RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000354194.4

VMO1-202, Transcript of vitelline membrane outer layer 1 homolog, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene VMO1, Length 651 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VMO1-202ENST00000354194 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.79■■■■■ 4.28
VMO1-202ENST00000354194 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa36.93■■■■□ 3.5
VMO1-202ENST00000354194 ABCC9O60706 1549 aa36.11■■■■□ 3.37
VMO1-202ENST00000354194 DCAF8L2P0C7V8 631 aa35.02■■■■□ 3.2
VMO1-202ENST00000354194 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.84■■■■□ 3.17
VMO1-202ENST00000354194 NACADO15069 1562 aa34.73■■■■□ 3.15
VMO1-202ENST00000354194 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.72■■■■□ 3.15
VMO1-202ENST00000354194 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.55■■■■□ 3.12
VMO1-202ENST00000354194 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.51■■■■□ 3.12
VMO1-202ENST00000354194 UNC13AQ9UPW8 1703 aa33.87■■■■□ 3.01
VMO1-202ENST00000354194 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP33.86■■■■□ 3.01
VMO1-202ENST00000354194 SCRIBQ14160 1630 aa33.85■■■■□ 3.01
VMO1-202ENST00000354194 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.68■■■□□ 2.98
VMO1-202ENST00000354194 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.31■■■□□ 2.92
VMO1-202ENST00000354194 DNAJC5BQ9UF47 199 aa32.99■■■□□ 2.87
VMO1-202ENST00000354194 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.78■■■□□ 2.84
VMO1-202ENST00000354194 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.6■■■□□ 2.81
VMO1-202ENST00000354194 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.6■■■□□ 2.81
VMO1-202ENST00000354194 SMARCA4P51532 1647 aa32.35■■■□□ 2.77
VMO1-202ENST00000354194 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.35■■■□□ 2.77
VMO1-202ENST00000354194 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.24■■■□□ 2.75
VMO1-202ENST00000354194 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.16■■■□□ 2.74
VMO1-202ENST00000354194 NCAPD3P42695 1498 aa32.09■■■□□ 2.73
VMO1-202ENST00000354194 SMARCA2P51531 1590 aa32.08■■■□□ 2.73
VMO1-202ENST00000354194 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.98■■■□□ 2.71
VMO1-202ENST00000354194 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.98■■■□□ 2.71
VMO1-202ENST00000354194 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.91■■■□□ 2.7
VMO1-202ENST00000354194 HMGXB3Q12766 1538 aa31.9■■■□□ 2.7
VMO1-202ENST00000354194 WIZO95785 1651 aa31.88■■■□□ 2.69
VMO1-202ENST00000354194 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.54■■■□□ 2.64
VMO1-202ENST00000354194 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.47■■■□□ 2.63
VMO1-202ENST00000354194 NESP48681 1621 aa31.31■■■□□ 2.6
VMO1-202ENST00000354194 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.22■■■□□ 2.59
VMO1-202ENST00000354194 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.21■■■□□ 2.59
VMO1-202ENST00000354194 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.16■■■□□ 2.58
VMO1-202ENST00000354194 ERCC6Q03468 1493 aa31.08■■■□□ 2.57
VMO1-202ENST00000354194 CFTRP13569 1480 aa31.03■■■□□ 2.56
VMO1-202ENST00000354194 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.01■■■□□ 2.55
VMO1-202ENST00000354194 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.84■■■□□ 2.53
VMO1-202ENST00000354194 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.84■■■□□ 2.53
VMO1-202ENST00000354194 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.76■■■□□ 2.52
VMO1-202ENST00000354194 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.68■■■□□ 2.5
VMO1-202ENST00000354194 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.67■■■□□ 2.5
VMO1-202ENST00000354194 PRDM2Q13029 1718 aa30.67■■■□□ 2.5
VMO1-202ENST00000354194 CUX2O14529 1486 aa30.6■■■□□ 2.49
VMO1-202ENST00000354194 WDR62O43379 1518 aa30.52■■■□□ 2.48
VMO1-202ENST00000354194 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.52■■■□□ 2.48
