RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025522.10

Pdgfrb-201, Transcript of Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pdgfrb, Length 5,407 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Zeb1Q64318 1117 aa17.34■□□□□ 0.37
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Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Neurod1Q60867 357 aa15.72■□□□□ 0.11
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ubl4bQ9CQ84 188 aa15.69■□□□□ 0.1
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Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 NrdcQ8BHG1 1161 aa15.68■□□□□ 0.1
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Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa15.53■□□□□ 0.08
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm13695A2AK44 830 aa15.49■□□□□ 0.07
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 NeflP08551 543 aa15.48■□□□□ 0.07
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Atp1b4Q99ME6 356 aa15.46■□□□□ 0.07
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Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Plppr3Q7TPB0 716 aa15.35■□□□□ 0.05
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa15.34■□□□□ 0.05
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Safb2Q80YR5 991 aaKnown RBP15.32■□□□□ 0.04
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Tnnt3Q9QZ47 272 aa15.31■□□□□ 0.04
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Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Myt1Q8CFC2 1127 aa15.26■□□□□ 0.03
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Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ccer2J3QPU5 274 aa15.21■□□□□ 0.03
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Nlrp6Q91WS2 869 aa15.21■□□□□ 0.02
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Eif5bQ05D44 1216 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ccdc18Q640L5 1455 aa15.18■□□□□ 0.02
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Kif15Q6P9L6 1387 aa15.18■□□□□ 0.02
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Mier1Q5UAK0 511 aa15.16■□□□□ 0.02
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Baz1aO88379 1555 aa15.15■□□□□ 0.02
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Dcaf1Q80TR8 1506 aa15.15■□□□□ 0.02
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Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 BlmO88700 1416 aa14.98□□□□□ -0.01
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Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Prdm10Q3UTQ7 1184 aa14.96□□□□□ -0.01
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Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Pcgf6Q99NA9 353 aa14.95□□□□□ -0.02
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Setd5Q5XJV7 1441 aa14.94□□□□□ -0.02
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 P3h3Q8CG70 732 aa14.92□□□□□ -0.02
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Chic2Q9D9G3 165 aa14.91□□□□□ -0.02
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa14.9□□□□□ -0.02
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 ClspnQ80YR7 1315 aa14.88□□□□□ -0.03
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Polr3glQ8R0C0 218 aa14.86□□□□□ -0.03
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 4933416C03RikQ3V063 378 aa14.85□□□□□ -0.03
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 4930567H17RikQ3V0K5 233 aa14.84□□□□□ -0.03
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 IqubQ8CDK3 788 aa14.81□□□□□ -0.04
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Eid3Q3V124 375 aa14.8□□□□□ -0.04
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ppp1r18Q8BQ30 594 aa14.8□□□□□ -0.04
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Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Mtus2Q3UHD3 1353 aa14.71□□□□□ -0.05
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