RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000314520.4

MKRN3-201, Transcript of makorin ring finger protein 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene MKRN3, Length 2,337 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3-201ENST00000314520 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.81■■■■□ 3
MKRN3-201ENST00000314520 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.62■■■□□ 2.33
MKRN3-201ENST00000314520 ABCC9O60706 1549 aa28.32■■■□□ 2.12
MKRN3-201ENST00000314520 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
MKRN3-201ENST00000314520 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.12■■■□□ 2.09
MKRN3-201ENST00000314520 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27.92■■■□□ 2.06
MKRN3-201ENST00000314520 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.7■■■□□ 2.03
MKRN3-201ENST00000314520 NACADO15069 1562 aa27.66■■■□□ 2.02
MKRN3-201ENST00000314520 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.5■■□□□ 1.99
MKRN3-201ENST00000314520 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.41■■□□□ 1.98
MKRN3-201ENST00000314520 SCRIBQ14160 1630 aa27.22■■□□□ 1.95
MKRN3-201ENST00000314520 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.99■■□□□ 1.91
MKRN3-201ENST00000314520 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.68■■□□□ 1.86
MKRN3-201ENST00000314520 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.66■■□□□ 1.86
MKRN3-201ENST00000314520 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.31■■□□□ 1.8
MKRN3-201ENST00000314520 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
MKRN3-201ENST00000314520 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
MKRN3-201ENST00000314520 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.12■■□□□ 1.77
MKRN3-201ENST00000314520 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
MKRN3-201ENST00000314520 SMARCA4P51532 1647 aa26.06■■□□□ 1.76
MKRN3-201ENST00000314520 WIZO95785 1651 aa25.91■■□□□ 1.74
MKRN3-201ENST00000314520 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
MKRN3-201ENST00000314520 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.73■■□□□ 1.71
MKRN3-201ENST00000314520 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.7■■□□□ 1.7
MKRN3-201ENST00000314520 SMARCA2P51531 1590 aa25.68■■□□□ 1.7
MKRN3-201ENST00000314520 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.61■■□□□ 1.69
MKRN3-201ENST00000314520 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
MKRN3-201ENST00000314520 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
MKRN3-201ENST00000314520 NCAPD3P42695 1498 aa25.52■■□□□ 1.68
MKRN3-201ENST00000314520 HMGXB3Q12766 1538 aa25.45■■□□□ 1.66
MKRN3-201ENST00000314520 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.35■■□□□ 1.65
MKRN3-201ENST00000314520 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.27■■□□□ 1.64
MKRN3-201ENST00000314520 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.93■■□□□ 1.58
MKRN3-201ENST00000314520 CFTRP13569 1480 aa24.88■■□□□ 1.57
MKRN3-201ENST00000314520 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.86■■□□□ 1.57
MKRN3-201ENST00000314520 NESP48681 1621 aa24.76■■□□□ 1.55
MKRN3-201ENST00000314520 PRDM2Q13029 1718 aa24.76■■□□□ 1.55
MKRN3-201ENST00000314520 ABCC8Q09428 1581 aa24.74■■□□□ 1.55
MKRN3-201ENST00000314520 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.72■■□□□ 1.55
MKRN3-201ENST00000314520 TRIM41Q8WV44 630 aa24.68■■□□□ 1.54
MKRN3-201ENST00000314520 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.59■■□□□ 1.53
MKRN3-201ENST00000314520 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.59■■□□□ 1.53
MKRN3-201ENST00000314520 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.54■■□□□ 1.52
MKRN3-201ENST00000314520 SYNJ1O43426 1573 aa24.51■■□□□ 1.51
MKRN3-201ENST00000314520 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.47■■□□□ 1.51
MKRN3-201ENST00000314520 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.46■■□□□ 1.51
MKRN3-201ENST00000314520 CUX1P39880 1505 aa24.43■■□□□ 1.5
