RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000309357.8

AKIP1-202, Transcript of A-kinase interacting protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene AKIP1, Length 1,232 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKIP1-202ENST00000309357 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.7■■■■□ 3.63
AKIP1-202ENST00000309357 ABCC9O60706 1549 aa34.2■■■■□ 3.07
AKIP1-202ENST00000309357 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa33.87■■■■□ 3.01
AKIP1-202ENST00000309357 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.37■■■□□ 2.77
AKIP1-202ENST00000309357 DNAJC5BQ9UF47 199 aa32.24■■■□□ 2.75
AKIP1-202ENST00000309357 NACADO15069 1562 aa32.07■■■□□ 2.72
AKIP1-202ENST00000309357 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.02■■■□□ 2.72
AKIP1-202ENST00000309357 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.83■■■□□ 2.69
AKIP1-202ENST00000309357 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.68■■■□□ 2.66
AKIP1-202ENST00000309357 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.49■■■□□ 2.63
AKIP1-202ENST00000309357 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.46■■■□□ 2.63
AKIP1-202ENST00000309357 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.21■■■□□ 2.59
AKIP1-202ENST00000309357 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.04■■■□□ 2.56
AKIP1-202ENST00000309357 SCRIBQ14160 1630 aa31■■■□□ 2.55
AKIP1-202ENST00000309357 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.9■■■□□ 2.54
AKIP1-202ENST00000309357 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.84■■■□□ 2.53
AKIP1-202ENST00000309357 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.79■■■□□ 2.52
AKIP1-202ENST00000309357 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.71■■■□□ 2.51
AKIP1-202ENST00000309357 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.66■■■□□ 2.34
AKIP1-202ENST00000309357 NCAPD3P42695 1498 aa29.6■■■□□ 2.33
AKIP1-202ENST00000309357 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.55■■■□□ 2.32
AKIP1-202ENST00000309357 ERCC6Q03468 1493 aa29.54■■■□□ 2.32
AKIP1-202ENST00000309357 SMARCA4P51532 1647 aa29.47■■■□□ 2.31
AKIP1-202ENST00000309357 CUX2O14529 1486 aa29.46■■■□□ 2.31
AKIP1-202ENST00000309357 SMARCA2P51531 1590 aa29.42■■■□□ 2.3
AKIP1-202ENST00000309357 HMGXB3Q12766 1538 aa29.39■■■□□ 2.3
AKIP1-202ENST00000309357 NESP48681 1621 aa29.33■■■□□ 2.29
AKIP1-202ENST00000309357 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.27■■■□□ 2.28
AKIP1-202ENST00000309357 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.27■■■□□ 2.28
AKIP1-202ENST00000309357 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.12■■■□□ 2.25
AKIP1-202ENST00000309357 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.09■■■□□ 2.25
AKIP1-202ENST00000309357 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
AKIP1-202ENST00000309357 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.99■■■□□ 2.23
AKIP1-202ENST00000309357 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.92■■■□□ 2.22
AKIP1-202ENST00000309357 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.84■■■□□ 2.21
AKIP1-202ENST00000309357 WIZO95785 1651 aa28.75■■■□□ 2.19
AKIP1-202ENST00000309357 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.73■■■□□ 2.19
AKIP1-202ENST00000309357 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.64■■■□□ 2.17
AKIP1-202ENST00000309357 WDR62O43379 1518 aa28.55■■■□□ 2.16
AKIP1-202ENST00000309357 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.49■■■□□ 2.15
AKIP1-202ENST00000309357 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.45■■■□□ 2.14
AKIP1-202ENST00000309357 TRIM41Q8WV44 630 aa28.43■■■□□ 2.14
AKIP1-202ENST00000309357 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.14
AKIP1-202ENST00000309357 CFTRP13569 1480 aa28.35■■■□□ 2.13
AKIP1-202ENST00000309357 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
AKIP1-202ENST00000309357 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
AKIP1-202ENST00000309357 OSCARQ8IYS5 282 aa28.08■■■□□ 2.09
AKIP1-202ENST00000309357 PRDM2Q13029 1718 aa28.06■■■□□ 2.08
