RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000322060.9

PUS1-201, Transcript of pseudouridylate synthase 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene PUS1, Length 1,206 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS1-201ENST00000322060 NISCHQ9Y2I1 1504 aa46.8■■■■■ 5.08
PUS1-201ENST00000322060 ABCC9O60706 1549 aa42.07■■■■■ 4.33
PUS1-201ENST00000322060 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa42.01■■■■■ 4.32
PUS1-201ENST00000322060 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.06■■■■■ 4
PUS1-201ENST00000322060 NACADO15069 1562 aa39.8■■■■□ 3.96
PUS1-201ENST00000322060 DNAJC5BQ9UF47 199 aa39.62■■■■□ 3.93
PUS1-201ENST00000322060 DCAF8L2P0C7V8 631 aa39.5■■■■□ 3.91
PUS1-201ENST00000322060 MYO15BQ96JP2 1530 aa39.3■■■■□ 3.88
PUS1-201ENST00000322060 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP39.18■■■■□ 3.86
PUS1-201ENST00000322060 UNC13AQ9UPW8 1703 aa39.03■■■■□ 3.84
PUS1-201ENST00000322060 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.87■■■■□ 3.81
PUS1-201ENST00000322060 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP38.75■■■■□ 3.79
PUS1-201ENST00000322060 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa38.73■■■■□ 3.79
PUS1-201ENST00000322060 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa38.45■■■■□ 3.75
PUS1-201ENST00000322060 SCRIBQ14160 1630 aa38.18■■■■□ 3.7
PUS1-201ENST00000322060 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.01■■■■□ 3.67
PUS1-201ENST00000322060 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.95■■■■□ 3.67
PUS1-201ENST00000322060 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP37.93■■■■□ 3.66
PUS1-201ENST00000322060 NCAPD3P42695 1498 aa36.78■■■■□ 3.48
PUS1-201ENST00000322060 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa36.61■■■■□ 3.45
PUS1-201ENST00000322060 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.52■■■■□ 3.44
PUS1-201ENST00000322060 SMARCA2P51531 1590 aa36.49■■■■□ 3.43
PUS1-201ENST00000322060 SMARCA4P51532 1647 aa36.48■■■■□ 3.43
PUS1-201ENST00000322060 HMGXB3Q12766 1538 aa36.44■■■■□ 3.42
PUS1-201ENST00000322060 CUX2O14529 1486 aa36.38■■■■□ 3.41
PUS1-201ENST00000322060 ERCC6Q03468 1493 aa36.34■■■■□ 3.41
PUS1-201ENST00000322060 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP36.34■■■■□ 3.41
PUS1-201ENST00000322060 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.21■■■■□ 3.39
PUS1-201ENST00000322060 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP36.2■■■■□ 3.39
PUS1-201ENST00000322060 NESP48681 1621 aa36.1■■■■□ 3.37
PUS1-201ENST00000322060 MROH2BQ7Z745 1585 aa36.02■■■■□ 3.36
PUS1-201ENST00000322060 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.91■■■■□ 3.34
PUS1-201ENST00000322060 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.76■■■■□ 3.31
PUS1-201ENST00000322060 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.74■■■■□ 3.31
PUS1-201ENST00000322060 CADPSQ9ULU8 1353 aa35.64■■■■□ 3.3
PUS1-201ENST00000322060 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.58■■■■□ 3.29
PUS1-201ENST00000322060 WIZO95785 1651 aa35.54■■■■□ 3.28
PUS1-201ENST00000322060 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.39■■■■□ 3.26
PUS1-201ENST00000322060 WDR62O43379 1518 aa35.3■■■■□ 3.24
PUS1-201ENST00000322060 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP35.29■■■■□ 3.24
PUS1-201ENST00000322060 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.22■■■■□ 3.23
PUS1-201ENST00000322060 CFTRP13569 1480 aa35.21■■■■□ 3.23
PUS1-201ENST00000322060 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.18■■■■□ 3.22
PUS1-201ENST00000322060 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35.14■■■■□ 3.22
PUS1-201ENST00000322060 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.88■■■■□ 3.17
PUS1-201ENST00000322060 CCDC88BA6NC98 1476 aa34.77■■■■□ 3.16
PUS1-201ENST00000322060 OSCARQ8IYS5 282 aa34.75■■■■□ 3.15
PUS1-201ENST00000322060 TRIM41Q8WV44 630 aa34.74■■■■□ 3.15
