RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000164099.2

Snx19-201, Transcript of Sorting nexin-19, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Snx19, Length 5,762 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx19-201ENSMUST00000164099 Rhox8Q6VSS7 320 aa27.25■■□□□ 1.95
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Snx19-201ENSMUST00000164099 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa24.24■■□□□ 1.47
Snx19-201ENSMUST00000164099 Cngb1E1AZ71 1325 aa24.13■■□□□ 1.45
Snx19-201ENSMUST00000164099 Zeb1Q64318 1117 aa23.86■■□□□ 1.41
Snx19-201ENSMUST00000164099 Trim41Q5NCC3 630 aa23.84■■□□□ 1.41
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Snx19-201ENSMUST00000164099 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa22.96■■□□□ 1.27
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Snx19-201ENSMUST00000164099 Ccdc180J3QNE4 1664 aa22.19■■□□□ 1.14
Snx19-201ENSMUST00000164099 HrcG5E8J6 738 aa22.18■■□□□ 1.14
Snx19-201ENSMUST00000164099 Rtl1Q7M732 1744 aa22.05■■□□□ 1.12
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Snx19-201ENSMUST00000164099 Neurod1Q60867 357 aa21.73■■□□□ 1.07
Snx19-201ENSMUST00000164099 Gm13697A2AK42 830 aa21.68■■□□□ 1.06
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Snx19-201ENSMUST00000164099 Zbtb7cQ8VCZ7 619 aa21.59■■□□□ 1.05
Snx19-201ENSMUST00000164099 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa21.58■■□□□ 1.05
Snx19-201ENSMUST00000164099 Hnrnpul2Q00PI9 745 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
Snx19-201ENSMUST00000164099 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa21.49■■□□□ 1.03
Snx19-201ENSMUST00000164099 Fkbp15Q6P9Q6 1216 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
Snx19-201ENSMUST00000164099 NacadQ5SWP3 1504 aa21.47■■□□□ 1.03
Snx19-201ENSMUST00000164099 NrdcQ8BHG1 1161 aa21.38■■□□□ 1.01
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Snx19-201ENSMUST00000164099 Baz1aO88379 1555 aa20.94■□□□□ 0.94
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Snx19-201ENSMUST00000164099 Ccdc18Q640L5 1455 aa20.85■□□□□ 0.93
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Snx19-201ENSMUST00000164099 Ccer2J3QPU5 274 aa20.73■□□□□ 0.91
Snx19-201ENSMUST00000164099 Chic2Q9D9G3 165 aa20.72■□□□□ 0.91
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Snx19-201ENSMUST00000164099 Polr3glQ8R0C0 218 aa20.45■□□□□ 0.86
Snx19-201ENSMUST00000164099 Pcgf6Q99NA9 353 aa20.45■□□□□ 0.86
Snx19-201ENSMUST00000164099 Ppp1r18Q8BQ30 594 aa20.44■□□□□ 0.86
Snx19-201ENSMUST00000164099 MyclP10166 368 aa20.44■□□□□ 0.86
Snx19-201ENSMUST00000164099 Amer1Q7TS75 1132 aa20.42■□□□□ 0.86
Snx19-201ENSMUST00000164099 ClspnQ80YR7 1315 aa20.4■□□□□ 0.86
Snx19-201ENSMUST00000164099 Sycp2Q9CUU3 1500 aa20.38■□□□□ 0.85
Snx19-201ENSMUST00000164099 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa20.35■□□□□ 0.85
Snx19-201ENSMUST00000164099 Supt5hO55201 1082 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
Snx19-201ENSMUST00000164099 Eea1Q8BL66 1411 aa20.33■□□□□ 0.85
Snx19-201ENSMUST00000164099 Rrp7aQ9D1C9 280 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
Snx19-201ENSMUST00000164099 AknaQ80VW7 1404 aa20.28■□□□□ 0.84
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