RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000364415.1

5S_rRNA.1-201, humanhuman

BASIC

Gene 5S_rRNA, Length 116 nt, Biotype rRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 NISCHQ9Y2I1 1504 aa10.02□□□□□ -0.8
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 DNAJC5BQ9UF47 199 aa9.85□□□□□ -0.83
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 ABCC9O60706 1549 aa9.82□□□□□ -0.84
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa9.33□□□□□ -0.92
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP9.14□□□□□ -0.95
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa9.09□□□□□ -0.95
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa8.97□□□□□ -0.97
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 CECR2Q9BXF3 1484 aa8.86□□□□□ -0.99
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 BICRAQ9NZM4 1560 aa8.84□□□□□ -0.99
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 DCAF8L2P0C7V8 631 aa8.8□□□□□ -1
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 NACADO15069 1562 aa8.79□□□□□ -1
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 UNC13AQ9UPW8 1703 aa8.79□□□□□ -1
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa8.78□□□□□ -1
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 TRIM41Q8WV44 630 aa8.71□□□□□ -1.02
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 CUX2O14529 1486 aa8.58□□□□□ -1.04
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa8.49□□□□□ -1.05
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 MYO15BQ96JP2 1530 aa8.47□□□□□ -1.05
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 ERCC6Q03468 1493 aa8.43□□□□□ -1.06
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 SCRIBQ14160 1630 aa8.39□□□□□ -1.07
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 NESP48681 1621 aa8.3□□□□□ -1.08
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 NCAPD3P42695 1498 aa8.19□□□□□ -1.1
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 OSCARQ8IYS5 282 aa8.19□□□□□ -1.1
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa8.18□□□□□ -1.1
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 SMARCA2P51531 1590 aa8.14□□□□□ -1.11
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 TRHP20396 242 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa8.11□□□□□ -1.11
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa8.09□□□□□ -1.11
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa8.09□□□□□ -1.11
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa8.09□□□□□ -1.11
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 CYB5RLQ6IPT4 315 aa8.08□□□□□ -1.12
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa8.06□□□□□ -1.12
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 PDS5BQ9NTI5 1447 aa8.03□□□□□ -1.12
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 ARHGEF11O15085 1522 aa8.02□□□□□ -1.13
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa8.01□□□□□ -1.13
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 HMGXB3Q12766 1538 aa8□□□□□ -1.13
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 MRC2Q9UBG0 1479 aa8□□□□□ -1.13
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 WDR62O43379 1518 aa7.98□□□□□ -1.13
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 ARAP1Q96P48 1450 aa7.94□□□□□ -1.14
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 CADPSQ9ULU8 1353 aa7.93□□□□□ -1.14
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 SMARCA4P51532 1647 aa7.9□□□□□ -1.14
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 CEP164Q9UPV0 1460 aa7.83□□□□□ -1.16
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 FANCD2Q9BXW9 1451 aa7.82□□□□□ -1.16
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 PEG3Q9GZU2 1588 aa7.8□□□□□ -1.16
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa7.8□□□□□ -1.16
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 MROH2BQ7Z745 1585 aa7.76□□□□□ -1.17
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 FBLN2P98095 1184 aa7.76□□□□□ -1.17
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP7.71□□□□□ -1.18
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 CFTRP13569 1480 aa7.71□□□□□ -1.18
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 IFT140Q96RY7 1462 aa7.71□□□□□ -1.18
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 CHD1O14646 1710 aa7.7□□□□□ -1.18
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 CLASP1Q7Z460 1538 aa7.64□□□□□ -1.19
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 GAPVD1Q14C86 1478 aa7.62□□□□□ -1.19
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 ILDR2Q71H61 639 aa7.62□□□□□ -1.19
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 FBXO41Q8TF61 875 aa7.62□□□□□ -1.19
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 TOPBP1Q92547 1522 aa7.62□□□□□ -1.19
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 WIZO95785 1651 aa7.61□□□□□ -1.19
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.2
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 ERCC6L2Q5T890 1561 aa7.57□□□□□ -1.2
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 LMTK3Q96Q04 1460 aa7.56□□□□□ -1.2
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa7.55□□□□□ -1.2
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa7.55□□□□□ -1.2
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 HECW2Q9P2P5 1572 aa7.55□□□□□ -1.2
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 KIF13AQ9H1H9 1805 aa7.55□□□□□ -1.2
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 SOCS7O14512 581 aa7.55□□□□□ -1.2
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 FAM69CQ0P6D2 419 aa7.55□□□□□ -1.2
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 SYNJ1O43426 1573 aa7.52□□□□□ -1.21
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 SYNJ2O15056 1496 aa7.5□□□□□ -1.21
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 ADGRL1O94910 1474 aa7.49□□□□□ -1.21
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 DNMBPQ6XZF7 1577 aa7.49□□□□□ -1.21
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 SOGA1O94964 1423 aa7.48□□□□□ -1.21
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 ABCC8Q09428 1581 aa7.47□□□□□ -1.21
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 ABCC10Q5T3U5 1492 aa7.47□□□□□ -1.21
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 KDM6BO15054 1643 aa7.46□□□□□ -1.21
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 DISP3Q9P2K9 1392 aa7.44□□□□□ -1.22
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 CCDC88BA6NC98 1476 aa7.43□□□□□ -1.22
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 GRIN2BQ13224 1484 aa7.43□□□□□ -1.22
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 CEP170Q5SW79 1584 aa7.42□□□□□ -1.22
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 PRDM2Q13029 1718 aa7.42□□□□□ -1.22
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 DIP2BQ9P265 1576 aa7.4□□□□□ -1.22
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 TSPOAP1O95153 1857 aa7.38□□□□□ -1.23
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 FGD5Q6ZNL6 1462 aa7.37□□□□□ -1.23
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP7.37□□□□□ -1.23
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 NUP160Q12769 1436 aa7.35□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.9 ms