RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299694.12

BEAN1-201, Transcript of brain expressed associated with NEDD4 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene BEAN1, Length 2,160 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEAN1-201ENST00000299694 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.06■■■□□ 2.88
BEAN1-201ENST00000299694 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.87■■■□□ 2.21
BEAN1-201ENST00000299694 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.72■■■□□ 2.03
BEAN1-201ENST00000299694 ABCC9O60706 1549 aa27.54■■■□□ 2
BEAN1-201ENST00000299694 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.46■■□□□ 1.99
BEAN1-201ENST00000299694 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27.27■■□□□ 1.96
BEAN1-201ENST00000299694 MYO15BQ96JP2 1530 aa27■■□□□ 1.91
BEAN1-201ENST00000299694 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.95■■□□□ 1.91
BEAN1-201ENST00000299694 NACADO15069 1562 aa26.93■■□□□ 1.9
BEAN1-201ENST00000299694 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.76■■□□□ 1.87
BEAN1-201ENST00000299694 SCRIBQ14160 1630 aa26.61■■□□□ 1.85
BEAN1-201ENST00000299694 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.3■■□□□ 1.8
BEAN1-201ENST00000299694 BICRAQ9NZM4 1560 aa26■■□□□ 1.75
BEAN1-201ENST00000299694 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.97■■□□□ 1.75
BEAN1-201ENST00000299694 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
BEAN1-201ENST00000299694 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.76■■□□□ 1.71
BEAN1-201ENST00000299694 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
BEAN1-201ENST00000299694 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.57■■□□□ 1.68
BEAN1-201ENST00000299694 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
BEAN1-201ENST00000299694 SMARCA4P51532 1647 aa25.46■■□□□ 1.67
BEAN1-201ENST00000299694 WIZO95785 1651 aa25.38■■□□□ 1.65
BEAN1-201ENST00000299694 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
BEAN1-201ENST00000299694 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.11■■□□□ 1.61
BEAN1-201ENST00000299694 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.08■■□□□ 1.61
BEAN1-201ENST00000299694 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
BEAN1-201ENST00000299694 SMARCA2P51531 1590 aa25.03■■□□□ 1.6
BEAN1-201ENST00000299694 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
BEAN1-201ENST00000299694 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.91■■□□□ 1.58
BEAN1-201ENST00000299694 NCAPD3P42695 1498 aa24.86■■□□□ 1.57
BEAN1-201ENST00000299694 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.82■■□□□ 1.56
BEAN1-201ENST00000299694 HMGXB3Q12766 1538 aa24.8■■□□□ 1.56
BEAN1-201ENST00000299694 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.61■■□□□ 1.53
BEAN1-201ENST00000299694 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.49■■□□□ 1.51
BEAN1-201ENST00000299694 CFTRP13569 1480 aa24.28■■□□□ 1.48
BEAN1-201ENST00000299694 ABCC8Q09428 1581 aa24.28■■□□□ 1.48
BEAN1-201ENST00000299694 TRIM41Q8WV44 630 aa24.26■■□□□ 1.47
BEAN1-201ENST00000299694 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.24■■□□□ 1.47
BEAN1-201ENST00000299694 PRDM2Q13029 1718 aa24.16■■□□□ 1.46
BEAN1-201ENST00000299694 NESP48681 1621 aa24.15■■□□□ 1.46
BEAN1-201ENST00000299694 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.09■■□□□ 1.45
BEAN1-201ENST00000299694 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.05■■□□□ 1.44
BEAN1-201ENST00000299694 SYNJ1O43426 1573 aa24.03■■□□□ 1.44
BEAN1-201ENST00000299694 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.98■■□□□ 1.43
BEAN1-201ENST00000299694 CUX1P39880 1505 aa23.91■■□□□ 1.42
BEAN1-201ENST00000299694 TOP2BQ02880 1626 aa23.91■■□□□ 1.42
BEAN1-201ENST00000299694 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.89■■□□□ 1.41
BEAN1-201ENST00000299694 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
BEAN1-201ENST00000299694 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.87■■□□□ 1.41