PUS1-201ENST00000322060 PRDM2Q13029 1718 aa34.71■■■■□ 3.15
PUS1-201ENST00000322060 IFT140Q96RY7 1462 aa34.55■■■■□ 3.12
PUS1-201ENST00000322060 ABCC8Q09428 1581 aa34.5■■■■□ 3.11
PUS1-201ENST00000322060 TOPBP1Q92547 1522 aa34.5■■■■□ 3.11
PUS1-201ENST00000322060 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.45■■■■□ 3.1
PUS1-201ENST00000322060 DNMBPQ6XZF7 1577 aa34.35■■■■□ 3.09
PUS1-201ENST00000322060 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.22■■■■□ 3.07
PUS1-201ENST00000322060 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.19■■■■□ 3.06
PUS1-201ENST00000322060 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34.17■■■■□ 3.06
PUS1-201ENST00000322060 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.17■■■■□ 3.06
PUS1-201ENST00000322060 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.17■■■■□ 3.06
PUS1-201ENST00000322060 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.14■■■■□ 3.069e-7■■■■■ 27.5
PUS1-201ENST00000322060 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.14■■■■□ 3.06
PUS1-201ENST00000322060 ARHGEF11O15085 1522 aa34.09■■■■□ 3.05
PUS1-201ENST00000322060 SOGA1O94964 1423 aa34.03■■■■□ 3.04
PUS1-201ENST00000322060 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.99■■■■□ 3.03
PUS1-201ENST00000322060 CHD1O14646 1710 aa33.94■■■■□ 3.02
PUS1-201ENST00000322060 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.93■■■■□ 3.02
PUS1-201ENST00000322060 FBLN2P98095 1184 aa33.92■■■■□ 3.02
PUS1-201ENST00000322060 WDR97A6NE52 1622 aa33.9■■■■□ 3.02
PUS1-201ENST00000322060 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.89■■■■□ 3.02
PUS1-201ENST00000322060 CYB5RLQ6IPT4 315 aa33.88■■■■□ 3.01
PUS1-201ENST00000322060 CUX1P39880 1505 aa33.85■■■■□ 3.01
PUS1-201ENST00000322060 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa33.77■■■■□ 3
PUS1-201ENST00000322060 ARAP1Q96P48 1450 aa33.75■■■□□ 2.99
PUS1-201ENST00000322060 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP33.75■■■□□ 2.99
PUS1-201ENST00000322060 GRIN2BQ13224 1484 aa33.73■■■□□ 2.99
PUS1-201ENST00000322060 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP33.72■■■□□ 2.99
PUS1-201ENST00000322060 CLASP1Q7Z460 1538 aa33.65■■■□□ 2.98
PUS1-201ENST00000322060 SYNJ2O15056 1496 aa33.63■■■□□ 2.97
PUS1-201ENST00000322060 SYNJ1O43426 1573 aa33.61■■■□□ 2.97
PUS1-201ENST00000322060 GAPVD1Q14C86 1478 aa33.58■■■□□ 2.97
PUS1-201ENST00000322060 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP33.58■■■□□ 2.97
PUS1-201ENST00000322060 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.56■■■□□ 2.96
PUS1-201ENST00000322060 TRHP20396 242 aaPredicted RBP33.5■■■□□ 2.95
PUS1-201ENST00000322060 PBRM1Q86U86 1689 aa33.47■■■□□ 2.95
PUS1-201ENST00000322060 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.46■■■□□ 2.95
PUS1-201ENST00000322060 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.42■■■□□ 2.94
PUS1-201ENST00000322060 TOP2BQ02880 1626 aa33.29■■■□□ 2.92
PUS1-201ENST00000322060 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.28■■■□□ 2.92
PUS1-201ENST00000322060 GRIN2AQ12879 1464 aa33.27■■■□□ 2.92
PUS1-201ENST00000322060 NUP160Q12769 1436 aa33.2■■■□□ 2.91
PUS1-201ENST00000322060 ADAMTS12P58397 1594 aa33.19■■■□□ 2.9
PUS1-201ENST00000322060 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.19■■■□□ 2.9
PUS1-201ENST00000322060 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.13■■■□□ 2.89
PUS1-201ENST00000322060 CEP170Q5SW79 1584 aa33.11■■■□□ 2.89
PUS1-201ENST00000322060 ERCC6L2Q5T890 1561 aa33.06■■■□□ 2.88
PUS1-201ENST00000322060 SHROOM2Q13796 1616 aa33.02■■■□□ 2.88
PUS1-201ENST00000322060 JPH4Q96JJ6 628 aa32.9■■■□□ 2.86
PUS1-201ENST00000322060 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP32.85■■■□□ 2.85
PUS1-201ENST00000322060 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa32.72■■■□□ 2.83
PUS1-201ENST00000322060 IGF1RP08069 1367 aa32.72■■■□□ 2.83
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