RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000012049.9

QPCTL-201, Transcript of glutaminyl-peptide cyclotransferase like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene QPCTL, Length 2,310 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
QPCTL-201ENST00000012049 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP17.77■□□□□ 0.448e-6■■■■■ 107
QPCTL-201ENST00000012049 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP18.3■□□□□ 0.522e-7■■■■■ 93.2
QPCTL-201ENST00000012049 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP19.3■□□□□ 0.686e-11■■■■■ 69.3
QPCTL-201ENST00000012049 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP16.25■□□□□ 0.198e-15■■■■■ 65.1
QPCTL-201ENST00000012049 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP19.05■□□□□ 0.642e-7■■■■■ 64.2
QPCTL-201ENST00000012049 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP18.42■□□□□ 0.544e-15■■■■■ 50.1
QPCTL-201ENST00000012049 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP15.91■□□□□ 0.144e-11■■■■■ 35.9
QPCTL-201ENST00000012049 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.8■■□□□ 1.725e-7■■■■■ 27.7
QPCTL-201ENST00000012049 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP18.75■□□□□ 0.598e-9■■■■□ 25.8
QPCTL-201ENST00000012049 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP16.86■□□□□ 0.291e-6■■■■□ 21.4
QPCTL-201ENST00000012049 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP16.66■□□□□ 0.262e-11■■■■□ 21.1
QPCTL-201ENST00000012049 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP19.17■□□□□ 0.665e-6■■■□□ 18.7
QPCTL-201ENST00000012049 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP16.62■□□□□ 0.257e-8■■■□□ 18.3
QPCTL-201ENST00000012049 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP17.77■□□□□ 0.446e-8■■■□□ 17.3
QPCTL-201ENST00000012049 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP18.71■□□□□ 0.591e-6■■■□□ 16.1
QPCTL-201ENST00000012049 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP16.69■□□□□ 0.264e-7■■□□□ 14.5
QPCTL-201ENST00000012049 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP18.08■□□□□ 0.481e-6■■□□□ 14.4
QPCTL-201ENST00000012049 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP17.88■□□□□ 0.452e-6■■□□□ 13.8
QPCTL-201ENST00000012049 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP18.87■□□□□ 0.611e-6■■□□□ 13.7
QPCTL-201ENST00000012049 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP13.21□□□□□ -0.292e-6■■□□□ 12.5
QPCTL-201ENST00000012049 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP17.14■□□□□ 0.337e-6■■□□□ 11.9
QPCTL-201ENST00000012049 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP18.83■□□□□ 0.612e-9■□□□□ 9.4
QPCTL-201ENST00000012049 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP13.48□□□□□ -0.256e-7■□□□□ 9
Retrieved 23 of 23 RNA–protein pairs in 8.7 ms