RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000274606.7

NHP2-201, Transcript of NHP2 ribonucleoprotein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NHP2, Length 865 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHP2-201ENST00000274606 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.61■■■□□ 2.49
NHP2-201ENST00000274606 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.3■■□□□ 1.96
NHP2-201ENST00000274606 ABCC9O60706 1549 aa26.75■■□□□ 1.87
NHP2-201ENST00000274606 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.7■■□□□ 1.71
NHP2-201ENST00000274606 NACADO15069 1562 aa25.63■■□□□ 1.69
NHP2-201ENST00000274606 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.61■■□□□ 1.69
NHP2-201ENST00000274606 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
NHP2-201ENST00000274606 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.41■■□□□ 1.66
NHP2-201ENST00000274606 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.3■■□□□ 1.64
NHP2-201ENST00000274606 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.14■■□□□ 1.61
NHP2-201ENST00000274606 SCRIBQ14160 1630 aa24.94■■□□□ 1.58
NHP2-201ENST00000274606 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.94■■□□□ 1.58
NHP2-201ENST00000274606 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.89■■□□□ 1.58
NHP2-201ENST00000274606 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.64■■□□□ 1.53
NHP2-201ENST00000274606 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.47■■□□□ 1.51
NHP2-201ENST00000274606 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
NHP2-201ENST00000274606 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.19■■□□□ 1.46
NHP2-201ENST00000274606 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.03■■□□□ 1.44
NHP2-201ENST00000274606 SMARCA4P51532 1647 aa23.81■■□□□ 1.4
NHP2-201ENST00000274606 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
NHP2-201ENST00000274606 SMARCA2P51531 1590 aa23.65■■□□□ 1.38
NHP2-201ENST00000274606 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.64■■□□□ 1.38
NHP2-201ENST00000274606 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.61■■□□□ 1.37
NHP2-201ENST00000274606 NCAPD3P42695 1498 aa23.6■■□□□ 1.37
NHP2-201ENST00000274606 HMGXB3Q12766 1538 aa23.55■■□□□ 1.36
NHP2-201ENST00000274606 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.52■■□□□ 1.36
NHP2-201ENST00000274606 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
NHP2-201ENST00000274606 WIZO95785 1651 aa23.38■■□□□ 1.33
NHP2-201ENST00000274606 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
NHP2-201ENST00000274606 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
NHP2-201ENST00000274606 NESP48681 1621 aa23.12■■□□□ 1.29
NHP2-201ENST00000274606 ERCC6Q03468 1493 aa23.1■■□□□ 1.29
NHP2-201ENST00000274606 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.05■■□□□ 1.28
NHP2-201ENST00000274606 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.92■■□□□ 1.26
NHP2-201ENST00000274606 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.9■■□□□ 1.26
NHP2-201ENST00000274606 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.88■■□□□ 1.25
NHP2-201ENST00000274606 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
NHP2-201ENST00000274606 CUX2O14529 1486 aa22.81■■□□□ 1.24
NHP2-201ENST00000274606 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.8■■□□□ 1.24
NHP2-201ENST00000274606 CFTRP13569 1480 aa22.79■■□□□ 1.24
NHP2-201ENST00000274606 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.72■■□□□ 1.23
NHP2-201ENST00000274606 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.72■■□□□ 1.23
NHP2-201ENST00000274606 PRDM2Q13029 1718 aa22.71■■□□□ 1.23
NHP2-201ENST00000274606 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
NHP2-201ENST00000274606 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.68■■□□□ 1.22
NHP2-201ENST00000274606 WDR62O43379 1518 aa22.6■■□□□ 1.21
NHP2-201ENST00000274606 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
NHP2-201ENST00000274606 TOPBP1Q92547 1522 aa22.35■■□□□ 1.17
