RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293889.10

CCDC78-201, Transcript of coiled-coil domain containing 78, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC78, Length 1,611 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78-201ENST00000293889 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.75■■■■■ 4.27
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CCDC78-201ENST00000293889 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.65■■■■□ 3.14
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CCDC78-201ENST00000293889 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.54■■■■□ 3.12
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CCDC78-201ENST00000293889 SCRIBQ14160 1630 aa33.81■■■■□ 3
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CCDC78-201ENST00000293889 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.53■■■□□ 2.8
CCDC78-201ENST00000293889 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.52■■■□□ 2.8
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CCDC78-201ENST00000293889 SMARCA2P51531 1590 aa32.04■■■□□ 2.72
CCDC78-201ENST00000293889 PEG3Q9GZU2 1588 aa32.03■■■□□ 2.72
CCDC78-201ENST00000293889 NCAPD3P42695 1498 aa31.99■■■□□ 2.71
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CCDC78-201ENST00000293889 CFTRP13569 1480 aa30.97■■■□□ 2.55
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CCDC78-201ENST00000293889 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.88■■■□□ 2.53
CCDC78-201ENST00000293889 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.85■■■□□ 2.53
CCDC78-201ENST00000293889 PRDM2Q13029 1718 aa30.85■■■□□ 2.53
CCDC78-201ENST00000293889 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.74■■■□□ 2.51
CCDC78-201ENST00000293889 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.67■■■□□ 2.5
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CCDC78-201ENST00000293889 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.55■■■□□ 2.48
CCDC78-201ENST00000293889 WDR62O43379 1518 aa30.46■■■□□ 2.47
CCDC78-201ENST00000293889 CUX2O14529 1486 aa30.45■■■□□ 2.46
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CCDC78-201ENST00000293889 TOPBP1Q92547 1522 aa30.29■■■□□ 2.44
CCDC78-201ENST00000293889 ABCC8Q09428 1581 aa30.28■■■□□ 2.44
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CCDC78-201ENST00000293889 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.22■■■□□ 2.43
CCDC78-201ENST00000293889 CUX1P39880 1505 aa30.2■■■□□ 2.43
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CCDC78-201ENST00000293889 WDR97A6NE52 1622 aa29.83■■■□□ 2.37
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CCDC78-201ENST00000293889 KIF27Q86VH2 1401 aa29.49■■■□□ 2.31
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CCDC78-201ENST00000293889 KIF21BO75037 1637 aa29.06■■■□□ 2.24
CCDC78-201ENST00000293889 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.06■■■□□ 2.24
CCDC78-201ENST00000293889 CEP170Q5SW79 1584 aa29.05■■■□□ 2.24
CCDC78-201ENST00000293889 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.03■■■□□ 2.24
CCDC78-201ENST00000293889 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.03■■■□□ 2.24
CCDC78-201ENST00000293889 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa29.03■■■□□ 2.24
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