RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365174.1

RNA5SP223-201, Transcript of RNA, 5S ribosomal pseudogene 223, humanhuman

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Gene RNA5SP223, Length 120 nt, Biotype rRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNA5SP223-201ENST00000365174 NISCHQ9Y2I1 1504 aa11.51□□□□□ -0.57
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RNA5SP223-201ENST00000365174 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
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RNA5SP223-201ENST00000365174 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa9.52□□□□□ -0.88
RNA5SP223-201ENST00000365174 ABCC9O60706 1549 aa9.51□□□□□ -0.89
RNA5SP223-201ENST00000365174 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa9.47□□□□□ -0.89
RNA5SP223-201ENST00000365174 MYO15BQ96JP2 1530 aa9.4□□□□□ -0.91
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RNA5SP223-201ENST00000365174 CHIC1Q5VXU3 224 aa9.36□□□□□ -0.91
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RNA5SP223-201ENST00000365174 SCRIBQ14160 1630 aa9.3□□□□□ -0.92
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RNA5SP223-201ENST00000365174 BICRAQ9NZM4 1560 aa8.91□□□□□ -0.98
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RNA5SP223-201ENST00000365174 CECR2Q9BXF3 1484 aa8.89□□□□□ -0.99
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RNA5SP223-201ENST00000365174 MROH2BQ7Z745 1585 aa8.87□□□□□ -0.99
RNA5SP223-201ENST00000365174 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
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RNA5SP223-201ENST00000365174 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
RNA5SP223-201ENST00000365174 SMARCA2P51531 1590 aa8.76□□□□□ -1.01
RNA5SP223-201ENST00000365174 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
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RNA5SP223-201ENST00000365174 PEG3Q9GZU2 1588 aa8.72□□□□□ -1.01
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RNA5SP223-201ENST00000365174 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa8.69□□□□□ -1.02
RNA5SP223-201ENST00000365174 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
RNA5SP223-201ENST00000365174 HMGXB3Q12766 1538 aa8.65□□□□□ -1.02
RNA5SP223-201ENST00000365174 CCDC88BA6NC98 1476 aa8.64□□□□□ -1.03
RNA5SP223-201ENST00000365174 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
RNA5SP223-201ENST00000365174 NCAPD3P42695 1498 aa8.6□□□□□ -1.03
RNA5SP223-201ENST00000365174 MYT1Q01538 1121 aa8.6□□□□□ -1.03
RNA5SP223-201ENST00000365174 TRIM41Q8WV44 630 aa8.6□□□□□ -1.03
RNA5SP223-201ENST00000365174 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa8.58□□□□□ -1.04
RNA5SP223-201ENST00000365174 PLPPR3Q6T4P5 718 aa8.56□□□□□ -1.04
RNA5SP223-201ENST00000365174 ABCC8Q09428 1581 aa8.49□□□□□ -1.05
RNA5SP223-201ENST00000365174 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
RNA5SP223-201ENST00000365174 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP8.47□□□□□ -1.05
RNA5SP223-201ENST00000365174 PRDM2Q13029 1718 aa8.46□□□□□ -1.06
RNA5SP223-201ENST00000365174 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
RNA5SP223-201ENST00000365174 ARXQ96QS3 562 aa8.44□□□□□ -1.06
RNA5SP223-201ENST00000365174 CFTRP13569 1480 aa8.43□□□□□ -1.06
RNA5SP223-201ENST00000365174 EEA1Q15075 1411 aa8.41□□□□□ -1.06
