RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370472.4

CUTC-201, Transcript of cutC copper transporter, humanhuman

TSL 5

Gene CUTC, Length 727 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUTC-201ENST00000370472 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.51■■■■■ 6.96
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CUTC-201ENST00000370472 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.61■■■■■ 5.53
CUTC-201ENST00000370472 NACADO15069 1562 aa49.4■■■■■ 5.5
CUTC-201ENST00000370472 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.1■■■■■ 5.45
CUTC-201ENST00000370472 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.92■■■■■ 5.42
CUTC-201ENST00000370472 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.57■■■■■ 5.37
CUTC-201ENST00000370472 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.45■■■■■ 5.35
CUTC-201ENST00000370472 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.42■■■■■ 5.34
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CUTC-201ENST00000370472 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.35■■■■■ 5.33
CUTC-201ENST00000370472 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.16■■■■■ 5.3
CUTC-201ENST00000370472 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.62■■■■■ 5.21
CUTC-201ENST00000370472 SCRIBQ14160 1630 aa47.62■■■■■ 5.21
CUTC-201ENST00000370472 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.93■■■■■ 5.1
CUTC-201ENST00000370472 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.91■■■■■ 5.1
CUTC-201ENST00000370472 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.72■■■■■ 5.07
CUTC-201ENST00000370472 NCAPD3P42695 1498 aa45.62■■■■■ 4.89
CUTC-201ENST00000370472 SMARCA4P51532 1647 aa45.52■■■■■ 4.88
CUTC-201ENST00000370472 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.5■■■■■ 4.87
CUTC-201ENST00000370472 SMARCA2P51531 1590 aa45.4■■■■■ 4.86
CUTC-201ENST00000370472 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.38■■■■■ 4.86
CUTC-201ENST00000370472 HMGXB3Q12766 1538 aa45.3■■■■■ 4.84
CUTC-201ENST00000370472 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.16■■■■■ 4.82
CUTC-201ENST00000370472 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.05■■■■■ 4.8
CUTC-201ENST00000370472 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.04■■■■■ 4.8
CUTC-201ENST00000370472 ERCC6Q03468 1493 aa44.76■■■■■ 4.76
CUTC-201ENST00000370472 NESP48681 1621 aa44.68■■■■■ 4.74
CUTC-201ENST00000370472 CUX2O14529 1486 aa44.62■■■■■ 4.73
CUTC-201ENST00000370472 WIZO95785 1651 aa44.51■■■■■ 4.72
CUTC-201ENST00000370472 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.49■■■■■ 4.71
CUTC-201ENST00000370472 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.3■■■■■ 4.68
CUTC-201ENST00000370472 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.23■■■■■ 4.67
CUTC-201ENST00000370472 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.23■■■■■ 4.67
CUTC-201ENST00000370472 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.18■■■■■ 4.66
CUTC-201ENST00000370472 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.16■■■■■ 4.66
CUTC-201ENST00000370472 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.11■■■■■ 4.65
CUTC-201ENST00000370472 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.01■■■■■ 4.64
CUTC-201ENST00000370472 CFTRP13569 1480 aa43.82■■■■■ 4.6
CUTC-201ENST00000370472 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.79■■■■■ 4.6
CUTC-201ENST00000370472 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.7■■■■■ 4.59
CUTC-201ENST00000370472 WDR62O43379 1518 aa43.69■■■■■ 4.59
CUTC-201ENST00000370472 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.69■■■■■ 4.58
CUTC-201ENST00000370472 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.51■■■■■ 4.56
CUTC-201ENST00000370472 PRDM2Q13029 1718 aa43.36■■■■■ 4.53
CUTC-201ENST00000370472 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.31■■■■■ 4.52
