RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357658.4

SZT2-201, Transcript of SZT2, KICSTOR complex subunit, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SZT2, Length 1,601 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SZT2-201ENST00000357658 NISCHQ9Y2I1 1504 aa45.59■■■■■ 4.89
SZT2-201ENST00000357658 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa40.47■■■■■ 4.07
SZT2-201ENST00000357658 ABCC9O60706 1549 aa39.29■■■■□ 3.88
SZT2-201ENST00000357658 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP38.05■■■■□ 3.68
SZT2-201ENST00000357658 NACADO15069 1562 aa37.95■■■■□ 3.67
SZT2-201ENST00000357658 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa37.91■■■■□ 3.66
SZT2-201ENST00000357658 MYO15BQ96JP2 1530 aa37.84■■■■□ 3.65
SZT2-201ENST00000357658 DCAF8L2P0C7V8 631 aa37.8■■■■□ 3.64
SZT2-201ENST00000357658 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa37.76■■■■□ 3.64
SZT2-201ENST00000357658 UNC13AQ9UPW8 1703 aa37.22■■■■□ 3.55
SZT2-201ENST00000357658 SCRIBQ14160 1630 aa36.89■■■■□ 3.5
SZT2-201ENST00000357658 BICRAQ9NZM4 1560 aa36.86■■■■□ 3.49
SZT2-201ENST00000357658 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP36.71■■■■□ 3.47
SZT2-201ENST00000357658 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa36.42■■■■□ 3.42
SZT2-201ENST00000357658 DNAJC5BQ9UF47 199 aa35.89■■■■□ 3.34
SZT2-201ENST00000357658 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP35.81■■■■□ 3.32
SZT2-201ENST00000357658 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa35.61■■■■□ 3.29
SZT2-201ENST00000357658 CECR2Q9BXF3 1484 aa35.49■■■■□ 3.27
SZT2-201ENST00000357658 SMARCA4P51532 1647 aa35.35■■■■□ 3.25
SZT2-201ENST00000357658 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP35.3■■■■□ 3.24
SZT2-201ENST00000357658 MROH2BQ7Z745 1585 aa35.15■■■■□ 3.22
SZT2-201ENST00000357658 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.06■■■■□ 3.2
SZT2-201ENST00000357658 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.04■■■■□ 3.2
SZT2-201ENST00000357658 SMARCA2P51531 1590 aa35.02■■■■□ 3.2
SZT2-201ENST00000357658 NCAPD3P42695 1498 aa35.01■■■■□ 3.2
SZT2-201ENST00000357658 HMGXB3Q12766 1538 aa34.89■■■■□ 3.18
SZT2-201ENST00000357658 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP34.81■■■■□ 3.16
SZT2-201ENST00000357658 WIZO95785 1651 aa34.8■■■■□ 3.16
SZT2-201ENST00000357658 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP34.75■■■■□ 3.15
SZT2-201ENST00000357658 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP34.41■■■■□ 3.1
SZT2-201ENST00000357658 NESP48681 1621 aa34.11■■■■□ 3.05
SZT2-201ENST00000357658 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.06■■■■□ 3.04
SZT2-201ENST00000357658 CCDC88BA6NC98 1476 aa33.99■■■■□ 3.03
SZT2-201ENST00000357658 CADPSQ9ULU8 1353 aa33.97■■■■□ 3.03
SZT2-201ENST00000357658 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP33.97■■■■□ 3.03
SZT2-201ENST00000357658 CFTRP13569 1480 aa33.86■■■■□ 3.01
SZT2-201ENST00000357658 ERCC6Q03468 1493 aa33.79■■■■□ 3
SZT2-201ENST00000357658 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa33.77■■■■□ 3
SZT2-201ENST00000357658 PDS5BQ9NTI5 1447 aa33.75■■■□□ 2.99
SZT2-201ENST00000357658 PRDM2Q13029 1718 aa33.72■■■□□ 2.99
SZT2-201ENST00000357658 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP33.6■■■□□ 2.97
SZT2-201ENST00000357658 FANCD2Q9BXW9 1451 aa33.59■■■□□ 2.97
SZT2-201ENST00000357658 CEP164Q9UPV0 1460 aa33.51■■■□□ 2.96
SZT2-201ENST00000357658 MRC2Q9UBG0 1479 aa33.42■■■□□ 2.94
SZT2-201ENST00000357658 CUX2O14529 1486 aa33.42■■■□□ 2.94
SZT2-201ENST00000357658 WDR62O43379 1518 aa33.36■■■□□ 2.93
SZT2-201ENST00000357658 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP33.28■■■□□ 2.92
SZT2-201ENST00000357658 TOPBP1Q92547 1522 aa33.1■■■□□ 2.89
SZT2-201ENST00000357658 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.09■■■□□ 2.89
