RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372736.3

COL9A2-201, Transcript of collagen type IX alpha 2 chain, humanhuman

TSL 3

Gene COL9A2, Length 319 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2-201ENST00000372736 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.88■■■■■ 6.54
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COL9A2-201ENST00000372736 SMARCA2P51531 1590 aa43.2■■■■■ 4.51
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COL9A2-201ENST00000372736 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.07■■■■■ 4.49
COL9A2-201ENST00000372736 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.06■■■■■ 4.48
COL9A2-201ENST00000372736 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.89■■■■■ 4.46
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COL9A2-201ENST00000372736 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.44■■■■■ 4.38
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COL9A2-201ENST00000372736 ERCC6Q03468 1493 aa42.26■■■■■ 4.36
COL9A2-201ENST00000372736 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.22■■■■■ 4.35
COL9A2-201ENST00000372736 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.14■■■■■ 4.34
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COL9A2-201ENST00000372736 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.9■■■■■ 4.3
COL9A2-201ENST00000372736 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.87■■■■■ 4.29
COL9A2-201ENST00000372736 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.86■■■■■ 4.29
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COL9A2-201ENST00000372736 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.6■■■■■ 4.25
COL9A2-201ENST00000372736 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.53■■■■■ 4.24
COL9A2-201ENST00000372736 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.53■■■■■ 4.24
COL9A2-201ENST00000372736 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.51■■■■■ 4.24
COL9A2-201ENST00000372736 PRDM2Q13029 1718 aa41.45■■■■■ 4.23
COL9A2-201ENST00000372736 WDR62O43379 1518 aa41.44■■■■■ 4.23
COL9A2-201ENST00000372736 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.17■■■■■ 4.18
COL9A2-201ENST00000372736 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41■■■■■ 4.15
COL9A2-201ENST00000372736 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.98■■■■■ 4.15
COL9A2-201ENST00000372736 TOPBP1Q92547 1522 aa40.85■■■■■ 4.13
COL9A2-201ENST00000372736 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.78■■■■■ 4.12
COL9A2-201ENST00000372736 ABCC8Q09428 1581 aa40.77■■■■■ 4.12
COL9A2-201ENST00000372736 IFT140Q96RY7 1462 aa40.64■■■■■ 4.1
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COL9A2-201ENST00000372736 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.33■■■■■ 4.05
COL9A2-201ENST00000372736 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.29■■■■■ 4.04
COL9A2-201ENST00000372736 SOGA1O94964 1423 aa40.24■■■■■ 4.03
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COL9A2-201ENST00000372736 WDR97A6NE52 1622 aa40.11■■■■■ 4.01
COL9A2-201ENST00000372736 OSCARQ8IYS5 282 aa40.07■■■■■ 4.01
COL9A2-201ENST00000372736 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.06■■■■■ 4
COL9A2-201ENST00000372736 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.03■■■■■ 4
COL9A2-201ENST00000372736 TOP2BQ02880 1626 aa40.01■■■■■ 4
COL9A2-201ENST00000372736 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40■■■■□ 3.99
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COL9A2-201ENST00000372736 CHD1O14646 1710 aa39.94■■■■□ 3.98
COL9A2-201ENST00000372736 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.92■■■■□ 3.98
COL9A2-201ENST00000372736 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.86■■■■□ 3.97
COL9A2-201ENST00000372736 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.85■■■■□ 3.97
COL9A2-201ENST00000372736 GRIN2BQ13224 1484 aa39.84■■■■□ 3.97
COL9A2-201ENST00000372736 PBRM1Q86U86 1689 aa39.83■■■■□ 3.97
COL9A2-201ENST00000372736 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.81■■■■□ 3.96
COL9A2-201ENST00000372736 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.79■■■■□ 3.96
COL9A2-201ENST00000372736 FBLN2P98095 1184 aa39.69■■■■□ 3.94
COL9A2-201ENST00000372736 SYNJ2O15056 1496 aa39.63■■■■□ 3.94
COL9A2-201ENST00000372736 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.6■■■■□ 3.93
COL9A2-201ENST00000372736 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.6■■■■□ 3.93
COL9A2-201ENST00000372736 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.6■■■■□ 3.93
COL9A2-201ENST00000372736 ARHGEF11O15085 1522 aa39.55■■■■□ 3.92
COL9A2-201ENST00000372736 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.54■■■■□ 3.92
COL9A2-201ENST00000372736 ADAMTS12P58397 1594 aa39.5■■■■□ 3.91
COL9A2-201ENST00000372736 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.5■■■■□ 3.91
COL9A2-201ENST00000372736 TRIM41Q8WV44 630 aa39.47■■■■□ 3.91
COL9A2-201ENST00000372736 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.45■■■■□ 3.91
COL9A2-201ENST00000372736 GRIN2AQ12879 1464 aa39.36■■■■□ 3.89
COL9A2-201ENST00000372736 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.32■■■■□ 3.89
COL9A2-201ENST00000372736 ARAP1Q96P48 1450 aa39.22■■■■□ 3.87
COL9A2-201ENST00000372736 NUP160Q12769 1436 aa39.21■■■■□ 3.87
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COL9A2-201ENST00000372736 KIF27Q86VH2 1401 aa39.18■■■■□ 3.86
COL9A2-201ENST00000372736 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.07■■■■□ 3.85
COL9A2-201ENST00000372736 IGF1RP08069 1367 aa39.06■■■■□ 3.84
COL9A2-201ENST00000372736 CUL7Q14999 1698 aa39.04■■■■□ 3.84
COL9A2-201ENST00000372736 SHROOM2Q13796 1616 aa38.99■■■■□ 3.83
COL9A2-201ENST00000372736 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.92■■■■□ 3.82
COL9A2-201ENST00000372736 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.92■■■■□ 3.82
COL9A2-201ENST00000372736 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.81■■■■□ 3.8
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