RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262033.10

PTGES3-201, Transcript of prostaglandin E synthase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTGES3, Length 1,920 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGES3-201ENST00000262033 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.91■■■■□ 3.66
PTGES3-201ENST00000262033 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa32.93■■■□□ 2.86
PTGES3-201ENST00000262033 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.85■■■□□ 2.69
PTGES3-201ENST00000262033 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.35■■■□□ 2.61
PTGES3-201ENST00000262033 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.33■■■□□ 2.61
PTGES3-201ENST00000262033 ABCC9O60706 1549 aa31.09■■■□□ 2.57
PTGES3-201ENST00000262033 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.01■■■□□ 2.55
PTGES3-201ENST00000262033 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.94■■■□□ 2.54
PTGES3-201ENST00000262033 NACADO15069 1562 aa30.7■■■□□ 2.51
PTGES3-201ENST00000262033 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.39■■■□□ 2.46
PTGES3-201ENST00000262033 SCRIBQ14160 1630 aa30.31■■■□□ 2.44
PTGES3-201ENST00000262033 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
PTGES3-201ENST00000262033 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.74■■■□□ 2.35
PTGES3-201ENST00000262033 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.49■■■□□ 2.31
PTGES3-201ENST00000262033 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
PTGES3-201ENST00000262033 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.46■■■□□ 2.31
PTGES3-201ENST00000262033 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.41■■■□□ 2.3
PTGES3-201ENST00000262033 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.29■■■□□ 2.28
PTGES3-201ENST00000262033 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
PTGES3-201ENST00000262033 SMARCA4P51532 1647 aa29.08■■■□□ 2.25
PTGES3-201ENST00000262033 WIZO95785 1651 aa29.03■■■□□ 2.24
PTGES3-201ENST00000262033 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.74■■■□□ 2.19
PTGES3-201ENST00000262033 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.74■■■□□ 2.19
PTGES3-201ENST00000262033 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
PTGES3-201ENST00000262033 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.63■■■□□ 2.17
PTGES3-201ENST00000262033 SMARCA2P51531 1590 aa28.58■■■□□ 2.17
PTGES3-201ENST00000262033 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
PTGES3-201ENST00000262033 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.49■■■□□ 2.15
PTGES3-201ENST00000262033 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
PTGES3-201ENST00000262033 NCAPD3P42695 1498 aa28.38■■■□□ 2.13
PTGES3-201ENST00000262033 HMGXB3Q12766 1538 aa28.29■■■□□ 2.12
PTGES3-201ENST00000262033 TRIM41Q8WV44 630 aa28.14■■■□□ 2.1
PTGES3-201ENST00000262033 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.13■■■□□ 2.09
PTGES3-201ENST00000262033 ABCC8Q09428 1581 aa27.88■■■□□ 2.05
PTGES3-201ENST00000262033 CFTRP13569 1480 aa27.77■■■□□ 2.04
PTGES3-201ENST00000262033 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.73■■■□□ 2.03
PTGES3-201ENST00000262033 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.67■■■□□ 2.02
PTGES3-201ENST00000262033 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa27.65■■■□□ 2.02
PTGES3-201ENST00000262033 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.61■■■□□ 2.01
PTGES3-201ENST00000262033 SYNJ1O43426 1573 aa27.56■■■□□ 2
PTGES3-201ENST00000262033 PRDM2Q13029 1718 aa27.51■■□□□ 1.99
PTGES3-201ENST00000262033 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.47■■□□□ 1.99
PTGES3-201ENST00000262033 TOP2BQ02880 1626 aa27.46■■□□□ 1.99
PTGES3-201ENST00000262033 SOGA1O94964 1423 aa27.43■■□□□ 1.98
PTGES3-201ENST00000262033 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.41■■□□□ 1.98
PTGES3-201ENST00000262033 EEA1Q15075 1411 aa27.4■■□□□ 1.98
PTGES3-201ENST00000262033 CUX1P39880 1505 aa27.37■■□□□ 1.97
PTGES3-201ENST00000262033 NESP48681 1621 aa27.35■■□□□ 1.97
PTGES3-201ENST00000262033 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.34■■□□□ 1.97
