RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000223859.1

Ptprs-211, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

BASIC

Gene Ptprs, Length 5,588 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprs-211ENSMUST00000223859 Rhox8Q6VSS7 320 aa27.88■■■□□ 2.05
Ptprs-211ENSMUST00000223859 NischQ80TM9 1593 aa25.08■■□□□ 1.6
Ptprs-211ENSMUST00000223859 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
Ptprs-211ENSMUST00000223859 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa24.83■■□□□ 1.57
Ptprs-211ENSMUST00000223859 Cngb1E1AZ71 1325 aa24.65■■□□□ 1.54
Ptprs-211ENSMUST00000223859 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa24.48■■□□□ 1.51
Ptprs-211ENSMUST00000223859 Trim41Q5NCC3 630 aa24.42■■□□□ 1.5
Ptprs-211ENSMUST00000223859 Zeb1Q64318 1117 aa24.29■■□□□ 1.48
Ptprs-211ENSMUST00000223859 Npm2Q80W85 207 aa24.13■■□□□ 1.45
Ptprs-211ENSMUST00000223859 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
Ptprs-211ENSMUST00000223859 Gab3Q8BSM5 595 aa24.08■■□□□ 1.45
Ptprs-211ENSMUST00000223859 Ube2uB1AUC4 352 aa23.98■■□□□ 1.43
Ptprs-211ENSMUST00000223859 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
Ptprs-211ENSMUST00000223859 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
Ptprs-211ENSMUST00000223859 Wdr66E9Q743 1299 aa23.86■■□□□ 1.41
Ptprs-211ENSMUST00000223859 Myt1lP97500 1187 aa23.81■■□□□ 1.4
Ptprs-211ENSMUST00000223859 Abcc9P70170 1546 aa23.8■■□□□ 1.4
Ptprs-211ENSMUST00000223859 Il27Q8K3I6 234 aa23.44■■□□□ 1.34
Ptprs-211ENSMUST00000223859 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa23.41■■□□□ 1.34
Ptprs-211ENSMUST00000223859 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
Ptprs-211ENSMUST00000223859 UbtfP25976 765 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
Ptprs-211ENSMUST00000223859 Abcc8B2RUS7 1588 aa22.95■■□□□ 1.27
Ptprs-211ENSMUST00000223859 Amer1Q7TS75 1132 aa22.91■■□□□ 1.26
Ptprs-211ENSMUST00000223859 HrcG5E8J6 738 aa22.9■■□□□ 1.26
Ptprs-211ENSMUST00000223859 Ccdc180J3QNE4 1664 aa22.88■■□□□ 1.25
Ptprs-211ENSMUST00000223859 Stra8P70278 393 aa22.76■■□□□ 1.23
Ptprs-211ENSMUST00000223859 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
Ptprs-211ENSMUST00000223859 Rtl1Q7M732 1744 aa22.71■■□□□ 1.23
Ptprs-211ENSMUST00000223859 CenpbP27790 599 aa22.7■■□□□ 1.22
Ptprs-211ENSMUST00000223859 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa22.68■■□□□ 1.22
Ptprs-211ENSMUST00000223859 NefmP08553 848 aa22.66■■□□□ 1.22
Ptprs-211ENSMUST00000223859 Slc24a1Q91WD8 1130 aa22.59■■□□□ 1.21
Ptprs-211ENSMUST00000223859 Fam50aQ9WV03 339 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.19
Ptprs-211ENSMUST00000223859 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
Ptprs-211ENSMUST00000223859 4930567H17RikQ3V0K5 233 aa22.39■■□□□ 1.18
Ptprs-211ENSMUST00000223859 Anp32bQ9EST5 272 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
Ptprs-211ENSMUST00000223859 Os9Q8K2C7 672 aa22.28■■□□□ 1.16
Ptprs-211ENSMUST00000223859 Neurod1Q60867 357 aa22.23■■□□□ 1.15
Ptprs-211ENSMUST00000223859 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
Ptprs-211ENSMUST00000223859 NrdcQ8BHG1 1161 aa22.17■■□□□ 1.14
Ptprs-211ENSMUST00000223859 Ubl4bQ9CQ84 188 aa22.16■■□□□ 1.14
Ptprs-211ENSMUST00000223859 NclP09405 707 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
Ptprs-211ENSMUST00000223859 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa22.14■■□□□ 1.14
Ptprs-211ENSMUST00000223859 Lmod2Q3UHZ5 550 aa22.1■■□□□ 1.13
Ptprs-211ENSMUST00000223859 NeflP08551 543 aa22.08■■□□□ 1.12
Ptprs-211ENSMUST00000223859 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa22.06■■□□□ 1.12
Ptprs-211ENSMUST00000223859 4933416C03RikQ3V063 378 aa22.02■■□□□ 1.12
Ptprs-211ENSMUST00000223859 Zbtb7cQ8VCZ7 619 aa22.01■■□□□ 1.11
