RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000067120.13

Chrna4-201, Transcript of Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Chrna4, Length 4,565 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4-201ENSMUST00000067120 Rhox8Q6VSS7 320 aa28.87■■■□□ 2.21
Chrna4-201ENSMUST00000067120 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa25.92■■□□□ 1.74
Chrna4-201ENSMUST00000067120 NischQ80TM9 1593 aa25.92■■□□□ 1.74
Chrna4-201ENSMUST00000067120 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa25.69■■□□□ 1.7
Chrna4-201ENSMUST00000067120 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.69
Chrna4-201ENSMUST00000067120 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
Chrna4-201ENSMUST00000067120 Cngb1E1AZ71 1325 aa25.4■■□□□ 1.66
Chrna4-201ENSMUST00000067120 Gab3Q8BSM5 595 aa25.12■■□□□ 1.61
Chrna4-201ENSMUST00000067120 Trim41Q5NCC3 630 aa25.06■■□□□ 1.6
Chrna4-201ENSMUST00000067120 Zeb1Q64318 1117 aa24.84■■□□□ 1.57
Chrna4-201ENSMUST00000067120 Npm2Q80W85 207 aa24.73■■□□□ 1.55
Chrna4-201ENSMUST00000067120 Myt1lP97500 1187 aa24.66■■□□□ 1.54
Chrna4-201ENSMUST00000067120 Wdr66E9Q743 1299 aa24.61■■□□□ 1.53
Chrna4-201ENSMUST00000067120 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
Chrna4-201ENSMUST00000067120 Abcc9P70170 1546 aa24.52■■□□□ 1.52
Chrna4-201ENSMUST00000067120 Ube2uB1AUC4 352 aa24.5■■□□□ 1.51
Chrna4-201ENSMUST00000067120 Il27Q8K3I6 234 aa24.22■■□□□ 1.47
Chrna4-201ENSMUST00000067120 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa24.19■■□□□ 1.46
Chrna4-201ENSMUST00000067120 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
Chrna4-201ENSMUST00000067120 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
Chrna4-201ENSMUST00000067120 Ccdc180J3QNE4 1664 aa24■■□□□ 1.43
Chrna4-201ENSMUST00000067120 HrcG5E8J6 738 aa23.98■■□□□ 1.43
Chrna4-201ENSMUST00000067120 UbtfP25976 765 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
Chrna4-201ENSMUST00000067120 Abcc8B2RUS7 1588 aa23.87■■□□□ 1.41
Chrna4-201ENSMUST00000067120 NefmP08553 848 aa23.85■■□□□ 1.41
Chrna4-201ENSMUST00000067120 Rtl1Q7M732 1744 aa23.7■■□□□ 1.38
Chrna4-201ENSMUST00000067120 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
Chrna4-201ENSMUST00000067120 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa23.56■■□□□ 1.36
Chrna4-201ENSMUST00000067120 Pcgf6Q99NA9 353 aa23.32■■□□□ 1.32
Chrna4-201ENSMUST00000067120 Fam50aQ9WV03 339 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
Chrna4-201ENSMUST00000067120 Slc24a1Q91WD8 1130 aa23.29■■□□□ 1.32
Chrna4-201ENSMUST00000067120 CenpbP27790 599 aa23.29■■□□□ 1.32
Chrna4-201ENSMUST00000067120 Stra8P70278 393 aa23.25■■□□□ 1.31
Chrna4-201ENSMUST00000067120 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
Chrna4-201ENSMUST00000067120 Cdk11bP24788 784 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
Chrna4-201ENSMUST00000067120 Neurod1Q60867 357 aa23.08■■□□□ 1.29
Chrna4-201ENSMUST00000067120 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa23.04■■□□□ 1.28
Chrna4-201ENSMUST00000067120 Supt5hO55201 1082 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
Chrna4-201ENSMUST00000067120 Lmod2Q3UHZ5 550 aa22.99■■□□□ 1.27
Chrna4-201ENSMUST00000067120 NclP09405 707 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
Chrna4-201ENSMUST00000067120 Nop58Q6DFW4 536 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
Chrna4-201ENSMUST00000067120 Mier1Q5UAK0 511 aa22.92■■□□□ 1.26
Chrna4-201ENSMUST00000067120 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa22.89■■□□□ 1.26
Chrna4-201ENSMUST00000067120 Chic1Q8CBW7 227 aa22.84■■□□□ 1.25
Chrna4-201ENSMUST00000067120 Zbtb7cQ8VCZ7 619 aa22.83■■□□□ 1.25
Chrna4-201ENSMUST00000067120 TonslQ6NZL6 1363 aa22.83■■□□□ 1.25
Chrna4-201ENSMUST00000067120 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa22.8■■□□□ 1.24