CUTC-201ENST00000370472 TOPBP1Q92547 1522 aa42.91■■■■■ 4.46
CUTC-201ENST00000370472 ABCC8Q09428 1581 aa42.9■■■■■ 4.46
CUTC-201ENST00000370472 IFT140Q96RY7 1462 aa42.83■■■■■ 4.45
CUTC-201ENST00000370472 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.78■■■■■ 4.44
CUTC-201ENST00000370472 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.68■■■■■ 4.42
CUTC-201ENST00000370472 OSCARQ8IYS5 282 aa42.64■■■■■ 4.42
CUTC-201ENST00000370472 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.53■■■■■ 4.4
CUTC-201ENST00000370472 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.51■■■■■ 4.4
CUTC-201ENST00000370472 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.5■■■■■ 4.39
CUTC-201ENST00000370472 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.46■■■■■ 4.39
CUTC-201ENST00000370472 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.36■■■■■ 4.378e-7■■■□□ 16.1
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CUTC-201ENST00000370472 CUX1P39880 1505 aa42.3■■■■■ 4.36
CUTC-201ENST00000370472 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.3■■■■■ 4.36
CUTC-201ENST00000370472 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.27■■■■■ 4.36
CUTC-201ENST00000370472 TRIM41Q8WV44 630 aa42.26■■■■■ 4.36
CUTC-201ENST00000370472 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.16■■■■■ 4.34
CUTC-201ENST00000370472 WDR97A6NE52 1622 aa42.16■■■■■ 4.34
CUTC-201ENST00000370472 CHD1O14646 1710 aa42.05■■■■■ 4.32
CUTC-201ENST00000370472 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.99■■■■■ 4.31
CUTC-201ENST00000370472 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.99■■■■■ 4.31
CUTC-201ENST00000370472 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.99■■■■■ 4.31
CUTC-201ENST00000370472 FBLN2P98095 1184 aa41.95■■■■■ 4.31
CUTC-201ENST00000370472 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.92■■■■■ 4.3
CUTC-201ENST00000370472 ARHGEF11O15085 1522 aa41.92■■■■■ 4.3
CUTC-201ENST00000370472 GRIN2BQ13224 1484 aa41.92■■■■■ 4.3
CUTC-201ENST00000370472 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.88■■■■■ 4.29
CUTC-201ENST00000370472 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.86■■■■■ 4.29
CUTC-201ENST00000370472 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.8■■■■■ 4.28
CUTC-201ENST00000370472 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.77■■■■■ 4.28
CUTC-201ENST00000370472 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.77■■■■■ 4.28
CUTC-201ENST00000370472 TOP2BQ02880 1626 aa41.76■■■■■ 4.28
CUTC-201ENST00000370472 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.75■■■■■ 4.27
CUTC-201ENST00000370472 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.73■■■■■ 4.27
CUTC-201ENST00000370472 SYNJ2O15056 1496 aa41.73■■■■■ 4.27
CUTC-201ENST00000370472 PBRM1Q86U86 1689 aa41.72■■■■■ 4.27
CUTC-201ENST00000370472 SYNJ1O43426 1573 aa41.67■■■■■ 4.26
CUTC-201ENST00000370472 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.64■■■■■ 4.26
CUTC-201ENST00000370472 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.57■■■■■ 4.25
CUTC-201ENST00000370472 ARAP1Q96P48 1450 aa41.53■■■■■ 4.24
CUTC-201ENST00000370472 ADAMTS12P58397 1594 aa41.37■■■■■ 4.21
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CUTC-201ENST00000370472 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.35■■■■■ 4.21
CUTC-201ENST00000370472 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.31■■■■■ 4.2
CUTC-201ENST00000370472 NUP160Q12769 1436 aa41.24■■■■■ 4.19
CUTC-201ENST00000370472 CEP170Q5SW79 1584 aa41.18■■■■■ 4.18
CUTC-201ENST00000370472 SHROOM2Q13796 1616 aa41■■■■■ 4.15
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CUTC-201ENST00000370472 IGF1RP08069 1367 aa40.92■■■■■ 4.14
CUTC-201ENST00000370472 JPH4Q96JJ6 628 aa40.81■■■■■ 4.12
CUTC-201ENST00000370472 CUL7Q14999 1698 aa40.79■■■■■ 4.12
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