RNA5SP223-201ENST00000365174 CADPSQ9ULU8 1353 aa8.41□□□□□ -1.06
RNA5SP223-201ENST00000365174 SYNJ1O43426 1573 aa8.39□□□□□ -1.07
RNA5SP223-201ENST00000365174 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa8.38□□□□□ -1.07
RNA5SP223-201ENST00000365174 TOP2BQ02880 1626 aa8.37□□□□□ -1.07
RNA5SP223-201ENST00000365174 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa8.36□□□□□ -1.07
RNA5SP223-201ENST00000365174 APLP2Q06481 763 aa8.36□□□□□ -1.07
RNA5SP223-201ENST00000365174 ERICH6Q7L0X2 663 aa8.36□□□□□ -1.07
RNA5SP223-201ENST00000365174 FANCD2Q9BXW9 1451 aa8.35□□□□□ -1.07
RNA5SP223-201ENST00000365174 CEP164Q9UPV0 1460 aa8.34□□□□□ -1.07
RNA5SP223-201ENST00000365174 KCNA4P22459 653 aa8.34□□□□□ -1.07
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RNA5SP223-201ENST00000365174 CUX1P39880 1505 aa8.32□□□□□ -1.08
RNA5SP223-201ENST00000365174 SOGA1O94964 1423 aa8.3□□□□□ -1.08
RNA5SP223-201ENST00000365174 NESP48681 1621 aa8.3□□□□□ -1.08
RNA5SP223-201ENST00000365174 GOLGA3Q08378 1498 aa8.29□□□□□ -1.08
RNA5SP223-201ENST00000365174 DNMBPQ6XZF7 1577 aa8.29□□□□□ -1.08
RNA5SP223-201ENST00000365174 KIF27Q86VH2 1401 aa8.29□□□□□ -1.08
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RNA5SP223-201ENST00000365174 KIF21BO75037 1637 aa8.26□□□□□ -1.09
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RNA5SP223-201ENST00000365174 ERCC6Q03468 1493 aa8.25□□□□□ -1.09
RNA5SP223-201ENST00000365174 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa8.24□□□□□ -1.09
RNA5SP223-201ENST00000365174 CUX2O14529 1486 aa8.24□□□□□ -1.09
RNA5SP223-201ENST00000365174 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa8.24□□□□□ -1.09
RNA5SP223-201ENST00000365174 TOPBP1Q92547 1522 aa8.24□□□□□ -1.09
RNA5SP223-201ENST00000365174 MRC2Q9UBG0 1479 aa8.22□□□□□ -1.09
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RNA5SP223-201ENST00000365174 ERICH3Q5RHP9 1530 aa8.2□□□□□ -1.1
RNA5SP223-201ENST00000365174 TNIKQ9UKE5 1360 aa8.2□□□□□ -1.1
RNA5SP223-201ENST00000365174 CEP162Q5TB80 1403 aa8.2□□□□□ -1.1
RNA5SP223-201ENST00000365174 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
RNA5SP223-201ENST00000365174 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
RNA5SP223-201ENST00000365174 DNAJC5BQ9UF47 199 aa8.18□□□□□ -1.1
RNA5SP223-201ENST00000365174 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa8.17□□□□□ -1.1
RNA5SP223-201ENST00000365174 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
RNA5SP223-201ENST00000365174 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa8.16□□□□□ -1.1
RNA5SP223-201ENST00000365174 CUL7Q14999 1698 aa8.15□□□□□ -1.1
RNA5SP223-201ENST00000365174 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa8.15□□□□□ -1.1
RNA5SP223-201ENST00000365174 PRXQ9BXM0 1461 aa8.14□□□□□ -1.11
RNA5SP223-201ENST00000365174 CLIP1P30622 1438 aa8.14□□□□□ -1.11
RNA5SP223-201ENST00000365174 HOMEZQ8IX15 550 aa8.14□□□□□ -1.11
RNA5SP223-201ENST00000365174 WDR97A6NE52 1622 aa8.14□□□□□ -1.11
RNA5SP223-201ENST00000365174 WDR62O43379 1518 aa8.13□□□□□ -1.11
RNA5SP223-201ENST00000365174 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa8.12□□□□□ -1.11
RNA5SP223-201ENST00000365174 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa8.12□□□□□ -1.11
RNA5SP223-201ENST00000365174 GAPVD1Q14C86 1478 aa8.12□□□□□ -1.11
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