RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000333796.3

USP17L2-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 17-like family member 2, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene USP17L2, Length 1,910 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L2-201ENST00000333796 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.82■■■□□ 2.84
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USP17L2-201ENST00000333796 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.14■■■□□ 2.1
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USP17L2-201ENST00000333796 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.62■■□□□ 1.85
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USP17L2-201ENST00000333796 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.21■■□□□ 1.63
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USP17L2-201ENST00000333796 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
USP17L2-201ENST00000333796 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
USP17L2-201ENST00000333796 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.69■■□□□ 1.54
USP17L2-201ENST00000333796 CFTRP13569 1480 aa24.65■■□□□ 1.54
USP17L2-201ENST00000333796 PRDM2Q13029 1718 aa24.55■■□□□ 1.52
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USP17L2-201ENST00000333796 TRIM41Q8WV44 630 aa24.39■■□□□ 1.49
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USP17L2-201ENST00000333796 IFT140Q96RY7 1462 aa24.22■■□□□ 1.47
USP17L2-201ENST00000333796 TOPBP1Q92547 1522 aa24.22■■□□□ 1.47
USP17L2-201ENST00000333796 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
USP17L2-201ENST00000333796 ABCC8Q09428 1581 aa24.15■■□□□ 1.46
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USP17L2-201ENST00000333796 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.05■■□□□ 1.44
USP17L2-201ENST00000333796 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.05■■□□□ 1.44
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USP17L2-201ENST00000333796 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
USP17L2-201ENST00000333796 CHD1O14646 1710 aa23.97■■□□□ 1.43
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USP17L2-201ENST00000333796 ARHGEF11O15085 1522 aa23.94■■□□□ 1.42
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USP17L2-201ENST00000333796 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.86■■□□□ 1.41
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USP17L2-201ENST00000333796 SOGA1O94964 1423 aa23.82■■□□□ 1.4
USP17L2-201ENST00000333796 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.81■■□□□ 1.4
USP17L2-201ENST00000333796 FBLN2P98095 1184 aa23.8■■□□□ 1.4
USP17L2-201ENST00000333796 WDR97A6NE52 1622 aa23.8■■□□□ 1.4
USP17L2-201ENST00000333796 CUX1P39880 1505 aa23.78■■□□□ 1.4
USP17L2-201ENST00000333796 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
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USP17L2-201ENST00000333796 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.71■■□□□ 1.39
USP17L2-201ENST00000333796 ARAP1Q96P48 1450 aa23.7■■□□□ 1.38
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USP17L2-201ENST00000333796 GRIN2BQ13224 1484 aa23.65■■□□□ 1.38
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USP17L2-201ENST00000333796 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
USP17L2-201ENST00000333796 SYNJ2O15056 1496 aa23.58■■□□□ 1.37
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USP17L2-201ENST00000333796 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.55■■□□□ 1.36
USP17L2-201ENST00000333796 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.54■■□□□ 1.36
USP17L2-201ENST00000333796 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.52■■□□□ 1.36
USP17L2-201ENST00000333796 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
USP17L2-201ENST00000333796 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.43■■□□□ 1.34
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USP17L2-201ENST00000333796 ADAMTS12P58397 1594 aa23.38■■□□□ 1.33
USP17L2-201ENST00000333796 GRIN2AQ12879 1464 aa23.35■■□□□ 1.33
USP17L2-201ENST00000333796 CEP170Q5SW79 1584 aa23.29■■□□□ 1.32
USP17L2-201ENST00000333796 NUP160Q12769 1436 aa23.25■■□□□ 1.31
USP17L2-201ENST00000333796 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.25■■□□□ 1.31
USP17L2-201ENST00000333796 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.25■■□□□ 1.31
USP17L2-201ENST00000333796 MYT1Q01538 1121 aa23.25■■□□□ 1.31
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USP17L2-201ENST00000333796 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.05■■□□□ 1.28
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