RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300823.10

ZNF226-201, Transcript of zinc finger protein 226, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF226, Length 817 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF226-201ENST00000300823 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.23■■■□□ 2.91
ZNF226-201ENST00000300823 ABCC9O60706 1549 aa30.11■■■□□ 2.41
ZNF226-201ENST00000300823 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.74■■■□□ 2.35
ZNF226-201ENST00000300823 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.44■■■□□ 2.14
ZNF226-201ENST00000300823 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.43■■■□□ 2.14
ZNF226-201ENST00000300823 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.3■■■□□ 2.12
ZNF226-201ENST00000300823 NACADO15069 1562 aa28.19■■■□□ 2.1
ZNF226-201ENST00000300823 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.09■■■□□ 2.09
ZNF226-201ENST00000300823 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.84■■■□□ 2.05
ZNF226-201ENST00000300823 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.7■■■□□ 2.03
ZNF226-201ENST00000300823 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.67■■■□□ 2.02
ZNF226-201ENST00000300823 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.51■■□□□ 1.99
ZNF226-201ENST00000300823 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27.31■■□□□ 1.96
ZNF226-201ENST00000300823 SCRIBQ14160 1630 aa27.3■■□□□ 1.96
ZNF226-201ENST00000300823 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.11■■□□□ 1.93
ZNF226-201ENST00000300823 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.1■■□□□ 1.93
ZNF226-201ENST00000300823 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.07■■□□□ 1.92
ZNF226-201ENST00000300823 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
ZNF226-201ENST00000300823 NCAPD3P42695 1498 aa26.07■■□□□ 1.76
ZNF226-201ENST00000300823 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa26.06■■□□□ 1.76
ZNF226-201ENST00000300823 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
ZNF226-201ENST00000300823 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.03■■□□□ 1.76
ZNF226-201ENST00000300823 SMARCA4P51532 1647 aa25.94■■□□□ 1.74
ZNF226-201ENST00000300823 ERCC6Q03468 1493 aa25.93■■□□□ 1.74
ZNF226-201ENST00000300823 SMARCA2P51531 1590 aa25.86■■□□□ 1.73
ZNF226-201ENST00000300823 NESP48681 1621 aa25.85■■□□□ 1.73
ZNF226-201ENST00000300823 CUX2O14529 1486 aa25.83■■□□□ 1.73
ZNF226-201ENST00000300823 HMGXB3Q12766 1538 aa25.82■■□□□ 1.72
ZNF226-201ENST00000300823 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
ZNF226-201ENST00000300823 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
ZNF226-201ENST00000300823 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.68■■□□□ 1.7
ZNF226-201ENST00000300823 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.62■■□□□ 1.69
ZNF226-201ENST00000300823 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.61■■□□□ 1.69
ZNF226-201ENST00000300823 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
ZNF226-201ENST00000300823 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.46■■□□□ 1.67
ZNF226-201ENST00000300823 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.42■■□□□ 1.66
ZNF226-201ENST00000300823 WIZO95785 1651 aa25.36■■□□□ 1.65
ZNF226-201ENST00000300823 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.35■■□□□ 1.65
ZNF226-201ENST00000300823 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.31■■□□□ 1.64
ZNF226-201ENST00000300823 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.17■■□□□ 1.62
ZNF226-201ENST00000300823 WDR62O43379 1518 aa25.09■■□□□ 1.61
ZNF226-201ENST00000300823 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
ZNF226-201ENST00000300823 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.05■■□□□ 1.6
ZNF226-201ENST00000300823 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.04■■□□□ 1.6
ZNF226-201ENST00000300823 TRIM41Q8WV44 630 aa25■■□□□ 1.59
ZNF226-201ENST00000300823 CFTRP13569 1480 aa24.97■■□□□ 1.59
ZNF226-201ENST00000300823 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
