RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000099452.2

Ctxn2-201, Transcript of Cortexin-2, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctxn2, Length 1,028 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 Chic1Q8CBW7 227 aa28.52■■■□□ 2.16
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa27.61■■■□□ 2.01
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 Phf23Q8BSN5 401 aa25.57■■□□□ 1.68
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa25■■□□□ 1.59
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 Plppr3Q7TPB0 716 aa24.79■■□□□ 1.56
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 NischQ80TM9 1593 aa24.67■■□□□ 1.54
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 Gab3Q8BSM5 595 aa24.56■■□□□ 1.52
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 Abcc8B2RUS7 1588 aa23.92■■□□□ 1.42
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 Abcc9P70170 1546 aa23.89■■□□□ 1.41
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 Senp3Q9EP97 568 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 ScribQ80U72 1612 aa23.01■■□□□ 1.27
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 Kcna4Q61423 654 aa22.64■■□□□ 1.21
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 NacadQ5SWP3 1504 aa22.3■■□□□ 1.16
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 Kdm5dQ62240 1548 aa22.22■■□□□ 1.15
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 Dcaf1Q80TR8 1506 aa22.06■■□□□ 1.12
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 Sycp2Q9CUU3 1500 aa21.89■■□□□ 1.09
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 BicraF8VPZ9 1578 aa21.59■■□□□ 1.05
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa21.44■■□□□ 1.02
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 Crybg2B7ZCC2 1516 aa21.26■□□□□ 0.99
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 Rhox8Q6VSS7 320 aa21.23■□□□□ 0.99
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 Baz1aO88379 1555 aa21.19■□□□□ 0.98
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 Ccdc180J3QNE4 1664 aa21.19■□□□□ 0.98
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa21.05■□□□□ 0.96
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.95
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 Trap1aP19473 224 aa20.77■□□□□ 0.92
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 Hoxd11P23813 323 aa20.74■□□□□ 0.91
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa20.6■□□□□ 0.89
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 Smarca2Q6DIC0 1577 aa20.59■□□□□ 0.89
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 Fam163aQ8CAA5 168 aa20.42■□□□□ 0.86
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa20.41■□□□□ 0.86
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 Ercc6F8VPZ5 1481 aa20.37■□□□□ 0.85
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa20.37■□□□□ 0.85
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 Frmpd1A2AKB4 1549 aa20.31■□□□□ 0.84
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 Wdr62Q3U3T8 1523 aa20.27■□□□□ 0.84
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 Fam135aQ6NS59 1506 aa20.27■□□□□ 0.84
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 Dmrt2Q8BG36 561 aa20.26■□□□□ 0.83
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 CftrP26361 1476 aa20.11■□□□□ 0.81
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 Baz1bQ9Z277 1479 aa20.08■□□□□ 0.81
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 Rtl1Q7M732 1744 aa20.06■□□□□ 0.8
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 Synj1Q8CHC4 1574 aa20■□□□□ 0.79
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 Ubl4bQ9CQ84 188 aa19.99■□□□□ 0.79
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa19.96■□□□□ 0.79
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa19.94■□□□□ 0.78
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 Unc13aQ4KUS2 1712 aa19.91■□□□□ 0.78
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 Znf219Q6IQX8 726 aa19.91■□□□□ 0.78
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa19.88■□□□□ 0.77
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 Mrc2Q64449 1479 aa19.78■□□□□ 0.76
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 Trim41Q5NCC3 630 aa19.7■□□□□ 0.74
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 Chrna2Q91X60 512 aa19.66■□□□□ 0.74
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP19.62■□□□□ 0.73
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP19.56■□□□□ 0.72
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 Cux2P70298 1426 aa19.52■□□□□ 0.72
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 Kif15Q6P9L6 1387 aa19.52■□□□□ 0.72
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 Slc4a1apE9PX68 744 aa19.51■□□□□ 0.71
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 Rsph4aQ8BYM7 716 aa19.5■□□□□ 0.71
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 Lamc3Q9R0B6 1581 aa19.49■□□□□ 0.71
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 Golga3P55937 1487 aa19.33■□□□□ 0.68
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP19.3■□□□□ 0.68
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa19.29■□□□□ 0.68
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 Top2bQ64511 1612 aa19.29■□□□□ 0.68
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 Kif21aQ9QXL2 1672 aa19.27■□□□□ 0.68
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 TnnQ80Z71 1560 aa19.26■□□□□ 0.67
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 Cep164Q5DU05 1446 aa19.23■□□□□ 0.67
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 Rimbp2Q80U40 1072 aa19.2■□□□□ 0.66
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 Atf5O70191 283 aa19.16■□□□□ 0.66
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 Cngb1E1AZ71 1325 aa19.12■□□□□ 0.65
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 Ccdc18Q640L5 1455 aa19.11■□□□□ 0.65
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 Camsap1A2AHC3 1581 aa19.09■□□□□ 0.65
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 Fmn1Q05860 1466 aa19.09■□□□□ 0.65
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 Plb1Q3TTY0 1478 aa19.06■□□□□ 0.64
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 Il27Q8K3I6 234 aa19.06■□□□□ 0.64
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 Hs6st3Q9QYK4 470 aa19.05■□□□□ 0.64
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 Ppp4r2Q0VGB7 417 aa19.03■□□□□ 0.64
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP19.01■□□□□ 0.63
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP19.01■□□□□ 0.63
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 Dnajc5P60904 198 aa19■□□□□ 0.63
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 ArsiQ32KI9 573 aa18.93■□□□□ 0.62
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 Crocc2F6XLV1 1638 aa18.92■□□□□ 0.62
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 Duox2A2AQ99 1517 aa18.9■□□□□ 0.62
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 Ift140E9PY46 1464 aa18.88■□□□□ 0.61
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 Grin2bQ01097 1482 aa18.88■□□□□ 0.61
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 Shroom2A2ALU4 1481 aa18.87■□□□□ 0.61
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa18.84■□□□□ 0.61
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 Efcab5A0JP43 1406 aa18.83■□□□□ 0.61
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 Akt1s1Q9D1F4 257 aa18.83■□□□□ 0.6
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 Disp1Q3TDN0 1521 aa18.82■□□□□ 0.6
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 Rusc2Q80U22 1514 aa18.74■□□□□ 0.59
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 NrkQ9R0G8 1455 aa18.71■□□□□ 0.59
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
Ctxn2-201ENSMUST00000099452 Samd9lQ69Z37 1561 aa18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 70 ms