NHP2-201ENST00000274606 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.33■■□□□ 1.17
NHP2-201ENST00000274606 ABCC8Q09428 1581 aa22.3■■□□□ 1.16
NHP2-201ENST00000274606 IFT140Q96RY7 1462 aa22.22■■□□□ 1.15
NHP2-201ENST00000274606 CUX1P39880 1505 aa22.16■■□□□ 1.14
NHP2-201ENST00000274606 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
NHP2-201ENST00000274606 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
NHP2-201ENST00000274606 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.11■■□□□ 1.13
NHP2-201ENST00000274606 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
NHP2-201ENST00000274606 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa22.09■■□□□ 1.13
NHP2-201ENST00000274606 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
NHP2-201ENST00000274606 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.05■■□□□ 1.12
NHP2-201ENST00000274606 SOGA1O94964 1423 aa22.03■■□□□ 1.12
NHP2-201ENST00000274606 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.99■■□□□ 1.11
NHP2-201ENST00000274606 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.97■■□□□ 1.117e-6■■□□□ 13.1
NHP2-201ENST00000274606 SYNJ1O43426 1573 aa21.97■■□□□ 1.11
NHP2-201ENST00000274606 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.97■■□□□ 1.11
NHP2-201ENST00000274606 TOP2BQ02880 1626 aa21.96■■□□□ 1.11
NHP2-201ENST00000274606 WDR97A6NE52 1622 aa21.95■■□□□ 1.1
NHP2-201ENST00000274606 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
NHP2-201ENST00000274606 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.86■■□□□ 1.09
NHP2-201ENST00000274606 PBRM1Q86U86 1689 aa21.83■■□□□ 1.09
NHP2-201ENST00000274606 CHD1O14646 1710 aa21.83■■□□□ 1.08
NHP2-201ENST00000274606 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.82■■□□□ 1.08
NHP2-201ENST00000274606 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.82■■□□□ 1.08
NHP2-201ENST00000274606 GRIN2BQ13224 1484 aa21.81■■□□□ 1.08
NHP2-201ENST00000274606 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.8■■□□□ 1.08
NHP2-201ENST00000274606 OSCARQ8IYS5 282 aa21.8■■□□□ 1.08
NHP2-201ENST00000274606 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.07
NHP2-201ENST00000274606 FBLN2P98095 1184 aa21.75■■□□□ 1.07
NHP2-201ENST00000274606 SYNJ2O15056 1496 aa21.67■■□□□ 1.06
NHP2-201ENST00000274606 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
NHP2-201ENST00000274606 ADAMTS12P58397 1594 aa21.64■■□□□ 1.05
NHP2-201ENST00000274606 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.6■■□□□ 1.05
NHP2-201ENST00000274606 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa21.55■■□□□ 1.04
NHP2-201ENST00000274606 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa21.55■■□□□ 1.04
NHP2-201ENST00000274606 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa21.55■■□□□ 1.04
NHP2-201ENST00000274606 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.54■■□□□ 1.04
NHP2-201ENST00000274606 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.54■■□□□ 1.04
NHP2-201ENST00000274606 KIF27Q86VH2 1401 aa21.54■■□□□ 1.04
NHP2-201ENST00000274606 GRIN2AQ12879 1464 aa21.53■■□□□ 1.04
NHP2-201ENST00000274606 ARHGEF11O15085 1522 aa21.53■■□□□ 1.04
NHP2-201ENST00000274606 TRIM41Q8WV44 630 aa21.46■■□□□ 1.03
NHP2-201ENST00000274606 CUL7Q14999 1698 aa21.45■■□□□ 1.02
NHP2-201ENST00000274606 CEP170Q5SW79 1584 aa21.44■■□□□ 1.02
NHP2-201ENST00000274606 NUP160Q12769 1436 aa21.41■■□□□ 1.02
NHP2-201ENST00000274606 IGF1RP08069 1367 aa21.38■■□□□ 1.01
NHP2-201ENST00000274606 ARAP1Q96P48 1450 aa21.35■■□□□ 1.01
NHP2-201ENST00000274606 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.32■■□□□ 1
NHP2-201ENST00000274606 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.3■■□□□ 1
NHP2-201ENST00000274606 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.28■■□□□ 1
NHP2-201ENST00000274606 SHROOM2Q13796 1616 aa21.28■■□□□ 1
NHP2-201ENST00000274606 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.24■□□□□ 0.99
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