RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)K

tW(CCA)K, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)K, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)KtW(CCA)K YMR321CQ04898 105 aa3.06□□□□□ -1.92
tW(CCA)KtW(CCA)K SVF1Q05515 481 aa3.06□□□□□ -1.92
tW(CCA)KtW(CCA)K SPH1Q06160 661 aa3.06□□□□□ -1.92
tW(CCA)KtW(CCA)K ESF1Q06344 628 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
tW(CCA)KtW(CCA)K TUS1Q06412 1307 aa3.06□□□□□ -1.92
tW(CCA)KtW(CCA)K PHR1P05066 565 aaKnown RBP RIP-Chip data3.05□□□□□ -1.92not detected
tW(CCA)KtW(CCA)K CDC16P09798 840 aa3.05□□□□□ -1.92
tW(CCA)KtW(CCA)K HEM1P09950 548 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
tW(CCA)KtW(CCA)K RPL8AP17076 256 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
tW(CCA)KtW(CCA)K MAK31P23059 88 aa3.05□□□□□ -1.92
tW(CCA)KtW(CCA)K PWP2P25635 923 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
tW(CCA)KtW(CCA)K GPT2P36148 743 aa3.05□□□□□ -1.92
tW(CCA)KtW(CCA)K MSC7P38694 644 aa3.05□□□□□ -1.92
tW(CCA)KtW(CCA)K CIC1P38779 376 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
tW(CCA)KtW(CCA)K CSM2P40465 213 aa3.05□□□□□ -1.92
tW(CCA)KtW(CCA)K KRI1P42846 591 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
tW(CCA)KtW(CCA)K SGM1P47166 707 aa3.05□□□□□ -1.92
tW(CCA)KtW(CCA)K RPS7BP48164 190 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
tW(CCA)KtW(CCA)K UBP15P50101 1230 aa3.05□□□□□ -1.92
tW(CCA)KtW(CCA)K LIF1P53150 421 aa3.05□□□□□ -1.92
tW(CCA)KtW(CCA)K MDM1Q01846 1127 aa3.05□□□□□ -1.92
tW(CCA)KtW(CCA)K FMP30Q02883 468 aa3.05□□□□□ -1.92
tW(CCA)KtW(CCA)K SPN1Q06505 410 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
tW(CCA)KtW(CCA)K SSF2Q12153 453 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
tW(CCA)KtW(CCA)K YDR034W-BQ6Q5X2 51 aa3.05□□□□□ -1.92
tW(CCA)KtW(CCA)K VPS13Q07878 3144 aa3.05□□□□□ -1.92
tW(CCA)KtW(CCA)K STI1P15705 589 aaKnown RBP RIP-Chip data3.04□□□□□ -1.92not detected
tW(CCA)KtW(CCA)K SRP54P20424 541 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
tW(CCA)KtW(CCA)K SEC8P32855 1065 aa3.04□□□□□ -1.92
tW(CCA)KtW(CCA)K DUR3P33413 735 aa3.04□□□□□ -1.92
tW(CCA)KtW(CCA)K AAP1P37898 856 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
tW(CCA)KtW(CCA)K GRS1P38088 690 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
tW(CCA)KtW(CCA)K JHD1P40034 492 aa3.04□□□□□ -1.92
tW(CCA)KtW(CCA)K SAD1P43589 448 aa3.04□□□□□ -1.92
tW(CCA)KtW(CCA)K AZR1P50080 613 aa3.04□□□□□ -1.92
tW(CCA)KtW(CCA)K ASE1P50275 885 aa3.04□□□□□ -1.92
tW(CCA)KtW(CCA)K MYO5Q04439 1219 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
tW(CCA)KtW(CCA)K YLR326WQ06170 240 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
tW(CCA)KtW(CCA)K SMD2Q06217 110 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
tW(CCA)KtW(CCA)K TFC6Q06339 672 aa3.04□□□□□ -1.92
tW(CCA)KtW(CCA)K ISA1Q07821 250 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
tW(CCA)KtW(CCA)K YLL058WQ12198 575 aa3.04□□□□□ -1.92
tW(CCA)KtW(CCA)K ATG11Q12527 1178 aa3.04□□□□□ -1.92
tW(CCA)KtW(CCA)K HCA4P20448 770 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
tW(CCA)KtW(CCA)K CDC48P25694 835 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
tW(CCA)KtW(CCA)K POT1P27796 417 aaKnown RBP RIP-Chip data3.03□□□□□ -1.92not detected
tW(CCA)KtW(CCA)K SKI2P35207 1287 aaKnown RBP RIP-Chip data3.03□□□□□ -1.92not detected
