RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000066279.10

Sh3bp4-201, Transcript of SH3 domain-binding protein 4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp4, Length 4,995 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Rhox8Q6VSS7 320 aa23.53■■□□□ 1.36
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa21.05■□□□□ 0.96
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 NischQ80TM9 1593 aa20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa20.7■□□□□ 0.9
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Cngb1E1AZ71 1325 aa20.69■□□□□ 0.9
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Gab3Q8BSM5 595 aa20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Trim41Q5NCC3 630 aa20.39■□□□□ 0.85
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Zeb1Q64318 1117 aa20.24■□□□□ 0.83
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Npm2Q80W85 207 aa20.18■□□□□ 0.82
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Wdr66E9Q743 1299 aa20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Ube2uB1AUC4 352 aa20.13■□□□□ 0.81
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Myt1lP97500 1187 aa20.12■□□□□ 0.81
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 UbtfP25976 765 aaKnown RBP19.66■□□□□ 0.74
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Il27Q8K3I6 234 aa19.59■□□□□ 0.73
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Abcc9P70170 1546 aa19.54■□□□□ 0.72
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP19.54■□□□□ 0.72
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 HrcG5E8J6 738 aa19.43■□□□□ 0.7
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP19.41■□□□□ 0.7
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 NefmP08553 848 aa19.37■□□□□ 0.69
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa19.33■□□□□ 0.69
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Ccdc180J3QNE4 1664 aa19.28■□□□□ 0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa19.19■□□□□ 0.66
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Slc24a1Q91WD8 1130 aa19.16■□□□□ 0.66
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Fam50aQ9WV03 339 aaKnown RBP19.08■□□□□ 0.64
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa18.94■□□□□ 0.62
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Abcc8B2RUS7 1588 aa18.94■□□□□ 0.62
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Neurod1Q60867 357 aa18.93■□□□□ 0.62
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Rtl1Q7M732 1744 aa18.93■□□□□ 0.62
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Stra8P70278 393 aa18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Pcgf6Q99NA9 353 aa18.87■□□□□ 0.61
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 CenpbP27790 599 aa18.85■□□□□ 0.61
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 NclP09405 707 aaKnown RBP18.82■□□□□ 0.6
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Cdk11bP24788 784 aaKnown RBP18.81■□□□□ 0.6
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Lmod2Q3UHZ5 550 aa18.7■□□□□ 0.58
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Mier1Q5UAK0 511 aa18.7■□□□□ 0.58
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Nop58Q6DFW4 536 aaKnown RBP18.67■□□□□ 0.58
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Supt5hO55201 1082 aaKnown RBP18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 NrdcQ8BHG1 1161 aa18.63■□□□□ 0.57
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 TonslQ6NZL6 1363 aa18.63■□□□□ 0.57
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Os9Q8K2C7 672 aa18.63■□□□□ 0.57
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Zbtb7cQ8VCZ7 619 aa18.58■□□□□ 0.56
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Anp32bQ9EST5 272 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Eif5bQ05D44 1216 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Chic1Q8CBW7 227 aa18.48■□□□□ 0.55
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Amer1Q7TS75 1132 aa18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Hnrnpul2Q00PI9 745 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.54
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Tnnt3Q9QZ47 272 aa18.36■□□□□ 0.53
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Eid3Q3V124 375 aa18.35■□□□□ 0.53
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 NeflP08551 543 aa18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Zbtb4Q5F293 982 aa18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Fkbp15Q6P9Q6 1216 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa18.27■□□□□ 0.52
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Clip1Q922J3 1391 aa18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa18.24■□□□□ 0.51
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa18.24■□□□□ 0.51
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Dcaf1Q80TR8 1506 aa18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Ubl4bQ9CQ84 188 aa18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Cep164Q5DU05 1446 aa18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 ClspnQ80YR7 1315 aa18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Erich6D3Z6S9 713 aa18.16■□□□□ 0.5
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Gm13697A2AK42 830 aa18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Prdm10Q3UTQ7 1184 aa18.08■□□□□ 0.48
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Sall2Q9QX96 1004 aa18.04■□□□□ 0.48
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4933416C03RikQ3V063 378 aa18.04■□□□□ 0.48
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Atp1b4Q99ME6 356 aa18.03■□□□□ 0.48
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Chic2Q9D9G3 165 aa17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 NacadQ5SWP3 1504 aa17.95■□□□□ 0.46
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Plppr3Q7TPB0 716 aa17.92■□□□□ 0.46
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 BlmO88700 1416 aa17.89■□□□□ 0.46
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Nlrp6Q91WS2 869 aa17.88■□□□□ 0.45
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Ccer2J3QPU5 274 aa17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Gm13695A2AK44 830 aa17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Gm38655A0A286YDK6 273 aa17.83■□□□□ 0.45
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Setd5Q5XJV7 1441 aa17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Polr3glQ8R0C0 218 aa17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Baz1aO88379 1555 aa17.78■□□□□ 0.44
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Kif15Q6P9L6 1387 aa17.77■□□□□ 0.44
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Golga3P55937 1487 aa17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Csrnp3P59055 597 aa17.72■□□□□ 0.43
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Myt1Q8CFC2 1127 aa17.71■□□□□ 0.43
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Anp32aO35381 247 aa17.7■□□□□ 0.42
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Hdac5Q9Z2V6 1113 aa17.7■□□□□ 0.42
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Mrs2Q5NCE8 434 aa17.64■□□□□ 0.41
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Rangap1P46061 589 aaKnown RBP17.63■□□□□ 0.41
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Anks4bQ8K3X6 423 aa17.62■□□□□ 0.41
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Rad21Q61550 635 aaKnown RBP17.61■□□□□ 0.41
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Rgl3Q3UYI5 709 aa17.59■□□□□ 0.41
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Kdm5dQ62240 1548 aa17.59■□□□□ 0.41
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 ArxO35085 564 aa17.58■□□□□ 0.41
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Rtl5Q5DTT4 599 aa17.58■□□□□ 0.4
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Clstn2Q9ER65 966 aa17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 14.4 ms