VMO1-202ENST00000354194 TOPBP1Q92547 1522 aa30.36■■■□□ 2.45
VMO1-202ENST00000354194 ABCC8Q09428 1581 aa30.32■■■□□ 2.45
VMO1-202ENST00000354194 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.31■■■□□ 2.44
VMO1-202ENST00000354194 CUX1P39880 1505 aa30.22■■■□□ 2.43
VMO1-202ENST00000354194 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.13■■■□□ 2.41
VMO1-202ENST00000354194 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.12■■■□□ 2.41
VMO1-202ENST00000354194 IFT140Q96RY7 1462 aa30.11■■■□□ 2.41
VMO1-202ENST00000354194 FGD5Q6ZNL6 1462 aa30.09■■■□□ 2.41
VMO1-202ENST00000354194 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.05■■■□□ 2.4
VMO1-202ENST00000354194 SOGA1O94964 1423 aa30.05■■■□□ 2.4
VMO1-202ENST00000354194 SYNJ1O43426 1573 aa30.02■■■□□ 2.4
VMO1-202ENST00000354194 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30■■■□□ 2.39
VMO1-202ENST00000354194 TOP2BQ02880 1626 aa29.98■■■□□ 2.39
VMO1-202ENST00000354194 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
VMO1-202ENST00000354194 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.94■■■□□ 2.38
VMO1-202ENST00000354194 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.89■■■□□ 2.37
VMO1-202ENST00000354194 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.87■■■□□ 2.37
VMO1-202ENST00000354194 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.81■■■□□ 2.36
VMO1-202ENST00000354194 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.78■■■□□ 2.36
VMO1-202ENST00000354194 WDR97A6NE52 1622 aa29.72■■■□□ 2.35
VMO1-202ENST00000354194 TRIM41Q8WV44 630 aa29.67■■■□□ 2.34
VMO1-202ENST00000354194 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.67■■■□□ 2.34
VMO1-202ENST00000354194 GRIN2BQ13224 1484 aa29.62■■■□□ 2.33
VMO1-202ENST00000354194 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.6■■■□□ 2.33
VMO1-202ENST00000354194 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.57■■■□□ 2.32
VMO1-202ENST00000354194 FBLN2P98095 1184 aa29.55■■■□□ 2.32
VMO1-202ENST00000354194 PBRM1Q86U86 1689 aa29.5■■■□□ 2.31
VMO1-202ENST00000354194 OSCARQ8IYS5 282 aa29.49■■■□□ 2.31
VMO1-202ENST00000354194 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.49■■■□□ 2.31
VMO1-202ENST00000354194 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
VMO1-202ENST00000354194 KIF27Q86VH2 1401 aa29.48■■■□□ 2.31
VMO1-202ENST00000354194 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.46■■■□□ 2.31
VMO1-202ENST00000354194 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.46■■■□□ 2.31
VMO1-202ENST00000354194 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.4■■■□□ 2.3
VMO1-202ENST00000354194 SYNJ2O15056 1496 aa29.39■■■□□ 2.3
VMO1-202ENST00000354194 IGF1RP08069 1367 aa29.38■■■□□ 2.29
VMO1-202ENST00000354194 CHD1O14646 1710 aa29.37■■■□□ 2.29
VMO1-202ENST00000354194 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.35■■■□□ 2.29
VMO1-202ENST00000354194 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.34■■■□□ 2.29
VMO1-202ENST00000354194 ADAMTS12P58397 1594 aa29.32■■■□□ 2.28
VMO1-202ENST00000354194 GRIN2AQ12879 1464 aa29.23■■■□□ 2.27
VMO1-202ENST00000354194 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa29.2■■■□□ 2.26
VMO1-202ENST00000354194 CUL7Q14999 1698 aa29.15■■■□□ 2.26
VMO1-202ENST00000354194 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP29.12■■■□□ 2.25
VMO1-202ENST00000354194 NUP160Q12769 1436 aa29.09■■■□□ 2.25
VMO1-202ENST00000354194 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.08■■■□□ 2.25
VMO1-202ENST00000354194 CEP170Q5SW79 1584 aa29.07■■■□□ 2.24
VMO1-202ENST00000354194 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29.07■■■□□ 2.24
VMO1-202ENST00000354194 EEA1Q15075 1411 aa29.03■■■□□ 2.24
VMO1-202ENST00000354194 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.02■■■□□ 2.24
VMO1-202ENST00000354194 PRXQ9BXM0 1461 aa28.96■■■□□ 2.23
VMO1-202ENST00000354194 ARHGEF11O15085 1522 aa28.94■■■□□ 2.22
VMO1-202ENST00000354194 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa28.9■■■□□ 2.22
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