tW(CCA)KtW(CCA)K ORC6P38826 435 aa3.03□□□□□ -1.92
tW(CCA)KtW(CCA)K YHR131CP38835 850 aa3.03□□□□□ -1.92
tW(CCA)KtW(CCA)K CRG1P38892 291 aaRIP-Chip data3.03□□□□□ -1.92not detected
tW(CCA)KtW(CCA)K TVP23P38962 199 aa3.03□□□□□ -1.92
tW(CCA)KtW(CCA)K ALD5P40047 520 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
tW(CCA)KtW(CCA)K TPM2P40414 161 aa3.03□□□□□ -1.92
tW(CCA)KtW(CCA)K VID28P40547 921 aa3.03□□□□□ -1.92
tW(CCA)KtW(CCA)K MCM6P53091 1017 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
tW(CCA)KtW(CCA)K HUL5P53119 910 aa3.03□□□□□ -1.92
tW(CCA)KtW(CCA)K YGL081WP53156 320 aa3.03□□□□□ -1.92
tW(CCA)KtW(CCA)K HXT17P53631 564 aa3.03□□□□□ -1.92
tW(CCA)KtW(CCA)K MSC2Q03455 724 aa3.03□□□□□ -1.92
tW(CCA)KtW(CCA)K EST2Q06163 884 aa3.03□□□□□ -1.92
tW(CCA)KtW(CCA)K GPI13Q07830 1017 aa3.03□□□□□ -1.92
tW(CCA)KtW(CCA)K DSE3Q08729 430 aa3.03□□□□□ -1.92
tW(CCA)KtW(CCA)K LDB19Q12502 818 aa3.03□□□□□ -1.92
tW(CCA)KtW(CCA)K ARP6Q12509 438 aa3.03□□□□□ -1.92
tW(CCA)KtW(CCA)K YOR111WQ99210 232 aa3.03□□□□□ -1.92
tW(CCA)KtW(CCA)K TY1B-AO13527 1196 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
tW(CCA)KtW(CCA)K SES1P07284 462 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
tW(CCA)KtW(CCA)K PEP3P27801 918 aa3.02□□□□□ -1.93
tW(CCA)KtW(CCA)K DID4P36108 232 aa3.02□□□□□ -1.93
tW(CCA)KtW(CCA)K BRN1P38170 754 aa3.02□□□□□ -1.93
tW(CCA)KtW(CCA)K AKR1P39010 764 aa3.02□□□□□ -1.93
tW(CCA)KtW(CCA)K FMP10P40098 244 aa3.02□□□□□ -1.93
tW(CCA)KtW(CCA)K RSC8P43609 557 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
tW(CCA)KtW(CCA)K ALG2P43636 503 aa3.02□□□□□ -1.93
tW(CCA)KtW(CCA)K PSP2P50109 593 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
tW(CCA)KtW(CCA)K FOL2P51601 243 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
tW(CCA)KtW(CCA)K YGR273CP53329 174 aa3.02□□□□□ -1.93
tW(CCA)KtW(CCA)K PTA1Q01329 785 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
tW(CCA)KtW(CCA)K GIS4Q04233 774 aa3.02□□□□□ -1.93
tW(CCA)KtW(CCA)K EMI2Q04409 500 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
tW(CCA)KtW(CCA)K VIP1Q06685 1146 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
tW(CCA)KtW(CCA)K GUD1Q07729 489 aa3.02□□□□□ -1.93
tW(CCA)KtW(CCA)K NCR1Q12200 1170 aa3.02□□□□□ -1.93
tW(CCA)KtW(CCA)K CIT1P00890 479 aa3.01□□□□□ -1.93
tW(CCA)KtW(CCA)K MET6P05694 767 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
tW(CCA)KtW(CCA)K SWI6P09959 803 aa3.01□□□□□ -1.93
tW(CCA)KtW(CCA)K UGA4P32837 571 aa3.01□□□□□ -1.93
tW(CCA)KtW(CCA)K DRE2P36152 348 aa3.01□□□□□ -1.93
tW(CCA)KtW(CCA)K TVP38P36164 337 aa3.01□□□□□ -1.93
tW(CCA)KtW(CCA)K DSF2P38213 736 aa3.01□□□□□ -1.93
tW(CCA)KtW(CCA)K SUL1P38359 859 aa3.01□□□□□ -1.93
tW(CCA)KtW(CCA)K GUA1P38625 525 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
tW(CCA)KtW(CCA)K PES4P39684 611 aa3.01□□□□□ -1.93
tW(CCA)KtW(CCA)K HXT13P39924 564 aa3.01□□□□□ -1.93
tW(CCA)KtW(CCA)K EPL1P43572 832 aa3.01□□□□□ -1.93
tW(CCA)KtW(CCA)K ACF4P47129 309 aa3.01□□□□□ -1.93
tW(CCA)KtW(CCA)K ENT3P47160 408 aa3.01□□□□□ -1.93
tW(CCA)KtW(CCA)K ARP5P53946 755 aa3.01□□□□□ -1.93
tW(CCA)KtW(CCA)K ECM16Q04217 1267 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
tW(CCA)KtW(CCA)K YDR341CQ05506 607 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
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