Chrna4-201ENSMUST00000067120 NrdcQ8BHG1 1161 aa22.78■■□□□ 1.24
Chrna4-201ENSMUST00000067120 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa22.75■■□□□ 1.23
Chrna4-201ENSMUST00000067120 Dcaf1Q80TR8 1506 aa22.74■■□□□ 1.23
Chrna4-201ENSMUST00000067120 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
Chrna4-201ENSMUST00000067120 Os9Q8K2C7 672 aa22.73■■□□□ 1.23
Chrna4-201ENSMUST00000067120 Ubl4bQ9CQ84 188 aa22.7■■□□□ 1.23
Chrna4-201ENSMUST00000067120 Anp32bQ9EST5 272 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
Chrna4-201ENSMUST00000067120 Tnnt3Q9QZ47 272 aa22.66■■□□□ 1.22
Chrna4-201ENSMUST00000067120 Fkbp15Q6P9Q6 1216 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
Chrna4-201ENSMUST00000067120 Cep164Q5DU05 1446 aa22.59■■□□□ 1.21
Chrna4-201ENSMUST00000067120 Eif5bQ05D44 1216 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
Chrna4-201ENSMUST00000067120 Hnrnpul2Q00PI9 745 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.2
Chrna4-201ENSMUST00000067120 Amer1Q7TS75 1132 aa22.58■■□□□ 1.2
Chrna4-201ENSMUST00000067120 NacadQ5SWP3 1504 aa22.47■■□□□ 1.19
Chrna4-201ENSMUST00000067120 Eid3Q3V124 375 aa22.45■■□□□ 1.18
Chrna4-201ENSMUST00000067120 Clip1Q922J3 1391 aa22.4■■□□□ 1.18
Chrna4-201ENSMUST00000067120 NeflP08551 543 aa22.4■■□□□ 1.18
Chrna4-201ENSMUST00000067120 ClspnQ80YR7 1315 aa22.38■■□□□ 1.17
Chrna4-201ENSMUST00000067120 Zbtb4Q5F293 982 aa22.37■■□□□ 1.17
Chrna4-201ENSMUST00000067120 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa22.29■■□□□ 1.16
Chrna4-201ENSMUST00000067120 Sall2Q9QX96 1004 aa22.28■■□□□ 1.16
Chrna4-201ENSMUST00000067120 Gm13697A2AK42 830 aa22.27■■□□□ 1.16
Chrna4-201ENSMUST00000067120 Erich6D3Z6S9 713 aa22.26■■□□□ 1.15
Chrna4-201ENSMUST00000067120 Baz1aO88379 1555 aa22.26■■□□□ 1.15
Chrna4-201ENSMUST00000067120 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa22.25■■□□□ 1.15
Chrna4-201ENSMUST00000067120 Plppr3Q7TPB0 716 aa22.24■■□□□ 1.15
Chrna4-201ENSMUST00000067120 Myt1Q8CFC2 1127 aa22.17■■□□□ 1.14
Chrna4-201ENSMUST00000067120 4933416C03RikQ3V063 378 aa22.13■■□□□ 1.13
Chrna4-201ENSMUST00000067120 Chic2Q9D9G3 165 aa22.12■■□□□ 1.13
Chrna4-201ENSMUST00000067120 Kif15Q6P9L6 1387 aa22.1■■□□□ 1.13
Chrna4-201ENSMUST00000067120 Prdm10Q3UTQ7 1184 aa22.1■■□□□ 1.13
Chrna4-201ENSMUST00000067120 Atp1b4Q99ME6 356 aa22.1■■□□□ 1.13
Chrna4-201ENSMUST00000067120 Kdm5dQ62240 1548 aa22.05■■□□□ 1.12
Chrna4-201ENSMUST00000067120 Golga3P55937 1487 aa22■■□□□ 1.11
Chrna4-201ENSMUST00000067120 BlmO88700 1416 aa21.99■■□□□ 1.11
Chrna4-201ENSMUST00000067120 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
Chrna4-201ENSMUST00000067120 Ccer2J3QPU5 274 aa21.92■■□□□ 1.1
Chrna4-201ENSMUST00000067120 Setd5Q5XJV7 1441 aa21.92■■□□□ 1.1
Chrna4-201ENSMUST00000067120 Gm13695A2AK44 830 aa21.89■■□□□ 1.09
Chrna4-201ENSMUST00000067120 Anks4bQ8K3X6 423 aa21.86■■□□□ 1.09
Chrna4-201ENSMUST00000067120 Anp32aO35381 247 aa21.85■■□□□ 1.09
Chrna4-201ENSMUST00000067120 Gm38655A0A286YDK6 273 aa21.83■■□□□ 1.09
Chrna4-201ENSMUST00000067120 Rtl5Q5DTT4 599 aa21.82■■□□□ 1.08
Chrna4-201ENSMUST00000067120 Ercc6F8VPZ5 1481 aa21.8■■□□□ 1.08
Chrna4-201ENSMUST00000067120 Csrnp3P59055 597 aa21.77■■□□□ 1.08
Chrna4-201ENSMUST00000067120 Aebp2Q9Z248 504 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
Chrna4-201ENSMUST00000067120 Nlrp6Q91WS2 869 aa21.74■■□□□ 1.07
Chrna4-201ENSMUST00000067120 Arhgap27A2AB59 869 aa21.73■■□□□ 1.07
Chrna4-201ENSMUST00000067120 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa21.69■■□□□ 1.06
Chrna4-201ENSMUST00000067120 Ccdc18Q640L5 1455 aa21.67■■□□□ 1.06
Chrna4-201ENSMUST00000067120 Hdac5Q9Z2V6 1113 aa21.64■■□□□ 1.06
Chrna4-201ENSMUST00000067120 Polr3glQ8R0C0 218 aa21.61■■□□□ 1.05
Chrna4-201ENSMUST00000067120 Mrs2Q5NCE8 434 aa21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 80.6 ms