BEAN1-201ENST00000299694 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.84■■□□□ 1.41
BEAN1-201ENST00000299694 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.84■■□□□ 1.41
BEAN1-201ENST00000299694 SOGA1O94964 1423 aa23.78■■□□□ 1.4
BEAN1-201ENST00000299694 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.73■■□□□ 1.39
BEAN1-201ENST00000299694 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.72■■□□□ 1.39
BEAN1-201ENST00000299694 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.72■■□□□ 1.39
BEAN1-201ENST00000299694 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
BEAN1-201ENST00000299694 TOPBP1Q92547 1522 aa23.71■■□□□ 1.39
BEAN1-201ENST00000299694 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.67■■□□□ 1.38
BEAN1-201ENST00000299694 HRCP23327 699 aa23.67■■□□□ 1.38
BEAN1-201ENST00000299694 ERCC6Q03468 1493 aa23.61■■□□□ 1.37
BEAN1-201ENST00000299694 EHMT2Q96KQ7 1210 aa23.6■■□□□ 1.37
BEAN1-201ENST00000299694 EEA1Q15075 1411 aa23.6■■□□□ 1.37
BEAN1-201ENST00000299694 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
BEAN1-201ENST00000299694 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.58■■□□□ 1.37
BEAN1-201ENST00000299694 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.55■■□□□ 1.36
BEAN1-201ENST00000299694 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.54■■□□□ 1.36
BEAN1-201ENST00000299694 CUX2O14529 1486 aa23.49■■□□□ 1.35
BEAN1-201ENST00000299694 KIF27Q86VH2 1401 aa23.48■■□□□ 1.35
BEAN1-201ENST00000299694 WDR62O43379 1518 aa23.46■■□□□ 1.35
BEAN1-201ENST00000299694 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
BEAN1-201ENST00000299694 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.43■■□□□ 1.34
BEAN1-201ENST00000299694 WDR97A6NE52 1622 aa23.39■■□□□ 1.34
BEAN1-201ENST00000299694 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
BEAN1-201ENST00000299694 KIF21BO75037 1637 aa23.34■■□□□ 1.33
BEAN1-201ENST00000299694 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
BEAN1-201ENST00000299694 IGF1RP08069 1367 aa23.32■■□□□ 1.32
BEAN1-201ENST00000299694 GOLGA3Q08378 1498 aa23.31■■□□□ 1.32
BEAN1-201ENST00000299694 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.29■■□□□ 1.32
BEAN1-201ENST00000299694 PRXQ9BXM0 1461 aa23.28■■□□□ 1.32
BEAN1-201ENST00000299694 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
BEAN1-201ENST00000299694 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.26■■□□□ 1.31
BEAN1-201ENST00000299694 IFT140Q96RY7 1462 aa23.26■■□□□ 1.31
BEAN1-201ENST00000299694 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.23■■□□□ 1.31
BEAN1-201ENST00000299694 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
BEAN1-201ENST00000299694 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.2■■□□□ 1.3
BEAN1-201ENST00000299694 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.2■■□□□ 1.3
BEAN1-201ENST00000299694 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.2■■□□□ 1.3
BEAN1-201ENST00000299694 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.19■■□□□ 1.3
BEAN1-201ENST00000299694 PBRM1Q86U86 1689 aa23.14■■□□□ 1.29
BEAN1-201ENST00000299694 PCGF6Q9BYE7 350 aa23.13■■□□□ 1.29
BEAN1-201ENST00000299694 CUL7Q14999 1698 aa23.12■■□□□ 1.29
BEAN1-201ENST00000299694 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
BEAN1-201ENST00000299694 CEP162Q5TB80 1403 aa23.09■■□□□ 1.29
BEAN1-201ENST00000299694 GRIN2BQ13224 1484 aa23.07■■□□□ 1.28
BEAN1-201ENST00000299694 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
BEAN1-201ENST00000299694 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
BEAN1-201ENST00000299694 ADAMTS12P58397 1594 aa22.97■■□□□ 1.27
BEAN1-201ENST00000299694 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.96■■□□□ 1.27
BEAN1-201ENST00000299694 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.96■■□□□ 1.27
BEAN1-201ENST00000299694 CLIP1P30622 1438 aa22.95■■□□□ 1.26
BEAN1-201ENST00000299694 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.4 ms