PTGES3-201ENST00000262033 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.33■■□□□ 1.97
PTGES3-201ENST00000262033 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.32■■□□□ 1.96
PTGES3-201ENST00000262033 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.29■■□□□ 1.96
PTGES3-201ENST00000262033 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.2■■□□□ 1.95
PTGES3-201ENST00000262033 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.17■■□□□ 1.94
PTGES3-201ENST00000262033 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.13■■□□□ 1.93
PTGES3-201ENST00000262033 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.07■■□□□ 1.92
PTGES3-201ENST00000262033 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.05■■□□□ 1.92
PTGES3-201ENST00000262033 TOPBP1Q92547 1522 aa27.03■■□□□ 1.92
PTGES3-201ENST00000262033 KIF27Q86VH2 1401 aa27.02■■□□□ 1.92
PTGES3-201ENST00000262033 GOLGA3Q08378 1498 aa27■■□□□ 1.91
PTGES3-201ENST00000262033 KIF21BO75037 1637 aa26.99■■□□□ 1.91
PTGES3-201ENST00000262033 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.99■■□□□ 1.91
PTGES3-201ENST00000262033 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
PTGES3-201ENST00000262033 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.95■■□□□ 1.9
PTGES3-201ENST00000262033 UBTFP17480 764 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
PTGES3-201ENST00000262033 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
PTGES3-201ENST00000262033 CUX2O14529 1486 aa26.91■■□□□ 1.9
PTGES3-201ENST00000262033 PRXQ9BXM0 1461 aa26.87■■□□□ 1.89
PTGES3-201ENST00000262033 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.85■■□□□ 1.89
PTGES3-201ENST00000262033 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.84■■□□□ 1.89
PTGES3-201ENST00000262033 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.84■■□□□ 1.89
PTGES3-201ENST00000262033 IGF1RP08069 1367 aa26.82■■□□□ 1.88
PTGES3-201ENST00000262033 CEP162Q5TB80 1403 aa26.81■■□□□ 1.88
PTGES3-201ENST00000262033 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.8■■□□□ 1.88
PTGES3-201ENST00000262033 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.78■■□□□ 1.88
PTGES3-201ENST00000262033 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.67■■□□□ 1.86
PTGES3-201ENST00000262033 WDR97A6NE52 1622 aa26.66■■□□□ 1.86
PTGES3-201ENST00000262033 ERCC6Q03468 1493 aa26.64■■□□□ 1.86
PTGES3-201ENST00000262033 WDR62O43379 1518 aa26.62■■□□□ 1.85
PTGES3-201ENST00000262033 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
PTGES3-201ENST00000262033 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
PTGES3-201ENST00000262033 CLIP1P30622 1438 aa26.58■■□□□ 1.85
PTGES3-201ENST00000262033 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.56■■□□□ 1.84
PTGES3-201ENST00000262033 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.55■■□□□ 1.84
PTGES3-201ENST00000262033 CUL7Q14999 1698 aa26.49■■□□□ 1.83
PTGES3-201ENST00000262033 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
PTGES3-201ENST00000262033 IFT140Q96RY7 1462 aa26.49■■□□□ 1.83
PTGES3-201ENST00000262033 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
PTGES3-201ENST00000262033 PCGF6Q9BYE7 350 aa26.47■■□□□ 1.83
PTGES3-201ENST00000262033 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
PTGES3-201ENST00000262033 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.4■■□□□ 1.825e-7■■■■□ 25
PTGES3-201ENST00000262033 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.37■■□□□ 1.81
PTGES3-201ENST00000262033 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
PTGES3-201ENST00000262033 GRIN2BQ13224 1484 aa26.32■■□□□ 1.8
PTGES3-201ENST00000262033 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
PTGES3-201ENST00000262033 PBRM1Q86U86 1689 aa26.3■■□□□ 1.8
PTGES3-201ENST00000262033 ARAP1Q96P48 1450 aa26.3■■□□□ 1.8
PTGES3-201ENST00000262033 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.28■■□□□ 1.8
PTGES3-201ENST00000262033 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.28■■□□□ 1.8
PTGES3-201ENST00000262033 ADAMTS12P58397 1594 aa26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms