RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356667.8

PGC-201, Transcript of progastricsin, humanhuman

TSL 5

Gene PGC, Length 480 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGC-201ENST00000356667 NISCHQ9Y2I1 1504 aa24.86■■□□□ 1.57
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PGC-201ENST00000356667 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa20.79■□□□□ 0.92
PGC-201ENST00000356667 NACADO15069 1562 aa20.76■□□□□ 0.91
PGC-201ENST00000356667 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
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PGC-201ENST00000356667 MYO15BQ96JP2 1530 aa20.64■□□□□ 0.9
PGC-201ENST00000356667 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa20.57■□□□□ 0.88
PGC-201ENST00000356667 UNC13AQ9UPW8 1703 aa20.42■□□□□ 0.86
PGC-201ENST00000356667 BICRAQ9NZM4 1560 aa20.21■□□□□ 0.83
PGC-201ENST00000356667 SCRIBQ14160 1630 aa20.2■□□□□ 0.82
PGC-201ENST00000356667 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP20.17■□□□□ 0.82
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PGC-201ENST00000356667 DNAJC5BQ9UF47 199 aa19.82■□□□□ 0.76
PGC-201ENST00000356667 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP19.66■□□□□ 0.74
PGC-201ENST00000356667 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa19.58■□□□□ 0.72
PGC-201ENST00000356667 CECR2Q9BXF3 1484 aa19.41■□□□□ 0.7
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PGC-201ENST00000356667 NCAPD3P42695 1498 aa19.15■□□□□ 0.66
PGC-201ENST00000356667 SMARCA2P51531 1590 aa19.15■□□□□ 0.66
PGC-201ENST00000356667 PEG3Q9GZU2 1588 aa19.12■□□□□ 0.65
PGC-201ENST00000356667 HMGXB3Q12766 1538 aa19.09■□□□□ 0.65
PGC-201ENST00000356667 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP19.01■□□□□ 0.63
PGC-201ENST00000356667 WIZO95785 1651 aa19■□□□□ 0.63
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PGC-201ENST00000356667 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa18.66■□□□□ 0.58
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PGC-201ENST00000356667 CADPSQ9ULU8 1353 aa18.57■□□□□ 0.56
PGC-201ENST00000356667 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa18.55■□□□□ 0.56
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PGC-201ENST00000356667 PDS5BQ9NTI5 1447 aa18.49■□□□□ 0.55
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PGC-201ENST00000356667 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa18.41■□□□□ 0.54
PGC-201ENST00000356667 CUX2O14529 1486 aa18.4■□□□□ 0.54
PGC-201ENST00000356667 FANCD2Q9BXW9 1451 aa18.39■□□□□ 0.53
PGC-201ENST00000356667 CEP164Q9UPV0 1460 aa18.36■□□□□ 0.53
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PGC-201ENST00000356667 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
PGC-201ENST00000356667 TOPBP1Q92547 1522 aa18.11■□□□□ 0.49
PGC-201ENST00000356667 DNMBPQ6XZF7 1577 aa18.09■□□□□ 0.49
PGC-201ENST00000356667 ABCC8Q09428 1581 aa18.05■□□□□ 0.48
PGC-201ENST00000356667 CUX1P39880 1505 aa18■□□□□ 0.47
PGC-201ENST00000356667 IFT140Q96RY7 1462 aa17.97■□□□□ 0.47
PGC-201ENST00000356667 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
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PGC-201ENST00000356667 TOP2BQ02880 1626 aa17.84■□□□□ 0.45
PGC-201ENST00000356667 SOGA1O94964 1423 aa17.84■□□□□ 0.45
PGC-201ENST00000356667 WDR97A6NE52 1622 aa17.83■□□□□ 0.45
PGC-201ENST00000356667 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP17.8■□□□□ 0.44
PGC-201ENST00000356667 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
PGC-201ENST00000356667 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa17.74■□□□□ 0.43
PGC-201ENST00000356667 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa17.71■□□□□ 0.43
PGC-201ENST00000356667 PBRM1Q86U86 1689 aa17.69■□□□□ 0.42
PGC-201ENST00000356667 CHD1O14646 1710 aa17.67■□□□□ 0.42
PGC-201ENST00000356667 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa17.66■□□□□ 0.42
PGC-201ENST00000356667 GRIN2BQ13224 1484 aa17.65■□□□□ 0.42
PGC-201ENST00000356667 GAPVD1Q14C86 1478 aa17.65■□□□□ 0.42
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PGC-201ENST00000356667 OSCARQ8IYS5 282 aa17.59■□□□□ 0.41
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PGC-201ENST00000356667 ADAMTS12P58397 1594 aa17.53■□□□□ 0.4
PGC-201ENST00000356667 CHIC1Q5VXU3 224 aa17.53■□□□□ 0.4
PGC-201ENST00000356667 ERICH3Q5RHP9 1530 aa17.52■□□□□ 0.4
PGC-201ENST00000356667 FBLN2P98095 1184 aa17.52■□□□□ 0.4
PGC-201ENST00000356667 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP17.48■□□□□ 0.39
PGC-201ENST00000356667 CLASP1Q7Z460 1538 aa17.45■□□□□ 0.38
PGC-201ENST00000356667 FHAD1B1AJZ9 1412 aa17.45■□□□□ 0.38
PGC-201ENST00000356667 KIF27Q86VH2 1401 aa17.45■□□□□ 0.38
PGC-201ENST00000356667 GRIN2AQ12879 1464 aa17.44■□□□□ 0.38
PGC-201ENST00000356667 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa17.42■□□□□ 0.38
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PGC-201ENST00000356667 TRIM41Q8WV44 630 aa17.4■□□□□ 0.38
PGC-201ENST00000356667 CEP170Q5SW79 1584 aa17.4■□□□□ 0.38
PGC-201ENST00000356667 ARHGEF11O15085 1522 aa17.39■□□□□ 0.37
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PGC-201ENST00000356667 CUL7Q14999 1698 aa17.39■□□□□ 0.37
PGC-201ENST00000356667 NUP160Q12769 1436 aa17.37■□□□□ 0.37
PGC-201ENST00000356667 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa17.36■□□□□ 0.37
PGC-201ENST00000356667 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa17.28■□□□□ 0.36
PGC-201ENST00000356667 SHROOM2Q13796 1616 aa17.27■□□□□ 0.36
PGC-201ENST00000356667 ARAP1Q96P48 1450 aa17.26■□□□□ 0.35
PGC-201ENST00000356667 ERCC6L2Q5T890 1561 aa17.23■□□□□ 0.35
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