Ptprs-211ENSMUST00000223859 NacadQ5SWP3 1504 aa22■■□□□ 1.11
Ptprs-211ENSMUST00000223859 Cdk11bP24788 784 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
Ptprs-211ENSMUST00000223859 Gm13697A2AK42 830 aa21.99■■□□□ 1.11
Ptprs-211ENSMUST00000223859 Hnrnpul2Q00PI9 745 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
Ptprs-211ENSMUST00000223859 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa21.95■■□□□ 1.1
Ptprs-211ENSMUST00000223859 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa21.89■■□□□ 1.09
Ptprs-211ENSMUST00000223859 Fkbp15Q6P9Q6 1216 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
Ptprs-211ENSMUST00000223859 Tnnt3Q9QZ47 272 aa21.88■■□□□ 1.09
Ptprs-211ENSMUST00000223859 Eif5bQ05D44 1216 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
Ptprs-211ENSMUST00000223859 TonslQ6NZL6 1363 aa21.78■■□□□ 1.08
Ptprs-211ENSMUST00000223859 Mier1Q5UAK0 511 aa21.67■■□□□ 1.06
Ptprs-211ENSMUST00000223859 Erich6D3Z6S9 713 aa21.67■■□□□ 1.06
Ptprs-211ENSMUST00000223859 Nop58Q6DFW4 536 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
Ptprs-211ENSMUST00000223859 Chic1Q8CBW7 227 aa21.66■■□□□ 1.06
Ptprs-211ENSMUST00000223859 Dcaf1Q80TR8 1506 aa21.65■■□□□ 1.06
Ptprs-211ENSMUST00000223859 Plppr3Q7TPB0 716 aa21.64■■□□□ 1.05
Ptprs-211ENSMUST00000223859 Clip1Q922J3 1391 aa21.63■■□□□ 1.05
Ptprs-211ENSMUST00000223859 Atp1b4Q99ME6 356 aa21.63■■□□□ 1.05
Ptprs-211ENSMUST00000223859 Ercc6F8VPZ5 1481 aa21.61■■□□□ 1.05
Ptprs-211ENSMUST00000223859 Hdac5Q9Z2V6 1113 aa21.57■■□□□ 1.04
Ptprs-211ENSMUST00000223859 Gm13695A2AK44 830 aa21.57■■□□□ 1.04
Ptprs-211ENSMUST00000223859 Myt1Q8CFC2 1127 aa21.55■■□□□ 1.04
Ptprs-211ENSMUST00000223859 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa21.54■■□□□ 1.04
Ptprs-211ENSMUST00000223859 Cep164Q5DU05 1446 aa21.53■■□□□ 1.04
Ptprs-211ENSMUST00000223859 Baz1aO88379 1555 aa21.52■■□□□ 1.04
Ptprs-211ENSMUST00000223859 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.03
Ptprs-211ENSMUST00000223859 Kif15Q6P9L6 1387 aa21.5■■□□□ 1.03
Ptprs-211ENSMUST00000223859 Zbtb4Q5F293 982 aa21.42■■□□□ 1.02
Ptprs-211ENSMUST00000223859 Kdm5dQ62240 1548 aa21.39■■□□□ 1.01
Ptprs-211ENSMUST00000223859 Pcgf6Q99NA9 353 aa21.35■■□□□ 1.01
Ptprs-211ENSMUST00000223859 Rtl5Q5DTT4 599 aa21.33■■□□□ 1
Ptprs-211ENSMUST00000223859 Ccdc18Q640L5 1455 aa21.31■■□□□ 1
Ptprs-211ENSMUST00000223859 Safb2Q80YR5 991 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
Ptprs-211ENSMUST00000223859 Ccer2J3QPU5 274 aa21.29■■□□□ 1
Ptprs-211ENSMUST00000223859 Golga3P55937 1487 aa21.26■□□□□ 0.99
Ptprs-211ENSMUST00000223859 Eid3Q3V124 375 aa21.26■□□□□ 0.99
Ptprs-211ENSMUST00000223859 BlmO88700 1416 aa21.24■□□□□ 0.99
Ptprs-211ENSMUST00000223859 Nlrp6Q91WS2 869 aa21.23■□□□□ 0.99
Ptprs-211ENSMUST00000223859 Chic2Q9D9G3 165 aa21.23■□□□□ 0.99
Ptprs-211ENSMUST00000223859 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
Ptprs-211ENSMUST00000223859 Clstn2Q9ER65 966 aa21.22■□□□□ 0.99
Ptprs-211ENSMUST00000223859 Prdm10Q3UTQ7 1184 aa21.22■□□□□ 0.99
Ptprs-211ENSMUST00000223859 Setd5Q5XJV7 1441 aa21.19■□□□□ 0.98
Ptprs-211ENSMUST00000223859 Arhgap27A2AB59 869 aa21.14■□□□□ 0.97
Ptprs-211ENSMUST00000223859 DiexfQ8BTT6 772 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
Ptprs-211ENSMUST00000223859 Supt5hO55201 1082 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
Ptprs-211ENSMUST00000223859 ClspnQ80YR7 1315 aa21.07■□□□□ 0.96
Ptprs-211ENSMUST00000223859 Polr3glQ8R0C0 218 aa21.04■□□□□ 0.96
Ptprs-211ENSMUST00000223859 DaxxO35613 739 aa21.02■□□□□ 0.95
Ptprs-211ENSMUST00000223859 P3h3Q8CG70 732 aa20.95■□□□□ 0.94
Ptprs-211ENSMUST00000223859 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa20.95■□□□□ 0.94
Ptprs-211ENSMUST00000223859 Anp32aO35381 247 aa20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 69.5 ms