RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361419.9

CERS2-203, Transcript of ceramide synthase 2, humanhuman

TSL 2

Gene CERS2, Length 997 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERS2-203ENST00000361419 NISCHQ9Y2I1 1504 aa74.72■■■■■ 9.55
CERS2-203ENST00000361419 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa66.68■■■■■ 8.27
CERS2-203ENST00000361419 ABCC9O60706 1549 aa66.48■■■■■ 8.23
CERS2-203ENST00000361419 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa63.41■■■■■ 7.74
CERS2-203ENST00000361419 DCAF8L2P0C7V8 631 aa63.12■■■■■ 7.69
CERS2-203ENST00000361419 NACADO15069 1562 aa63.1■■■■■ 7.69
CERS2-203ENST00000361419 MYO15BQ96JP2 1530 aa62.4■■■■■ 7.58
CERS2-203ENST00000361419 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP62.08■■■■■ 7.53
CERS2-203ENST00000361419 DNAJC5BQ9UF47 199 aa62.04■■■■■ 7.52
CERS2-203ENST00000361419 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP62■■■■■ 7.51
CERS2-203ENST00000361419 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa61.74■■■■■ 7.47
CERS2-203ENST00000361419 UNC13AQ9UPW8 1703 aa61.64■■■■■ 7.46
CERS2-203ENST00000361419 BICRAQ9NZM4 1560 aa61.47■■■■■ 7.43
CERS2-203ENST00000361419 SCRIBQ14160 1630 aa60.87■■■■■ 7.33
CERS2-203ENST00000361419 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa60.81■■■■■ 7.33
CERS2-203ENST00000361419 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP59.99■■■■■ 7.19
CERS2-203ENST00000361419 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa59.98■■■■■ 7.19
CERS2-203ENST00000361419 CECR2Q9BXF3 1484 aa59.87■■■■■ 7.17
CERS2-203ENST00000361419 NCAPD3P42695 1498 aa58.33■■■■■ 6.93
CERS2-203ENST00000361419 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa58.18■■■■■ 6.9
CERS2-203ENST00000361419 SMARCA4P51532 1647 aa58.1■■■■■ 6.89
CERS2-203ENST00000361419 SMARCA2P51531 1590 aa58.01■■■■■ 6.88
CERS2-203ENST00000361419 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP57.97■■■■■ 6.87
CERS2-203ENST00000361419 HMGXB3Q12766 1538 aa57.83■■■■■ 6.85
CERS2-203ENST00000361419 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP57.65■■■■■ 6.82
CERS2-203ENST00000361419 MROH2BQ7Z745 1585 aa57.56■■■■■ 6.8
CERS2-203ENST00000361419 PEG3Q9GZU2 1588 aa57.56■■■■■ 6.8
CERS2-203ENST00000361419 ERCC6Q03468 1493 aa57.42■■■■■ 6.78
CERS2-203ENST00000361419 NESP48681 1621 aa57.19■■■■■ 6.75
CERS2-203ENST00000361419 CUX2O14529 1486 aa57.13■■■■■ 6.74
CERS2-203ENST00000361419 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa56.84■■■■■ 6.69
CERS2-203ENST00000361419 WIZO95785 1651 aa56.79■■■■■ 6.68
CERS2-203ENST00000361419 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa56.73■■■■■ 6.67
CERS2-203ENST00000361419 PDS5BQ9NTI5 1447 aa56.66■■■■■ 6.66
CERS2-203ENST00000361419 CADPSQ9ULU8 1353 aa56.63■■■■■ 6.66
CERS2-203ENST00000361419 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP56.61■■■■■ 6.65
CERS2-203ENST00000361419 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP56.4■■■■■ 6.62
CERS2-203ENST00000361419 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa56.26■■■■■ 6.6
CERS2-203ENST00000361419 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP56.19■■■■■ 6.59
CERS2-203ENST00000361419 MRC2Q9UBG0 1479 aa56.06■■■■■ 6.56
CERS2-203ENST00000361419 CFTRP13569 1480 aa56.01■■■■■ 6.56
CERS2-203ENST00000361419 CEP164Q9UPV0 1460 aa55.92■■■■■ 6.54
CERS2-203ENST00000361419 FANCD2Q9BXW9 1451 aa55.91■■■■■ 6.54
CERS2-203ENST00000361419 WDR62O43379 1518 aa55.84■■■■■ 6.53
CERS2-203ENST00000361419 CCDC88BA6NC98 1476 aa55.62■■■■■ 6.49
CERS2-203ENST00000361419 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP55.36■■■■■ 6.45
CERS2-203ENST00000361419 PRDM2Q13029 1718 aa55.09■■■■■ 6.41
CERS2-203ENST00000361419 TOPBP1Q92547 1522 aa54.86■■■■■ 6.37
CERS2-203ENST00000361419 ABCC8Q09428 1581 aa54.85■■■■■ 6.37
