RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331057.8

C16orf52-201, Transcript of Uncharacterized protein C16orf52, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene C16orf52, Length 1,359 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf52-201ENST00000331057 NISCHQ9Y2I1 1504 aa68.37■■■■■ 8.54
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C16orf52-201ENST00000331057 MYO15BQ96JP2 1530 aa56.37■■■■■ 6.61
C16orf52-201ENST00000331057 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa56.37■■■■■ 6.61
C16orf52-201ENST00000331057 SCRIBQ14160 1630 aa55.34■■■■■ 6.45
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C16orf52-201ENST00000331057 PEG3Q9GZU2 1588 aa52.31■■■■■ 5.96
C16orf52-201ENST00000331057 SMARCA2P51531 1590 aa52.29■■■■■ 5.96
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C16orf52-201ENST00000331057 CFTRP13569 1480 aa50.54■■■■■ 5.68
C16orf52-201ENST00000331057 PRDM2Q13029 1718 aa50.48■■■■■ 5.67
C16orf52-201ENST00000331057 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa50.23■■■■■ 5.63
C16orf52-201ENST00000331057 PDS5BQ9NTI5 1447 aa50.16■■■■■ 5.62
C16orf52-201ENST00000331057 FANCD2Q9BXW9 1451 aa50.12■■■■■ 5.61
C16orf52-201ENST00000331057 ERCC6Q03468 1493 aa50.08■■■■■ 5.61
C16orf52-201ENST00000331057 CEP164Q9UPV0 1460 aa49.98■■■■■ 5.59
C16orf52-201ENST00000331057 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP49.77■■■■■ 5.56
C16orf52-201ENST00000331057 MRC2Q9UBG0 1479 aa49.7■■■■■ 5.55
C16orf52-201ENST00000331057 ABCC8Q09428 1581 aa49.67■■■■■ 5.54
C16orf52-201ENST00000331057 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP49.6■■■■■ 5.53
C16orf52-201ENST00000331057 WDR62O43379 1518 aa49.52■■■■■ 5.52
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C16orf52-201ENST00000331057 CUX1P39880 1505 aa49.47■■■■■ 5.51
C16orf52-201ENST00000331057 TOPBP1Q92547 1522 aa49.45■■■■■ 5.51
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C16orf52-201ENST00000331057 CUX2O14529 1486 aa49.13■■■■■ 5.45
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C16orf52-201ENST00000331057 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa48.9■■■■■ 5.42
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C16orf52-201ENST00000331057 SOGA1O94964 1423 aa48.83■■■■■ 5.41
C16orf52-201ENST00000331057 WDR97A6NE52 1622 aa48.8■■■■■ 5.4
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C16orf52-201ENST00000331057 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa48.48■■■■■ 5.35
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C16orf52-201ENST00000331057 PBRM1Q86U86 1689 aa48.36■■■■■ 5.33
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C16orf52-201ENST00000331057 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa48.28■■■■■ 5.32
C16orf52-201ENST00000331057 KIF27Q86VH2 1401 aa48.27■■■■■ 5.32
C16orf52-201ENST00000331057 GRIN2BQ13224 1484 aa48.16■■■■■ 5.3
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C16orf52-201ENST00000331057 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa48.07■■■■■ 5.29
C16orf52-201ENST00000331057 ADAMTS12P58397 1594 aa47.96■■■■■ 5.27
C16orf52-201ENST00000331057 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP47.96■■■■■ 5.27
C16orf52-201ENST00000331057 EEA1Q15075 1411 aa47.95■■■■■ 5.27
C16orf52-201ENST00000331057 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP47.93■■■■■ 5.26
C16orf52-201ENST00000331057 IGF1RP08069 1367 aa47.93■■■■■ 5.26
C16orf52-201ENST00000331057 CUL7Q14999 1698 aa47.91■■■■■ 5.26
C16orf52-201ENST00000331057 CHD1O14646 1710 aa47.82■■■■■ 5.25
C16orf52-201ENST00000331057 FHAD1B1AJZ9 1412 aa47.76■■■■■ 5.24
C16orf52-201ENST00000331057 SYNJ2O15056 1496 aa47.75■■■■■ 5.23
C16orf52-201ENST00000331057 CSRNP3Q8WYN3 585 aa47.72■■■■■ 5.23
C16orf52-201ENST00000331057 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa47.69■■■■■ 5.22
C16orf52-201ENST00000331057 FBLN2P98095 1184 aa47.62■■■■■ 5.21
C16orf52-201ENST00000331057 PRXQ9BXM0 1461 aa47.62■■■■■ 5.21
C16orf52-201ENST00000331057 GRIN2AQ12879 1464 aa47.59■■■■■ 5.21
C16orf52-201ENST00000331057 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP47.57■■■■■ 5.21
C16orf52-201ENST00000331057 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa47.55■■■■■ 5.2
C16orf52-201ENST00000331057 KIF21BO75037 1637 aa47.54■■■■■ 5.2
C16orf52-201ENST00000331057 CEP170Q5SW79 1584 aa47.4■■■■■ 5.18
C16orf52-201ENST00000331057 EHMT2Q96KQ7 1210 aa47.36■■■■■ 5.17
C16orf52-201ENST00000331057 NUP160Q12769 1436 aa47.3■■■■■ 5.16
C16orf52-201ENST00000331057 GOLGA3Q08378 1498 aa47.29■■■■■ 5.16
C16orf52-201ENST00000331057 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa47.25■■■■■ 5.15
C16orf52-201ENST00000331057 CLASP1Q7Z460 1538 aa47.19■■■■■ 5.14
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