SZT2-201ENST00000357658 ABCC8Q09428 1581 aa33.07■■■□□ 2.88
SZT2-201ENST00000357658 CUX1P39880 1505 aa32.96■■■□□ 2.87
SZT2-201ENST00000357658 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP32.85■■■□□ 2.85
SZT2-201ENST00000357658 IFT140Q96RY7 1462 aa32.8■■■□□ 2.84
SZT2-201ENST00000357658 FGD5Q6ZNL6 1462 aa32.78■■■□□ 2.84
SZT2-201ENST00000357658 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP32.78■■■□□ 2.84
SZT2-201ENST00000357658 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP32.78■■■□□ 2.84
SZT2-201ENST00000357658 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa32.76■■■□□ 2.84
SZT2-201ENST00000357658 SYNJ1O43426 1573 aa32.76■■■□□ 2.83
SZT2-201ENST00000357658 TOP2BQ02880 1626 aa32.74■■■□□ 2.83
SZT2-201ENST00000357658 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa32.68■■■□□ 2.82
SZT2-201ENST00000357658 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP32.67■■■□□ 2.82
SZT2-201ENST00000357658 SOGA1O94964 1423 aa32.65■■■□□ 2.82
SZT2-201ENST00000357658 WDR97A6NE52 1622 aa32.6■■■□□ 2.81
SZT2-201ENST00000357658 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP32.58■■■□□ 2.81
SZT2-201ENST00000357658 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa32.49■■■□□ 2.79
SZT2-201ENST00000357658 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP32.49■■■□□ 2.796e-7■■■■■ 27.9
SZT2-201ENST00000357658 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP32.44■■■□□ 2.78
SZT2-201ENST00000357658 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.39■■■□□ 2.78
SZT2-201ENST00000357658 PBRM1Q86U86 1689 aa32.31■■■□□ 2.76
SZT2-201ENST00000357658 GAPVD1Q14C86 1478 aa32.3■■■□□ 2.76
SZT2-201ENST00000357658 GRIN2BQ13224 1484 aa32.26■■■□□ 2.75
SZT2-201ENST00000357658 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa32.2■■■□□ 2.74
SZT2-201ENST00000357658 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP32.17■■■□□ 2.74
SZT2-201ENST00000357658 CHD1O14646 1710 aa32.15■■■□□ 2.74
SZT2-201ENST00000357658 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.1■■■□□ 2.73
SZT2-201ENST00000357658 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa32.09■■■□□ 2.73
SZT2-201ENST00000357658 TRIM41Q8WV44 630 aa32.07■■■□□ 2.72
SZT2-201ENST00000357658 KIF27Q86VH2 1401 aa32.05■■■□□ 2.72
SZT2-201ENST00000357658 SYNJ2O15056 1496 aa32.04■■■□□ 2.72
SZT2-201ENST00000357658 ADAMTS12P58397 1594 aa32.03■■■□□ 2.72
SZT2-201ENST00000357658 OSCARQ8IYS5 282 aa32■■■□□ 2.71
SZT2-201ENST00000357658 FBLN2P98095 1184 aa31.93■■■□□ 2.7
SZT2-201ENST00000357658 FHAD1B1AJZ9 1412 aa31.93■■■□□ 2.7
SZT2-201ENST00000357658 IGF1RP08069 1367 aa31.93■■■□□ 2.7
SZT2-201ENST00000357658 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP31.92■■■□□ 2.7
SZT2-201ENST00000357658 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa31.91■■■□□ 2.7
SZT2-201ENST00000357658 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.9■■■□□ 2.7
SZT2-201ENST00000357658 GRIN2AQ12879 1464 aa31.87■■■□□ 2.69
SZT2-201ENST00000357658 CUL7Q14999 1698 aa31.86■■■□□ 2.69
SZT2-201ENST00000357658 CLASP1Q7Z460 1538 aa31.8■■■□□ 2.68
SZT2-201ENST00000357658 CEP170Q5SW79 1584 aa31.75■■■□□ 2.67
SZT2-201ENST00000357658 NUP160Q12769 1436 aa31.74■■■□□ 2.67
SZT2-201ENST00000357658 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa31.71■■■□□ 2.67
SZT2-201ENST00000357658 EEA1Q15075 1411 aa31.58■■■□□ 2.65
SZT2-201ENST00000357658 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa31.58■■■□□ 2.65
SZT2-201ENST00000357658 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa31.58■■■□□ 2.65
SZT2-201ENST00000357658 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa31.58■■■□□ 2.65
SZT2-201ENST00000357658 ARHGEF11O15085 1522 aa31.57■■■□□ 2.64
SZT2-201ENST00000357658 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa31.56■■■□□ 2.64
SZT2-201ENST00000357658 PRXQ9BXM0 1461 aa31.56■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.5 ms