CERS2-203ENST00000361419 IFT140Q96RY7 1462 aa54.82■■■■■ 6.37
CERS2-203ENST00000361419 OSCARQ8IYS5 282 aa54.76■■■■■ 6.36
CERS2-203ENST00000361419 DNMBPQ6XZF7 1577 aa54.66■■■■■ 6.34
CERS2-203ENST00000361419 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP54.64■■■■■ 6.34
CERS2-203ENST00000361419 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP54.55■■■■■ 6.32
CERS2-203ENST00000361419 TRIM41Q8WV44 630 aa54.43■■■■■ 6.3
CERS2-203ENST00000361419 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP54.35■■■■■ 6.29
CERS2-203ENST00000361419 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP54.26■■■■■ 6.286e-9■■■■□ 25.2
CERS2-203ENST00000361419 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP54.24■■■■■ 6.27
CERS2-203ENST00000361419 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP54.23■■■■■ 6.27
CERS2-203ENST00000361419 SOGA1O94964 1423 aa54.19■■■■■ 6.27
CERS2-203ENST00000361419 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa54.16■■■■■ 6.26
CERS2-203ENST00000361419 FGD5Q6ZNL6 1462 aa54.06■■■■■ 6.24
CERS2-203ENST00000361419 CUX1P39880 1505 aa54.04■■■■■ 6.24
CERS2-203ENST00000361419 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP54.04■■■■■ 6.24
CERS2-203ENST00000361419 FBLN2P98095 1184 aa53.94■■■■■ 6.23
CERS2-203ENST00000361419 WDR97A6NE52 1622 aa53.76■■■■■ 6.2
CERS2-203ENST00000361419 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa53.7■■■■■ 6.19
CERS2-203ENST00000361419 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa53.7■■■■■ 6.19
CERS2-203ENST00000361419 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa53.7■■■■■ 6.19
CERS2-203ENST00000361419 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa53.68■■■■■ 6.18
CERS2-203ENST00000361419 ARHGEF11O15085 1522 aa53.68■■■■■ 6.18
CERS2-203ENST00000361419 CHD1O14646 1710 aa53.65■■■■■ 6.18
CERS2-203ENST00000361419 GRIN2BQ13224 1484 aa53.64■■■■■ 6.18
CERS2-203ENST00000361419 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP53.62■■■■■ 6.17
CERS2-203ENST00000361419 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP53.57■■■■■ 6.17
CERS2-203ENST00000361419 GAPVD1Q14C86 1478 aa53.5■■■■■ 6.15
CERS2-203ENST00000361419 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa53.49■■■■■ 6.15
CERS2-203ENST00000361419 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP53.44■■■■■ 6.15
CERS2-203ENST00000361419 CYB5RLQ6IPT4 315 aa53.43■■■■■ 6.14
CERS2-203ENST00000361419 SYNJ2O15056 1496 aa53.39■■■■■ 6.14
CERS2-203ENST00000361419 TOP2BQ02880 1626 aa53.26■■■■■ 6.12
CERS2-203ENST00000361419 SYNJ1O43426 1573 aa53.26■■■■■ 6.12
CERS2-203ENST00000361419 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa53.24■■■■■ 6.11
CERS2-203ENST00000361419 CLASP1Q7Z460 1538 aa53.2■■■■■ 6.11
CERS2-203ENST00000361419 ARAP1Q96P48 1450 aa53.19■■■■■ 6.1
CERS2-203ENST00000361419 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa53.18■■■■■ 6.1
CERS2-203ENST00000361419 PBRM1Q86U86 1689 aa53.17■■■■■ 6.1
CERS2-203ENST00000361419 GRIN2AQ12879 1464 aa52.9■■■■■ 6.06
CERS2-203ENST00000361419 FHAD1B1AJZ9 1412 aa52.87■■■■■ 6.05
CERS2-203ENST00000361419 ADAMTS12P58397 1594 aa52.84■■■■■ 6.05
CERS2-203ENST00000361419 ERICH3Q5RHP9 1530 aa52.81■■■■■ 6.04
CERS2-203ENST00000361419 NUP160Q12769 1436 aa52.74■■■■■ 6.03
CERS2-203ENST00000361419 TRHP20396 242 aaPredicted RBP52.72■■■■■ 6.03
CERS2-203ENST00000361419 CEP170Q5SW79 1584 aa52.6■■■■■ 6.01
CERS2-203ENST00000361419 KIF27Q86VH2 1401 aa52.41■■■■■ 5.98
CERS2-203ENST00000361419 ERCC6L2Q5T890 1561 aa52.39■■■■■ 5.98
CERS2-203ENST00000361419 IGF1RP08069 1367 aa52.35■■■■■ 5.97
CERS2-203ENST00000361419 JPH4Q96JJ6 628 aa52.33■■■■■ 5.97
CERS2-203ENST00000361419 SHROOM2Q13796 1616 aa52.29■■■■■ 5.96
CERS2-203ENST00000361419 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP52.23■■■■■ 5.95
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