AKIP1-202ENST00000309357 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.02■■■□□ 2.08
AKIP1-202ENST00000309357 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.95■■■□□ 2.06
AKIP1-202ENST00000309357 IFT140Q96RY7 1462 aa27.9■■■□□ 2.06
AKIP1-202ENST00000309357 TOPBP1Q92547 1522 aa27.88■■■□□ 2.05
AKIP1-202ENST00000309357 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.81■■■□□ 2.04
AKIP1-202ENST00000309357 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.81■■■□□ 2.04
AKIP1-202ENST00000309357 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.81■■■□□ 2.04
AKIP1-202ENST00000309357 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
AKIP1-202ENST00000309357 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.75■■■□□ 2.03
AKIP1-202ENST00000309357 ABCC8Q09428 1581 aa27.71■■■□□ 2.03
AKIP1-202ENST00000309357 ARHGEF11O15085 1522 aa27.69■■■□□ 2.02
AKIP1-202ENST00000309357 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.66■■■□□ 2.02
AKIP1-202ENST00000309357 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.63■■■□□ 2.01
AKIP1-202ENST00000309357 CHD1O14646 1710 aa27.6■■■□□ 2.01
AKIP1-202ENST00000309357 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.59■■■□□ 2.01
AKIP1-202ENST00000309357 FBLN2P98095 1184 aa27.55■■■□□ 2
AKIP1-202ENST00000309357 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.53■■■□□ 2
AKIP1-202ENST00000309357 CYB5RLQ6IPT4 315 aa27.51■■□□□ 1.99
AKIP1-202ENST00000309357 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.46■■□□□ 1.99
AKIP1-202ENST00000309357 SOGA1O94964 1423 aa27.44■■□□□ 1.98
AKIP1-202ENST00000309357 ARAP1Q96P48 1450 aa27.43■■□□□ 1.98
AKIP1-202ENST00000309357 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.4■■□□□ 1.98
AKIP1-202ENST00000309357 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.38■■□□□ 1.97
AKIP1-202ENST00000309357 CUX1P39880 1505 aa27.35■■□□□ 1.97
AKIP1-202ENST00000309357 TRHP20396 242 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
AKIP1-202ENST00000309357 WDR97A6NE52 1622 aa27.26■■□□□ 1.95
AKIP1-202ENST00000309357 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
AKIP1-202ENST00000309357 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.25■■□□□ 1.95
AKIP1-202ENST00000309357 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.23■■□□□ 1.95
AKIP1-202ENST00000309357 GRIN2BQ13224 1484 aa27.22■■□□□ 1.95
AKIP1-202ENST00000309357 SYNJ1O43426 1573 aa27.21■■□□□ 1.95
AKIP1-202ENST00000309357 SYNJ2O15056 1496 aa27.15■■□□□ 1.94
AKIP1-202ENST00000309357 PBRM1Q86U86 1689 aa27.14■■□□□ 1.93
AKIP1-202ENST00000309357 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.11■■□□□ 1.93
AKIP1-202ENST00000309357 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
AKIP1-202ENST00000309357 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.03■■□□□ 1.92
AKIP1-202ENST00000309357 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.03■■□□□ 1.92
AKIP1-202ENST00000309357 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.9■■□□□ 1.9
AKIP1-202ENST00000309357 GRIN2AQ12879 1464 aa26.89■■□□□ 1.9
AKIP1-202ENST00000309357 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.88■■□□□ 1.89
AKIP1-202ENST00000309357 ADAMTS12P58397 1594 aa26.87■■□□□ 1.89
AKIP1-202ENST00000309357 CEP170Q5SW79 1584 aa26.83■■□□□ 1.89
AKIP1-202ENST00000309357 TOP2BQ02880 1626 aa26.81■■□□□ 1.88
AKIP1-202ENST00000309357 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.81■■□□□ 1.88
AKIP1-202ENST00000309357 NUP160Q12769 1436 aa26.78■■□□□ 1.88
AKIP1-202ENST00000309357 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.74■■□□□ 1.87
AKIP1-202ENST00000309357 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.68■■□□□ 1.86
AKIP1-202ENST00000309357 SHROOM2Q13796 1616 aa26.68■■□□□ 1.86
AKIP1-202ENST00000309357 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
AKIP1-202ENST00000309357 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
AKIP1-202ENST00000309357 JPH4Q96JJ6 628 aa26.51■■□□□ 1.83
AKIP1-202ENST00000309357 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.7 ms