RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000181344.1

4931440J10Rik-201, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene 4931440J10Rik, Length 891 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa31.53■■■□□ 2.64
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 Chic1Q8CBW7 227 aa31.31■■■□□ 2.6
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 Phf23Q8BSN5 401 aa28.02■■■□□ 2.08
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 Gab3Q8BSM5 595 aa26.59■■□□□ 1.85
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 Plppr3Q7TPB0 716 aa26.34■■□□□ 1.81
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 Senp3Q9EP97 568 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa24.49■■□□□ 1.51
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 NischQ80TM9 1593 aa24.06■■□□□ 1.44
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 Fam163aQ8CAA5 168 aa23.82■■□□□ 1.4
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 Abcc9P70170 1546 aa23.7■■□□□ 1.38
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 Abcc8B2RUS7 1588 aa23.45■■□□□ 1.34
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 Kcna4Q61423 654 aa23.34■■□□□ 1.33
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 ScribQ80U72 1612 aa22.94■■□□□ 1.26
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 Hoxd11P23813 323 aa22.63■■□□□ 1.21
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 Trap1aP19473 224 aa22.45■■□□□ 1.18
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 NacadQ5SWP3 1504 aa22.15■■□□□ 1.14
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 Kdm5dQ62240 1548 aa22.08■■□□□ 1.13
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa22.08■■□□□ 1.13
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 Znf219Q6IQX8 726 aa21.98■■□□□ 1.11
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 ArsiQ32KI9 573 aa21.83■■□□□ 1.09
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 Sycp2Q9CUU3 1500 aa21.76■■□□□ 1.07
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 BicraF8VPZ9 1578 aa21.57■■□□□ 1.04
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 Chrna2Q91X60 512 aa21.39■■□□□ 1.01
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 Dcaf1Q80TR8 1506 aa21.38■■□□□ 1.01
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 Rsph4aQ8BYM7 716 aa21.28■■□□□ 1
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 Rimbp2Q80U40 1072 aa21■□□□□ 0.95
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 Slc34a2Q9DBP0 697 aa20.93■□□□□ 0.94
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa20.89■□□□□ 0.94
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 Akt1s1Q9D1F4 257 aa20.83■□□□□ 0.93
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 Dmrt2Q8BG36 561 aa20.77■□□□□ 0.92
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa20.75■□□□□ 0.91
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 Ercc6F8VPZ5 1481 aa20.61■□□□□ 0.89
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 Baz1aO88379 1555 aa20.55■□□□□ 0.88
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 Crybg2B7ZCC2 1516 aa20.52■□□□□ 0.87
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 Fam135aQ6NS59 1506 aa20.49■□□□□ 0.87
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 Dnajc5P60904 198 aa20.48■□□□□ 0.87
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 Smarca2Q6DIC0 1577 aa20.44■□□□□ 0.86
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 GapdhsQ64467 440 aa20.43■□□□□ 0.86
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 Rhox8Q6VSS7 320 aa20.37■□□□□ 0.85
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa20.3■□□□□ 0.84
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 Frmpd1A2AKB4 1549 aa20.26■□□□□ 0.83
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 Trim41Q5NCC3 630 aa20.25■□□□□ 0.83
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 Wdr62Q3U3T8 1523 aa20.23■□□□□ 0.83
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 Ccdc180J3QNE4 1664 aa20.23■□□□□ 0.83
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 Ubl4bQ9CQ84 188 aa20.22■□□□□ 0.83
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa20.22■□□□□ 0.83
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 Baz1bQ9Z277 1479 aa20.12■□□□□ 0.81
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 Atf5O70191 283 aa20.08■□□□□ 0.81
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 Mrc2Q64449 1479 aa20.05■□□□□ 0.8
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 Ppp4r2Q0VGB7 417 aa19.91■□□□□ 0.78
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 Hs6st3Q9QYK4 470 aa19.89■□□□□ 0.77
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 Unc13aQ4KUS2 1712 aa19.78■□□□□ 0.76
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa19.69■□□□□ 0.74
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa19.59■□□□□ 0.73
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 CftrP26361 1476 aa19.59■□□□□ 0.73
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP19.59■□□□□ 0.73
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 Bach1P97302 739 aa19.57■□□□□ 0.72
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 Sox12Q04890 314 aa19.52■□□□□ 0.72
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 Znf704Q9ERQ3 566 aa19.52■□□□□ 0.72
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 Cux2P70298 1426 aa19.5■□□□□ 0.71
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 Slc4a1apE9PX68 744 aa19.49■□□□□ 0.71
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 Shroom2A2ALU4 1481 aa19.47■□□□□ 0.71
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 Synj1Q8CHC4 1574 aa19.46■□□□□ 0.71
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa19.44■□□□□ 0.7
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 Slc4a5E9Q3M5 1116 aa19.43■□□□□ 0.7
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 Kif15Q6P9L6 1387 aa19.38■□□□□ 0.69
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 Col17a1Q07563 1470 aa19.37■□□□□ 0.69
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 Kif21aQ9QXL2 1672 aa19.36■□□□□ 0.69
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP19.33■□□□□ 0.68
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP19.3■□□□□ 0.68
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP19.28■□□□□ 0.68
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP19.27■□□□□ 0.68
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP19.25■□□□□ 0.67
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa19.21■□□□□ 0.67
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP19.14■□□□□ 0.65
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 Plb1Q3TTY0 1478 aa19.1■□□□□ 0.65
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 Cep164Q5DU05 1446 aa19.09■□□□□ 0.65
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 Top2bQ64511 1612 aa19.09■□□□□ 0.65
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 Lamc3Q9R0B6 1581 aa19.08■□□□□ 0.65
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP19.05■□□□□ 0.64
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 1700123L14RikQ3V2K7 440 aa19.04■□□□□ 0.64
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 Il27Q8K3I6 234 aa19■□□□□ 0.63
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 Pcdh10E9PXQ7 1057 aa18.99■□□□□ 0.63
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 WdpcpQ8C456 722 aa18.93■□□□□ 0.62
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.62
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 Rusc2Q80U22 1514 aa18.86■□□□□ 0.61
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 Crocc2F6XLV1 1638 aa18.83■□□□□ 0.61
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 Ccdc18Q640L5 1455 aa18.83■□□□□ 0.6
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 Grwd1Q810D6 446 aaKnown RBP18.82■□□□□ 0.6
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 Ift140E9PY46 1464 aa18.82■□□□□ 0.6
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 Egfem1Q8C088 590 aa18.81■□□□□ 0.6
4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 Rtl1Q7M732 1744 aa18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 58.2 ms