MKRN3-201ENST00000314520 TOP2BQ02880 1626 aa24.42■■□□□ 1.5
MKRN3-201ENST00000314520 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.41■■□□□ 1.5
MKRN3-201ENST00000314520 ERCC6Q03468 1493 aa24.31■■□□□ 1.48
MKRN3-201ENST00000314520 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.31■■□□□ 1.48
MKRN3-201ENST00000314520 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
MKRN3-201ENST00000314520 TOPBP1Q92547 1522 aa24.29■■□□□ 1.48
MKRN3-201ENST00000314520 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
MKRN3-201ENST00000314520 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.23■■□□□ 1.47
MKRN3-201ENST00000314520 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.22■■□□□ 1.47
MKRN3-201ENST00000314520 SOGA1O94964 1423 aa24.2■■□□□ 1.47
MKRN3-201ENST00000314520 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.46
MKRN3-201ENST00000314520 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.13■■□□□ 1.45
MKRN3-201ENST00000314520 HRCP23327 699 aa24.13■■□□□ 1.45
MKRN3-201ENST00000314520 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
MKRN3-201ENST00000314520 WDR62O43379 1518 aa24.11■■□□□ 1.45
MKRN3-201ENST00000314520 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.08■■□□□ 1.45
MKRN3-201ENST00000314520 EEA1Q15075 1411 aa24.05■■□□□ 1.44
MKRN3-201ENST00000314520 CUX2O14529 1486 aa24.01■■□□□ 1.43
MKRN3-201ENST00000314520 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24■■□□□ 1.43
MKRN3-201ENST00000314520 CSRNP3Q8WYN3 585 aa24■■□□□ 1.43
MKRN3-201ENST00000314520 KIF27Q86VH2 1401 aa24■■□□□ 1.43
MKRN3-201ENST00000314520 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.99■■□□□ 1.43
MKRN3-201ENST00000314520 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.43
MKRN3-201ENST00000314520 EHMT2Q96KQ7 1210 aa23.94■■□□□ 1.42
MKRN3-201ENST00000314520 WDR97A6NE52 1622 aa23.94■■□□□ 1.42
MKRN3-201ENST00000314520 IFT140Q96RY7 1462 aa23.89■■□□□ 1.41
MKRN3-201ENST00000314520 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
MKRN3-201ENST00000314520 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
MKRN3-201ENST00000314520 IGF1RP08069 1367 aa23.82■■□□□ 1.4
MKRN3-201ENST00000314520 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.82■■□□□ 1.4
MKRN3-201ENST00000314520 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.8■■□□□ 1.4
MKRN3-201ENST00000314520 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.79■■□□□ 1.4
MKRN3-201ENST00000314520 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.78■■□□□ 1.4
MKRN3-201ENST00000314520 KIF21BO75037 1637 aa23.77■■□□□ 1.4
MKRN3-201ENST00000314520 PRXQ9BXM0 1461 aa23.74■■□□□ 1.39
MKRN3-201ENST00000314520 GOLGA3Q08378 1498 aa23.72■■□□□ 1.39
MKRN3-201ENST00000314520 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.72■■□□□ 1.39
MKRN3-201ENST00000314520 PBRM1Q86U86 1689 aa23.7■■□□□ 1.38
MKRN3-201ENST00000314520 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.7■■□□□ 1.38
MKRN3-201ENST00000314520 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.7■■□□□ 1.38
MKRN3-201ENST00000314520 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
MKRN3-201ENST00000314520 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
MKRN3-201ENST00000314520 CUL7Q14999 1698 aa23.66■■□□□ 1.38
MKRN3-201ENST00000314520 GRIN2BQ13224 1484 aa23.65■■□□□ 1.38
MKRN3-201ENST00000314520 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.59■■□□□ 1.37
MKRN3-201ENST00000314520 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.54■■□□□ 1.36
MKRN3-201ENST00000314520 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.53■■□□□ 1.36
MKRN3-201ENST00000314520 ADAMTS12P58397 1594 aa23.52■■□□□ 1.36
MKRN3-201ENST00000314520 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
MKRN3-201ENST00000314520 CEP162Q5TB80 1403 aa23.45■■□□□ 1.34
MKRN3-201ENST00000314520 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
MKRN3-201ENST00000314520 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
MKRN3-201ENST00000314520 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
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