFB-202ENST00000381551 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.4■■□□□ 1.82
PDGFB-202ENST00000381551 SOGA1O94964 1423 aa26.37■■□□□ 1.81
PDGFB-202ENST00000381551 IFT140Q96RY7 1462 aa26.36■■□□□ 1.81
PDGFB-202ENST00000381551 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.34■■□□□ 1.81
PDGFB-202ENST00000381551 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
PDGFB-202ENST00000381551 TRIM41Q8WV44 630 aa26.29■■□□□ 1.8
PDGFB-202ENST00000381551 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.24■■□□□ 1.79
PDGFB-202ENST00000381551 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
PDGFB-202ENST00000381551 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.19■■□□□ 1.78
PDGFB-202ENST00000381551 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
PDGFB-202ENST00000381551 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.16■■□□□ 1.78
PDGFB-202ENST00000381551 WDR97A6NE52 1622 aa26.11■■□□□ 1.77
PDGFB-202ENST00000381551 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
PDGFB-202ENST00000381551 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.04■■□□□ 1.76
PDGFB-202ENST00000381551 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26■■□□□ 1.75
PDGFB-202ENST00000381551 KIF27Q86VH2 1401 aa25.98■■□□□ 1.75
PDGFB-202ENST00000381551 GRIN2BQ13224 1484 aa25.97■■□□□ 1.75
PDGFB-202ENST00000381551 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.91■■□□□ 1.74
PDGFB-202ENST00000381551 IGF1RP08069 1367 aa25.89■■□□□ 1.74
PDGFB-202ENST00000381551 PBRM1Q86U86 1689 aa25.87■■□□□ 1.73
PDGFB-202ENST00000381551 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.86■■□□□ 1.73
PDGFB-202ENST00000381551 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.86■■□□□ 1.73
PDGFB-202ENST00000381551 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
PDGFB-202ENST00000381551 FBLN2P98095 1184 aa25.78■■□□□ 1.72
PDGFB-202ENST00000381551 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
PDGFB-202ENST00000381551 SYNJ2O15056 1496 aa25.75■■□□□ 1.71
PDGFB-202ENST00000381551 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.75■■□□□ 1.71
PDGFB-202ENST00000381551 EEA1Q15075 1411 aa25.74■■□□□ 1.71
PDGFB-202ENST00000381551 CSRNP3Q8WYN3 585 aa25.74■■□□□ 1.71
PDGFB-202ENST00000381551 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
PDGFB-202ENST00000381551 ADAMTS12P58397 1594 aa25.72■■□□□ 1.71
PDGFB-202ENST00000381551 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.71■■□□□ 1.71
PDGFB-202ENST00000381551 OSCARQ8IYS5 282 aa25.69■■□□□ 1.7
PDGFB-202ENST00000381551 CUL7Q14999 1698 aa25.67■■□□□ 1.7
PDGFB-202ENST00000381551 CHD1O14646 1710 aa25.66■■□□□ 1.7
PDGFB-202ENST00000381551 GRIN2AQ12879 1464 aa25.63■■□□□ 1.69
PDGFB-202ENST00000381551 PRXQ9BXM0 1461 aa25.6■■□□□ 1.69
PDGFB-202ENST00000381551 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.58■■□□□ 1.69
PDGFB-202ENST00000381551 NUP160Q12769 1436 aa25.52■■□□□ 1.68
PDGFB-202ENST00000381551 CEP170Q5SW79 1584 aa25.47■■□□□ 1.67
PDGFB-202ENST00000381551 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.42■■□□□ 1.66
PDGFB-202ENST00000381551 KIF21BO75037 1637 aa25.41■■□□□ 1.66
PDGFB-202ENST00000381551 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.38■■□□□ 1.65
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