ZNF226-201ENST00000300823 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
ZNF226-201ENST00000300823 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.75■■□□□ 1.55
ZNF226-201ENST00000300823 OSCARQ8IYS5 282 aa24.71■■□□□ 1.55
ZNF226-201ENST00000300823 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
ZNF226-201ENST00000300823 PRDM2Q13029 1718 aa24.61■■□□□ 1.53
ZNF226-201ENST00000300823 TOPBP1Q92547 1522 aa24.56■■□□□ 1.52
ZNF226-201ENST00000300823 IFT140Q96RY7 1462 aa24.53■■□□□ 1.52
ZNF226-201ENST00000300823 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.42■■□□□ 1.5
ZNF226-201ENST00000300823 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.42■■□□□ 1.5
ZNF226-201ENST00000300823 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.42■■□□□ 1.5
ZNF226-201ENST00000300823 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
ZNF226-201ENST00000300823 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.4■■□□□ 1.5
ZNF226-201ENST00000300823 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.39■■□□□ 1.54e-8■■■■■ 52.2
ZNF226-201ENST00000300823 ABCC8Q09428 1581 aa24.36■■□□□ 1.49
ZNF226-201ENST00000300823 ARHGEF11O15085 1522 aa24.33■■□□□ 1.49
ZNF226-201ENST00000300823 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
ZNF226-201ENST00000300823 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
ZNF226-201ENST00000300823 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.3■■□□□ 1.48
ZNF226-201ENST00000300823 FBLN2P98095 1184 aa24.29■■□□□ 1.48
ZNF226-201ENST00000300823 CHD1O14646 1710 aa24.24■■□□□ 1.47
ZNF226-201ENST00000300823 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.24■■□□□ 1.47
ZNF226-201ENST00000300823 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
ZNF226-201ENST00000300823 SOGA1O94964 1423 aa24.19■■□□□ 1.46
ZNF226-201ENST00000300823 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.14■■□□□ 1.46
ZNF226-201ENST00000300823 CUX1P39880 1505 aa24.12■■□□□ 1.45
ZNF226-201ENST00000300823 ARAP1Q96P48 1450 aa24.11■■□□□ 1.45
ZNF226-201ENST00000300823 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.1■■□□□ 1.45
ZNF226-201ENST00000300823 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
ZNF226-201ENST00000300823 TRHP20396 242 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
ZNF226-201ENST00000300823 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
ZNF226-201ENST00000300823 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.95■■□□□ 1.43
ZNF226-201ENST00000300823 GRIN2BQ13224 1484 aa23.95■■□□□ 1.42
ZNF226-201ENST00000300823 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
ZNF226-201ENST00000300823 WDR97A6NE52 1622 aa23.91■■□□□ 1.42
ZNF226-201ENST00000300823 SYNJ2O15056 1496 aa23.88■■□□□ 1.41
ZNF226-201ENST00000300823 SYNJ1O43426 1573 aa23.88■■□□□ 1.41
ZNF226-201ENST00000300823 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.87■■□□□ 1.41
ZNF226-201ENST00000300823 PBRM1Q86U86 1689 aa23.84■■□□□ 1.41
ZNF226-201ENST00000300823 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.8■■□□□ 1.4
ZNF226-201ENST00000300823 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.78■■□□□ 1.4
ZNF226-201ENST00000300823 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.69■■□□□ 1.38
ZNF226-201ENST00000300823 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.69■■□□□ 1.38
ZNF226-201ENST00000300823 GRIN2AQ12879 1464 aa23.67■■□□□ 1.38
ZNF226-201ENST00000300823 ADAMTS12P58397 1594 aa23.63■■□□□ 1.37
ZNF226-201ENST00000300823 CEP170Q5SW79 1584 aa23.62■■□□□ 1.37
ZNF226-201ENST00000300823 TOP2BQ02880 1626 aa23.62■■□□□ 1.37
ZNF226-201ENST00000300823 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.61■■□□□ 1.37
ZNF226-201ENST00000300823 NUP160Q12769 1436 aa23.57■■□□□ 1.36
ZNF226-201ENST00000300823 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.55■■□□□ 1.36
ZNF226-201ENST00000300823 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.47■■□□□ 1.35
ZNF226-201ENST00000300823 SHROOM2Q13796 1616 aa23.45■■□□□ 1.34
ZNF226-201ENST00000300823 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
ZNF226-201ENST00000300823 JPH4Q96JJ6 628 aa23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.3 ms