RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376350.7

PTPRH-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type H, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRH, Length 3,877 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRH-202ENST00000376350 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.04■■■□□ 2.24
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PTPRH-202ENST00000376350 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa24.56■■□□□ 1.52
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PTPRH-202ENST00000376350 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa23.33■■□□□ 1.33
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PTPRH-202ENST00000376350 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa23.32■■□□□ 1.32
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PTPRH-202ENST00000376350 CECR2Q9BXF3 1484 aa23■■□□□ 1.27
PTPRH-202ENST00000376350 TRIM41Q8WV44 630 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPRH-202ENST00000376350 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPRH-202ENST00000376350 MYO15BQ96JP2 1530 aa22.88■■□□□ 1.25
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PTPRH-202ENST00000376350 PCGF6Q9BYE7 350 aa22.59■■□□□ 1.21
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PTPRH-202ENST00000376350 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
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PTPRH-202ENST00000376350 UNC13AQ9UPW8 1703 aa22.27■■□□□ 1.16
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PTPRH-202ENST00000376350 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
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PTPRH-202ENST00000376350 ABCC8Q09428 1581 aa21.9■■□□□ 1.1
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PTPRH-202ENST00000376350 CSRNP3Q8WYN3 585 aa21.81■■□□□ 1.08
PTPRH-202ENST00000376350 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
PTPRH-202ENST00000376350 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.77■■□□□ 1.08
PTPRH-202ENST00000376350 APLP2Q06481 763 aa21.75■■□□□ 1.07
PTPRH-202ENST00000376350 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa21.71■■□□□ 1.07
PTPRH-202ENST00000376350 NCAPD3P42695 1498 aa21.68■■□□□ 1.06
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PTPRH-202ENST00000376350 P3H3Q8IVL6 736 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRH-202ENST00000376350 NESP48681 1621 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRH-202ENST00000376350 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.49■■□□□ 1.03
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PTPRH-202ENST00000376350 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
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PTPRH-202ENST00000376350 CFTRP13569 1480 aa21.29■■□□□ 1
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PTPRH-202ENST00000376350 SYNJ1O43426 1573 aa21.24■□□□□ 0.99
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PTPRH-202ENST00000376350 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP21.2■□□□□ 0.98
PTPRH-202ENST00000376350 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.19■□□□□ 0.98
PTPRH-202ENST00000376350 CEP162Q5TB80 1403 aa21.16■□□□□ 0.98
PTPRH-202ENST00000376350 EEA1Q15075 1411 aa21.15■□□□□ 0.98
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PTPRH-202ENST00000376350 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
PTPRH-202ENST00000376350 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.12■□□□□ 0.97
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PTPRH-202ENST00000376350 MYT1LQ9UL68 1186 aa20.63■□□□□ 0.89
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